FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr CNRS Tue, 21 May 2024 07:24:43 +0000 en-US hourly 1 https://wordpress.org/?v=6.5.3 https://i0.wp.com/frenchbic.cnrs.fr/wp-content/uploads/2015/03/frenchbic1-550e9ae9v1_site_icon.png?fit=32%2C32 FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr 32 32 87603316 Assemblée générale 2024 http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/21/assemblee-generale-2024/ Tue, 21 May 2024 07:24:43 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74491

CR_AG_2024
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74491
[Job] Junior Professorship Recruitment (CPJ) 2024, Toulouse: Design, synthesis and development of molecular imaging probes or theranostic tools based on phosphorescent rhenium complexes http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/06/junior-professorship-recruitment-cpj-2024-toulouse-design-synthesis-and-development-of-molecular-imaging-probes-or-theranostic-tools-based-on-phosphorescent-rhenium-complexes/ Mon, 06 May 2024 14:37:49 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74479 Candidatures sont à déposer via Galaxie du 3 mai au 3 juin, et que le concours oral aura lieu vers le 20 juin avec préalablement examen des dossiers le 5 ou 6 juin. Expires on Monday June 3rd, 2024

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Candidatures sont à déposer via Galaxie du 3 mai au 3 juin, et que le concours oral aura lieu vers le 20 juin avec préalablement examen des dossiers le 5 ou 6 juin.

CPJ 32 SPCMIB-2024

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18-month post-doctoral position available in the Chembio team of the Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM) at Sorbonne Université, Paris, France http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/03/18-month-post-doctoral-position-available-in-the-chembio-team-of-the-institut-parisien-de-chimie-moleculaire-ipcm-at-sorbonne-universite-paris-france/ Fri, 03 May 2024 15:35:27 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74476 Expires on Saturday June 15th, 2024

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postdoc-goldspec

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L’équipe Ingénierie de Complexes Métalliques du L2CM à Nancy rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/01/lequipe-ingenierie-de-complexes-metalliques-du-l2cm-a-nancy-rejoint-le-gis-frenchbic/ Wed, 01 May 2024 19:00:29 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74470 Responsable d’équipe : Philippe Pierrat, philippe.pierrat@univ-lorraine.fr Contacts : Mathilde Bouché & Katalin Selmeczi, mathilde.bouche@univ-lorraine.fr, katalin.selmeczi@univ-lorraine.fr Au sein du Laboratoire Lorrain de Chimie Moléculaire (L2CM UMR 7053) de Nancy, l’équipe Ingénierie de Complexes Métalliques (InCoMe) qui regroupe 5 chercheurs permanents, s’intéresse au …

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Responsable d’équipe : Philippe Pierrat, philippe.pierrat@univ-lorraine.fr

Contacts : Mathilde Bouché & Katalin Selmeczi, mathilde.bouche@univ-lorraine.fr, katalin.selmeczi@univ-lorraine.fr

Au sein du Laboratoire Lorrain de Chimie Moléculaire (L2CM UMR 7053) de Nancy, l’équipe Ingénierie de Complexes Métalliques (InCoMe) qui regroupe 5 chercheurs permanents, s’intéresse au développement de complexes bio- et photoactifs à base de métaux abondants et à leurs applications dans les domaines de la conversion d’énergie et de l’interface avec le vivant. En particulier, en alliant synthèse de ligands originaux et études de coordination, nous cherchons à moduler de façon rationnelle les propriétés de la sphère de coordination des complexes afin d’établir des relations structure/propriétés nécessaires à leurs applications. 

Quelques références significatives :

  • M. Bouché, C. Hognon, S. Grandemange, A. Monari, P. C. Gros, Recent advances in iron-complexes as drug candidates for cancer therapy: reactivity, mechanism of action and metabolites, Dalton Trans. 2020, 49, 11451
  • M. Delcroix, A. Reddy Marri, S. Parant, P.C. Gros, M. Bouché, Water-soluble Fe(II) complexes for theranostic application: Synthesis, photoacoustic imaging and photothermal conversion, Eur. J. Inorg. Chem. 2023, 26, 27, e202300138
  • G. Csire, F. Dupire, L. Canabady-Rochelle, K. Selmeczi, L. Stefan, Bio-inspired casein-derived antioxidant peptides exhibiting a dual direct/indirect mode of action, Inorg. Chem. 2022, 61, 1941.
  • G. Csire, L. Canabady-Rochelle, M.-C. Averlant-Petit, K. Selmeczi, L. Stefan, Both metal-chelating and free radical-scavenging synthetic pentapeptides as efficient inhibitors of reactive oxygen species generation, Metallomics, 2020, 12, 1220.
  • F. Mangin, Ch. Collet, V. Jouan-Hureaux, F. Maskali, E. Roeder, J. Pierson, K. Selmeczi, P.-Y. Marie, C. Boura, N. Pellegrini-Moïse, S. Lamandé-Langle, Synthesis of a DOTA-C-glyco bifunctional chelating agent and preliminary in vitro and in vivo study of [68Ga]Ga-DOTA-C-glyco-RGD. RSC Adv. 2021, 11, 7672.
  • C. Cebrián, A. Monari, X. Assfeld, P.C. Gros, S. Haacke, Ultrafast Spectroscopy of Fe(II) Complexes Designed for Solar Energy Conversion: Current Status and Open Questions, ChemPhysChem, 2022, 23(7), e202100659.
  • A. Reddy Marri, E. Marchini, V. Diez Cabanes, R. Argazzi, M. Pastore, S. Caramori, P.C. Gros, Panchromatic light harvesting and record power conversion efficiency for carboxylic/cyanoacrylic Fe(II) NHC co-sensitized FeSSCs, Chem. Sci. 2023, 14, 4288.

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Le groupe “Molécules Biofonctionnelles et Bioactives” du Laboratoire Réactions et Génie des Procédés rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/01/le-groupe-molecules-biofonctionnelles-et-bioactives-du-laboratoire-reactions-et-genie-des-procedes-rejoint-le-gis-frenchbic/ Wed, 01 May 2024 18:54:13 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74465 Laboratoire: Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (UMR CNRS-Université de Lorraine 7274, institut Ingénierie du CNRS) Équipe: BioProMo Contact: Laetitia CANABADY-ROCHELLE Au sein du Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (UMR CNRS-Université de Lorraine 7274, institut Ingénierie du CNRS), le groupe …

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Laboratoire: Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (UMR CNRS-Université de Lorraine 7274, institut Ingénierie du CNRS)

Équipe: BioProMo

Contact: Laetitia CANABADY-ROCHELLE

Au sein du Laboratoire Réactions et Génie des Procédés (UMR CNRS-Université de Lorraine 7274, institut Ingénierie du CNRS), le groupe “Molécules Biofonctionnelles et Bioactives” de l’axe Bioprocédés-Biomolécules s’intéresse plus particulièrement aux peptides complexant les métaux (PCM) lorsqu'ils sont présents dans différentes ressources naturelles. Notre groupe cherche à mettre au point des méthodes de criblage, de séparation et d’identification de peptides complexant les métaux (e.g., Fe 2+ , Cu 2+ , Ni 2+ ) lorsqu’ils sont présents au sein de mélanges complexes appelés hydrolysats peptidiques afin de les valoriser pour différentes applications industrielles (nutrition, santé, cosmétique). Différentes approches de criblage/séparation/identification de PCM sont développées notamment par résonance plasmonique de surface, fluorométrie, spectrophotométrie, analyse différentielle de spectres de masse, IMAC… Un des pistes de recherche cherche à faire de la simulation de séparation de PCM à l’échelle procédés (chromatographie IMAC) à partir de données obtenues à l’échelle moléculaire par RPS.

Pour plus d’informations :
https://laetitia-canabady-rochelle.webnode.fr/
https://lrgp-nancy.cnrs.fr/

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74465
L’équipe ChemSyBio (Chemical and Synthetic Biology) de l’unité MICALIS rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/05/01/lequipe-chemsybio-chemical-and-synthetic-biology-de-lunite-micalis-rejoint-le-gis-frenchbic/ Wed, 01 May 2024 18:42:32 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74461 Responsable de l’équipe : Olivier BERTEAU, Équipe ChemSyBio (Chemical and Synthetic Biology), Unité MICALIS Radical chemistry plays a pivotal role from bacteria to humans. In recent years, a novel group of enzymes called radical SAM enzymes has emerged as the …

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Responsable de l’équipe : Olivier BERTEAU,

Équipe ChemSyBio (Chemical and Synthetic Biology), Unité MICALIS

Radical chemistry plays a pivotal role from bacteria to humans. In recent years, a novel group of enzymes called radical SAM enzymes has emerged as the most versatile radical biocatalysts in living organisms. These metallo-enzymes catalyze chemically difficult reactions using a central radical-based mechanism. Although broadly distributed, the importance of these enzymes has been recognized only recently. They are involved in a myriad of biosynthetic pathways (e.g. antibiotics, cofactors, RiPPs, natural products, post-translational modifications), catalyzing often unprecedented transformations. Our laboratory has conducted pioneer studies in order to decipher the complex mechanisms of these enzymes. By combining a broad range of approaches from analytical chemistry, to biochemistry and structural biology, we aim at discovering novel reactions catalyzed by this emerging super-family of enzymes in physiologically relevant processes such as bacteria-host interactions and within the microbiome.

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Oral and poster presentation prizes awarded during the 2024 FrenchBIC Meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/26/oral-and-poster-presentation-prizes-awarded-during-the-2024-frenchbic-meeting/ Fri, 26 Apr 2024 10:16:20 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74362 Read More

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2024 FrenchBIC Meeting – picture gallery http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/26/2024-frenchbic-meeting-picture-gallery/ Fri, 26 Apr 2024 09:44:09 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74269 See more photos here, and there. If you want your photo to be removed, ask us.

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74269
La photo de groupe 2024 http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/25/la-photo-de-groupe-2024/ Thu, 25 Apr 2024 14:07:27 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74272 Group photo taken during the 2024 FrenchBic annual meeting / French-Japanese Symposium on BioInorganic chemistry

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Group photo taken during the 2024 FrenchBic annual meeting / French-Japanese Symposium on BioInorganic chemistry

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74272
4th FrenchBIC school on methods for studying metals in chemistry-biology: november 4th-8th 2024 in Grenoble http://frenchbic.cnrs.fr/2023/10/23/4th-frenchbic-summer-school-on-methods-for-studying-metals-in-biology-november-8th-11th-2024/ Mon, 23 Oct 2023 08:49:45 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68851 Pre-registrations now closed

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Pre-registrations now closed

Presentation

Cette école thématique CNRS MetBio sera organisée du 4 au 8 novembre 2024 sous l’égide du FrenchBic et conjointement par le LabEx Arcane et l’Institut des Métaux de Biologie de Grenoble (IMBG).

L’école, qui se déroulera en anglais, accueillera 52 jeunes chercheurs/chercheuses (du doctorat aux premières années après le recrutement chercheur·e/ingénieur·e). La formation se déroulera sous forme de cours et des travaux pratiques dédiés aux méthodes d’études des métaux en chimie-biologie. Elle aura pour but d’initier les participants à de nouvelles techniques et de les aider à mieux appréhender les paramètres spectroscopiques, la réactivité ainsi que les propriétés structurales ou électroniques de leurs objets d’étude.

Le petit nombre de participant·e·s permettra d’organiser des TPs en groupes réduits, et de favoriser les interactions avec les enseignant·e·s tout au long du séjour. La participation des plus jeunes chercheurs est favorisée par des tarifs d’inscription privilégiés. Les personnes employées par le CNRS peuvent obtenir de la formation permanente la prise en charge complète de leurs frais.

This CNRS MetBio thematic school will be organized from the 4th to the 8th of November 2024 under the aegis of FrenchBic and jointly with LabEx Arcane and the Institute of Metals in Biology of Grenoble (IMBG).

The school, english speaking, will host 52 young researchers, young assistant professors, engineers and technicians, PhD students and post doctoral researchers. The training will take place in the form of courses and practical works dedicated to the methods of studying metals in chemistry-biology. It will aim to improve the knowledge of the participants to new techniques and to help them for a better understanding of the spectroscopic parameters, reactivity as well as the structural or electronic properties of their objects of study.

The small number of participants will make it possible to organize practical sessions in restricted groups, and to encourage interactions with teachers throughout the week. PhD candidates will benefit from a privileged price to promote the training of young scientists. CNRS employees can obtain full coverage of their costs.

Accomodation and location

Le Chateau de la Commanderie, hotel restaurant spa ***,  will welcome you at the gates of Grenoble. The venue, pleasant and relaxing, is the right place for discussions.
Practicals will take place in the laboratories of CEA, CNRS and UGA.

Public transport from Grenoble train station to the location (35 min):
Take bus C1 direction “Meylan, Maupertuis” > get off at “Docteur Martin” (4 stops) > take the bus C4 at the same stop, direction  “Eybens, Le Verderet” > get off at “Le Bourg” (14 stops) > 4 min walk to Avenue de Bresson.

Bus ticket to buy at the bus station or by SMS: “1H” at 93 123 (1.90€).

Program

Arrival: Monday 4th, welcome between 12.00 and 1.30 pm. 1st lecture at 1.30 pm.
Departure: Friday 8th, after lunch.

Lectures:

Four practicals (half a day each, in small group):

Poster session.

Registration fees
  • CNRS employees 0 € (full coverage of their costs)
  • Non-CNRS PhD student or post-doc 350 €
  • Other public research employees 450 €
  • Private companies 800 € (discount applied for sponsors)

These fees include course, accommodation in twin rooms (single room available with extra fee) and full board from Monday, November the 4th afternoon to Friday, November the 8th at lunch.

Application

PRE-REGISTRATION CLOSED
>> Contact of selected participants by the end of May (from the 30th) <<

Steps of registration:

  1. Pre-register between February 16th and May 10th.
  2. By the end of May, upon selection by the organizing committee, you will receive an email prompting you to finalize your registration through the Azur Colloque application, which requires payment.
    The registration, accomodation and transport are free for CNRS employees. Select “CNRS Agent – cost 0€” on the app.
  3. You may pay by purchase order only if you belong to a French lab. You will be asked the name and email of your financial secretary, who will receive further instructions to proceed with the money transfer.
    NB: CNRS credit cards cannot be used to pay this registration.
    – Foreign participants must pay by credit card. Ensure you have your card details ready to complete the payment process. Your registration will only be confirmed upon receipt of payment.
    – By money transfer, label it with your name and the name of the school (Metbio2024).
  4. Upon successful completion of the payment step, you will receive an email confirming your registration.

CONTACT US at metbio2024@univ-grenoble-alpes.fr

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68851
L’équipe BaT (Structural biochemistry of Bacterial Transporters) de l’I2BC rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/15/lequipe-bat-structural-biochemistry-of-bacterial-transporters-de-li2bc-rejoint-le-gis-frenchbic/ Mon, 15 Apr 2024 11:09:15 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74255 Equipe BaT, responsable: Solange MORERA  Our work allows supplying fundamental basis describing molecular function at atomic level. Our team possesses a strong expertise in structural analysis by crystallography of (i) bacterial, plant, phage and human enzymatic mechanisms, (ii) bacterial transport systems for …

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Equipe BaT, responsable: Solange MORERA 

Our work allows supplying fundamental basis describing molecular function at atomic level. Our team possesses a strong expertise in structural analysis by crystallography of (i) bacterial, plant, phage and human enzymatic mechanisms, (ii) bacterial transport systems for opines, metals, peptides (iii) bacterial and human proteins interacting with DNA such as DNA repair/modification enzymes, transcriptional factors. For short, we are specialized in the study of protein-protein interactions, protein-DNA and protein-ligand interactions, which are at the center of all the biological processes.

Our general goal is to characterize the molecular role of transporters in bacteria using biochemical, structural and biophysics techniques. During 12 years, the team delved into the study of opine transporters from the plant pathogen Agrobacterium focusing on the soluble part denoted Solute Binding Proteins (SBP) of the ABC transporters, as these SBPs played a crucial role in transport specificity. Opine transporters are involved in host-pathogen relationship, nutrient transport and virulence.

The team is exploring complex machineries, such as metal transporters, involving several soluble and membrane proteins. We are studying the two bacterial iron transport systems denoted Fpv from Pseudomonas aeruginosa and Ftr from pathogenic Bordetella, Brucella and Burkholderia bacteria. The aim is to understand how these two transporters work.

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74255
L’équipe « Molécules et Composites pour l’Optique » du Laboratoire de Chimie de Coordination rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/15/lequipe-molecules-et-composites-pour-loptique-du-laboratoire-de-chimie-de-coordination-rejoint-le-gis-frenchbic/ Mon, 15 Apr 2024 11:02:58 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74251 Responsable: Isabelle Malfant L’équipe « Molécules et Composites pour l’Optique » du laboratoire de Chimie de Coordination à Toulouse s’intéresse à la synthèse et la caractérisation de nouveaux complexes de ruthénium à ligand nitrosyle photoactifs. Ces systèmes moléculaires présentent des …

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Responsable: Isabelle Malfant

L’équipe « Molécules et Composites pour l’Optique » du laboratoire de Chimie de Coordination à Toulouse s’intéresse à la synthèse et la caractérisation de nouveaux complexes de ruthénium à ligand nitrosyle photoactifs. Ces systèmes moléculaires présentent des applications potentielles en thérapie photodynamique, notamment comme agents antimicrobiens ayant une activité cicatrisante.
La libération photocontrôlée de monoxyde d’azote est générée par absorption d’un ou deux photons pour répondre aux exigences de la fenêtre thérapeutique (600 – 1300 nm).

Diverses directions de recherche sont développées :
• l’optimisation de la propriété moléculaire
• l’étude théorique de l’origine des propriétés
• la compatibilité des systèmes avec le milieu biologique
• la mise en forme comme nano-objets

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Le Chemical Biology team de l’institut Curie rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/15/la-chemical-biology-team-de-raphael-rodriguez-rejoint-le-gis-frenchbic/ Mon, 15 Apr 2024 10:09:40 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74248 https://institut-curie.org/team/rodriguez Contact: christine.gaillet@curie.fr Cellular and Chemical Biology (UMR3666 / U1143), Institut Curie, 26 rue d’Ulm – 75005 Paris – France CNRS UMR3666 – INSERM U1143 Our laboratory has adopted ‘the small molecule approach’ to biology. We study cell biology at …

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https://institut-curie.org/team/rodriguez

Contact: christine.gaillet@curie.fr

Cellular and Chemical Biology (UMR3666 / U1143), Institut Curie, 26 rue d’Ulm – 75005 Paris – France CNRS UMR3666 – INSERM U1143

Our laboratory has adopted ‘the small molecule approach’ to biology. We study cell biology at the molecular and atomic levels using an integrated approach combining synthetic organic chemistry and molecular biology techniques. We custom design our probes to interrogate cell processes relevant to human diseases. For example, we have established protocols based on click chemistry to fluorescently label small molecules in cells with the view to shed light on their mechanisms of action. This, combined with multi-omics has revealed previously uncharted molecular features in cells that promote the disease-state, while offering opportunities for small molecule intervention. For instance, we have discovered a novel mechanism of metal uptake involving the plasma membrane glycoprotein CD44 and its ligands hyaluronates. We have identified an iron-dependency of the mesenchymal state of cancer cells, which confer a vulnerability of this cell state to ferroptosis. More recently, we have uncovered a previously uncharted role of mitochondrial copper in the regulation of immune cell activation and epithelial-mesenchymal transition of cancer cells. We found that targeting these metals in the disease-state with in-house small molecules confers therapeutic benefits in vivo. Thus, our laboratory exploits universal principles of physical chemistry and knowledge of biology to impact human medicine.

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74248
PhD project on metal ion partitioning into coccolith calcite and applications of metal-functionalized coccoliths. http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/08/phd-project-on-metal-ion-partitioning-into-coccolith-calcite-and-applications-of-metal-functionalized-coccoliths/ Mon, 08 Apr 2024 06:25:42 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74238 Applications are welcomed to join the Molecular and Environmental Microbiology team at the Bioscience and Biotechnology Institute of Aix-Marseille as a PhD student (deadline May 15, 2024). Please see the attached posting for more information. Web: https://www.cite-des-energies.fr/en/home-biam/search/mem/

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Applications are welcomed to join the Molecular and Environmental Microbiology team at the Bioscience and Biotechnology Institute of Aix-Marseille as a PhD student (deadline May 15, 2024). Please see the attached posting for more information.

Web: https://www.cite-des-energies.fr/en/home-biam/search/mem/

PhD_Position_BIAM_MetalCoccoliths
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74238
[Job] PhD proposal Chemistry – Physics: Advanced photonic methods for the operando studies of electro- enzymatic catalysis at the electrodes of H2/O2 bio-fuel cells http://frenchbic.cnrs.fr/2024/04/02/phd-proposal-chemistry-physics-advanced-photonic-methods-for-the-operando-studies-of-electro-enzymatic-catalysis-at-the-electrodes-of-h2-o2-bio-fuel-cells/ Tue, 02 Apr 2024 15:21:17 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74230 Message: PhD position in the group “Bioelectrochemistry, Biointerfaces & Biotechnology” (BIP, Marseille, https://bip.cnrs.fr/groups/bip08/) in collaboration with the Fresnel Institute (Marseille, https://www.fresnel.fr/spip/). Students interested in projects at the interface (bio)chemistry/(bio)physics are welcome! Web: https://bip.cnrs.fr/groups/bip08/ Expires on Sunday June 2nd, 2024

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Message: PhD position in the group “Bioelectrochemistry, Biointerfaces & Biotechnology” (BIP, Marseille, https://bip.cnrs.fr/groups/bip08/) in collaboration with the Fresnel Institute (Marseille, https://www.fresnel.fr/spip/).
Students interested in projects at the interface (bio)chemistry/(bio)physics are welcome!

Web: https://bip.cnrs.fr/groups/bip08/

PhD-Proposal_Marseille_BIP-Fresnel

Expires on Sunday June 2nd, 2024

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FrenchBIC webinars http://frenchbic.cnrs.fr/2021/06/26/frenchbic-webinars/ Sat, 26 Jun 2021 07:00:14 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=39435 The aim of these webinars is to bring the community together around a series of 2 talks of 30+10 minutes, with a frequency of about once every two months. The webinars will be followed by an informal online meeting space. …

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The aim of these webinars is to bring the community together around a series of 2 talks of 30+10 minutes, with a frequency of about once every two months. The webinars will be followed by an informal online meeting space.

The connexion links are sent via the newsletter. So if you want to attend, please subscribe.

Organizers: Vincent Fourmond and Benoît Bertrand

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[Job] M2 internship structural biology 2024/2025 http://frenchbic.cnrs.fr/2024/03/25/m2-internship-structural-biology-2024-2025/ Mon, 25 Mar 2024 15:09:04 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74216 Expires on Saturday May 25th, 2024

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M2 internship_SB

Expires on Saturday May 25th, 2024

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74216
2024 FrenchBIC thesis prize to Andrea Fasano http://frenchbic.cnrs.fr/2024/03/18/2024-frenchbic-thesis-prize-to-andrea-fasano/ Mon, 18 Mar 2024 18:23:32 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74135 Two thesis prizes were awarded in 2024, to Andrea Fasano and Afridi Zamader. During my Ph.D. at the Bioénergétique et Ingénierie des Protéines laboratory (BIP), in Christophe Léger’s team, I studied metallo-enzymes, called hydrogenases, that catalyse the redox reaction of …

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Two thesis prizes were awarded in 2024, to Andrea Fasano and Afridi Zamader.

Andrea Fasano

During my Ph.D. at the Bioénergétique et Ingénierie des Protéines laboratory (BIP), in Christophe Léger’s team, I studied metallo-enzymes, called hydrogenases, that catalyse the redox reaction of hydrogen oxidation and production. Despite the great biodiversity of hydrogenases in Nature, the focus has mainly been on just a few of them, called “standard”. Only recently have new, “atypical” hydrogenases started to be characterised.

My thesis aimed to deepen our knowledge on the hydrogenase’s biodiversity. I have investigated different  “atypical” hydrogenases, using Protein Film Electrochemistry to characterise their catalytic properties, such as directionality (the ability to catalyse the reaction in only one or both directions); reversibility (related to how much thermodynamic driving force is required to catalyse the reaction in either direction); and tolerance to inhibitors, such as O2. An example of the catalytic diversity of [FeFe]-hydrogenases in voltammetry is shown in figure 1.

Two main families of hydrogenases are defined by the metal content of their active sites: [FeFe] and [NiFe]. Enzymes from the same family have the same active site, but may have very different catalytic properties. Comparing different enzymes allowed us to elucidate the role of the protein scaffold in determining the different catalytic properties.

Regarding [FeFe]-Hydrogenases, I have studied three atypical enzymes. In a first project, I have characterised the hydrogenase of Thermoanaerobacter marthranii (Tam HydS), as it is the only hydrogenase giving an irreversible catalytic response (figure 1C). In our first work, we concluded that it is an intrinsic property of this enzyme (it is not a result of electron transfer with the electrode being slow), and we proved that its catalytic cycle is of the same kind as that of standard, reversible [FeFe]-hydrogenases (figure 1A and 1B) (Fasano et al, JACS 2021). Reversibility is a very important property for any catalyst, as it prevents the dissipation of thermodynamic driving energy during catalysis. To elucidate the molecular determinants behind reversible or irreversible responses, we developed a kinetic model that relates the catalytic response to the details of the steps of the catalytic cycle of the enzyme. We fitted this model to the catalytic responses of Tam HydS and of a standard, reversible, hydrogenase. This comparison allowed us to understand which steps of the catalytic cycle determine the reversibility of the catalytic response (Fasano et al, Bioelectrochemistry 2023, Fasano et al, JACS 2024). The following challenge is now to understand which aminoacids affects those steps and how, in order to really tune the reversibility of the enzyme.

Figure 1: The electrochemical diversity of FeFe hydrogenases, illustrated by catalytic voltammograms recorded under conditions of direct electron transfer and using a rotating disc electrode, all under one atm. of H2. A: C. reinardtii HydA1. B: C. acetobutylicum hydrogenase I. C: Thermoanaerobacter mathrani HydS. D: C. pasteurianum hydrogenase II. E: C. beijerinckii hydrogenase (CbA5H), and the C367D variant. F: variants of CbA5H, A561F (green); P386L (blue); L364F (dark red); M382E (orange). G: C. pasteurianum hydrogenase III and M. elsdenii hydrogenase II. H: a variant of C. pasteurianum hydrogenase III (Fasano et al, Chem. Sci 2024).

In a second project I could also work on the only O2 tolerant [FeFe]-hydrogenase known so far, that from Clostridium beijerinckii (CbA5H) (orange trace in figure 1E). We elucidated the kinetic reasons behind the increased tolerance toward O2 induced by the replacement of a residue 18 Å from the active site (Rutz, Das, Fasano et al, ACS catalysis 2022). Intrigued by the similar catalytic response between CbA5H and the third hydrogenase from Clostridium pasteurianum (CpIII) (darkgreen in figure 1G), belonging to a very poorly studied group of [FeFe]-hydrogenases, we have investigated the oxidative inactivation of CpIII and discussed it in terms of O2 protection. Moreover, our results suggest that CpIII and other related hydrogenases are part of a specific subgroup, defined by a particular protein environment close to the active site (Fasano et al, BioRxiv, ACS Cat. 2024 (in press)).

Regarding the family of the [NiFe]-hydrogenases, I have worked on two enzymes that have very similar aminoacidic sequences, yet very different properties in terms of O2-tolerance and directionality. These enzymes are made of two subunits, one contains the active site and the other a chain of FeS clusters for electron transfer. Mutagenesis of single aminoacids proved inconclusive to understand the molecular determinants of these catalytic properties. Therefore, we aimed to first understand the role of each of the two subunits. To achieve this goal we used a completely new strategy: we engineered a catalytically active chimeric complex made of one subunit from each enzyme. Comparing the responses of this chimeric hydrogenase with the WT enzymes allowed us to elucidate which subunit is responsible for each catalytic property (Fasano et al, JACS 2023). The chimeric design of hydrogenases opens many doors to engineer enzymes combining desired properties, such as O2 tolerance and the bias towards a specific direction of the reaction.

Current affiliation: Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, CNRS, Aix Marseille Université, Marseille, France.
Past affiliations:
Master thesis: D. Carbonera and P. Constantini teams, Department of Chemical Science and Department of Biology, respectively; University of Padova.
Bachelor thesis: A. Danielli team, Department of Pharmacy and Biotechnology, University of Bologna.

 

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74135
2024 FrenchBIC thesis prize to Afridi Zamader http://frenchbic.cnrs.fr/2024/03/18/2024-frenchbic-thesis-prize-to-afridi-zamader/ Mon, 18 Mar 2024 18:23:13 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74191 Two thesis prizes were awarded in 2024, to Afridi Zamader and Andrea Fasano. Novel bioinspired and bio hybrid electrode materials for hydrogen production To combat global warming, we must transition to renewable energy sources such as wind and solar power, …

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Two thesis prizes were awarded in 2024, to Afridi Zamader and Andrea Fasano.

Afridi Zamader

Novel bioinspired and bio hybrid electrode materials for hydrogen production

To combat global warming, we must transition to renewable energy sources such as wind and solar power, reducing reliance on carbon-emitting fuels. One promising avenue is storing solar energy as clean hydrogen (H2) from water (H2O) through a process called ‘solar electrolysis’. H2 produced via solar electrolysis is called ‘Green H2’ as the process is free from carbon in principle. However, this process is complex (therefore sluggish) and requires catalysts (i.e., a material that reduces the energy barrier of the reaction and make it faster). Currently, “Green H2” technology is still in its early stages, necessitating further research and development. The eSCALED project, supported by the European Union’s Horizon 2020 initiative, aims to address this challenge by creating a photovoltaic-electrochemical device known as an “artificial leaf” for solar electrolysis. As a part of this project, my thesis focused on developing electrode materials (a conductive material through which electricity enters or leaves an object, substance, or region) in that device to produce H2 from water (Figure 1). The study was accomplished mainly under two research groups i.e. Solhycat and Berggren group under supervision of Dr. Vincent ARTERO and co-supervision of Prof. Gustav BERGGREN from University of Grenoble Alpes and Uppsala University, respectively.

[FeFe] hydrogenase enzymes (the enzyme is the catalyst made by nature) already architected by nature produce H2 from water at excellent rates (~10,000 H2 molecules per enzyme molecule per second) with negligible over potential (extra thermodynamic thrust or force) requirements. Firstly, I studied the [FeFe] hydrogenase enzyme by preparing a semi-synthetic version of it, elucidating the role of its active site and its interaction with surrounding amino acids. This study highlighted the importance of the protein scaffold in facilitating high catalytic activity for H+/H2 conversion (Paper I).

Then, I chose a [FeFe] based active site, inspired from [FeFe] hydrogenase. To make the catalyst applicable in device like condition, it needed to be immobilised on a conductive support (like carbon nanotubes). I redesigned, synthesised and crystallised the catalyst accordingly. The strategy resulted in more than one fold high catalyst loading than previous reports on closely related catalysts with excellent durability. However, the electrocatalytic H2 production activity was moderate in water (Paper II).

Then I took one-step forward and encapsulated the same [FeFe] site inside a set of designed multifunctional polymeric scaffold to emulate an enzyme-like environment. This led to an almost 70 times improvement in catalytic activity than previous system, albeit limited by site degradation. I also studied its environmental footprint (How much CO2 eq. emits per 1 kg of H2 production) by Life Cycle Assessment study (LCA) study. Continuing the optimization process, I replaced the active site with a more robust alternative, resulting in improved durability albeit with slightly reduced activity for H2 production (Paper III, Paper IV).

Overall, my thesis demonstrates the feasibility of developing efficient, biologically inspired catalysts for hydrogen production, marking a significant step towards sustainable energy solutions.

Figure 1. Schematic representation of the envisioned eSCALED device for producing H2 and reduced CO2-based chemicals using solar electrolysis and the proposed cathode materials for H2 production. Copyright: eSCALED project.
Post-doctoral research
• Affiliation : Université Paris Cité (France)
• Years: 2023-present
• Project title: Molecular-based catalytic photoelectrode for selective CO2 reduction
o Supervisor: Prof. Marc ROBERTDoctoral study (European joint doctorate)
• Affiliation: Uppsala University (Sweden) & University of Grenoble Alpes (France)
• Years: 2019-2023
• Project title: Novel bioinspired and biohybrid electrode materials based for hydrogen production
o Supervisors: Dr. Vincent ARTERO (University of Grenoble Alpes) & Prof. Gustav BERGRREN (Uppsala University)Master’s study
• Affiliation: Indian Institute of Technology, Gandhinagar (India)
• Years: 2016-18
• Subject: Chemistry
• Project title: Designing of Bioinspired hydrogen production catalyst Co-Salen and Co- mono oxime complexes
o Supervisor: Prof. Arnab Dutta (Now in Indian Institute of Technology Bombay, India)
Bachelor’s study
• Affiliation: Aligarh Muslim university (India)
• Years: 2013-16
• Subject: Chemistry
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[Job] PhD position on Cu proteins opened at the Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines http://frenchbic.cnrs.fr/2024/02/25/phd-position-on-cu-proteins-opened-at-the-laboratoire-de-bioenergetique-et-ingenierie-des-proteines/ Sun, 25 Feb 2024 19:42:50 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74128 A PhD position is available at the BIP laboratory in the “Biophysics of metalloproteins and dynamic systems” team in Marseille. The project deals with the study of periplasmic copper proteins involved in a yet to be determined bacterial copper resistance …

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A PhD position is available at the BIP laboratory in the “Biophysics of metalloproteins and dynamic systems” team in Marseille. The project deals with the study of periplasmic copper proteins involved in a yet to be determined bacterial copper resistance mechanism. The PhD work is expected to start in the fall of 2024.

CORESME_PhD_2024

Expires on Monday September 30th, 2024

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74128
L’équipe MetalStress du Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2024/02/12/lequipe-metalstress-du-laboratoire-de-physiologie-cellulaire-vegetale-rejoint-le-gis/ Mon, 12 Feb 2024 14:17:54 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=74096 Les plantes et les microalgues vivent dans des environnements où les concentrations en éléments traces métalliques fluctuent. Ces éléments sont soit essentiels à leur croissance, soit non essentiels et toxiques à de faibles concentrations. Pour faire face à ces situations, …

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Les plantes et les microalgues vivent dans des environnements où les concentrations en éléments traces métalliques fluctuent. Ces éléments sont soit essentiels à leur croissance, soit non essentiels et toxiques à de faibles concentrations. Pour faire face à ces situations, les plantes et les algues ont développé des mécanismes sophistiqués pour répondre à la demande de métaux essentiels et pour gérer les effets toxiques des métaux lourds. L’objectif de l’équipe MetalStress du Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale est de décrypter les mécanismes moléculaires qui contrôlent le devenir des métaux lourds dans les plantes/microalgues afin de comprendre comment ces organismes peuvent survivre et s’adapter à des environnements pollués. Ces connaissances constituent la base d’une gestion durable des métaux toxiques dans les écosystèmes pollués et dans la chaîne alimentaire par le biais de la phytoremédiation.

Responsable d’équipe: Stéphane Ravanel,

Contact: Jonathan Przybyla-Toscano

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L’équipe SynPA (Synthèse Pour l’Analyse) de l’Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2024/02/09/lequipe-synpa-synthese-pour-lanalyse-de-linstitut-pluridisciplinaire-hubert-curien-rejoint-le-gis/ Fri, 09 Feb 2024 12:55:40 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74086 Nom équipe : SynPA (Synthèse Pour l’Analyse) de l’Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC, UMR7178) Twitter : @SynpaTeam L’équipe de Synthèse pour l’Analyse (SynPA) s’intéresse à la synthèse de nouvelles molécules, complexes et/ou assemblages supramoléculaires et nanoparticules et à leurs applications. …

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Nom équipe : SynPA (Synthèse Pour l’Analyse) de l’Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC, UMR7178)
Twitter : @SynpaTeam

L’équipe de Synthèse pour l’Analyse (SynPA) s’intéresse à la synthèse de nouvelles molécules, complexes et/ou assemblages supramoléculaires et nanoparticules et à leurs applications. Notre expertise concerne plus particulièrement la détection, l’analyse et l’imagerie médicale. Nos activités s’organisent autour des ligands macrocycliques et leurs complexes et des assemblages supramoléculaires et supra-nanoparticulaires hybrides avec divers axes de recherche :

  • la détection et quantification de (bio)analytes par spectroscopie de luminescence
  • l’imagerie nucléaire : Tomographie à Emission de Positrons et Imagerie par Résonance Magnétique
  • la conversion photonique et en particulier la conversion photonique ascendante

Responsable équipe : Aline Nonat
Contact : Clémence Cheignon

 

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L’équipe MycoMet rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2024/02/09/lequipe-mycomet-rejoint-le-gis/ Fri, 09 Feb 2024 10:38:11 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74082 – Responsable de l’équipe : Hugo Lebrette  – Nom et page web de l’équipe : MycoMet – The Mycoplasma Metalloproteome (au sein du LMGM-CBI, Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires – Centre de Biologie Intégrative de Toulouse) L’équipe MycoMet (The …

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– Responsable de l’équipe : Hugo Lebrette 
– Nom et page web de l’équipe : MycoMet – The Mycoplasma Metalloproteome (au sein du LMGM-CBI, Laboratoire de Microbiologie et Génétique Moléculaires – Centre de Biologie Intégrative de Toulouse)

L’équipe MycoMet (The Mycoplasma Metalloproteome) cherche à caractériser le métalloprotéome essentiel à la survie des mycoplasmes pathogènes et s’intéresse plus particulièrement aux mécanismes d’acquisition et d’utilisation des métaux de transition chez ces bactéries minimalistes. L’équipe développe une approche intégrative et multidisciplinaire combinant notamment biologie structurale, microbiologie, enzymologie, protéomique et bioinformatique.

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L’équipe Radiochimie Humaine et Envirinnementale rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2024/02/09/lequipe-radiochimie-humaine-et-envrionnementale-rejoint-le-gis/ Fri, 09 Feb 2024 10:28:21 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=74078 Université Côte d’Azur, Institut de Chimie de Nice, UMR 7272, Equipe Radiochimie Humaine et Envrionnementale Resp. de l’Equipe : Christophe Den Auwer (fr) Les modes d’interaction et l’impact des radionucléides anthropiques (cycle de l’industrie nucléaire, accidents nucléaires civils, défense, non-prolifération) …

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Université Côte d’Azur, Institut de Chimie de Nice, UMR 7272,

Equipe Radiochimie Humaine et Envrionnementale

Resp. de l’Equipe : Christophe Den Auwer

(fr) Les modes d’interaction et l’impact des radionucléides anthropiques (cycle de l’industrie nucléaire, accidents nucléaires civils, défense, non-prolifération) et des radionucléides naturels (mines d’uranium, co-extraction du thorium) sur l’environnement, les écosystèmes et l’hummain sont des enjeux majeurs de nos sociétés industrialisées et nucléarisées. Mais les mécanismes chimiques et biochimiques qui sous-tendent ces processus de transfert et d’accumulation dans les écosystèmes sont mal définis et mal compris. Pour répondre à ces questions en radiochimie environnementale et en radioécologie, les données de spéciation sont absolument nécessaires. Notre approche consiste à combiner la chimie analytique et la chimie moléculaire pour une description complète des processus de transfert et de bioaccumulation des radionucléides métalliques dans le biotope et la biocénose. Pour ce faire, nous faisons appel aux outils de la chimie des radionucléides, de la biochimie et de la spectroscopie. Ceci a été rendu possible par l’émergence de techniques de spéciation de plus en plus sensibles au niveau moléculaire comme la spectroscopie d’absorption des rayons X et les techniques d’imagerie qui sont au centre de notre palette d’outils spectroscopiques.

(en) The modes of interaction and the impact of anthropogenic radionuclides (cycle of the nuclear industry, civil nuclear accidents, defense, non-proliferation) and natural radionuclides (uranium mining, thorium co-extraction) on the environment, ecosystems and humans are major issues for our industrialized and nuclearized societies. But the chemical and biochemical mechanisms underlying these transfer and accumulation processes in ecosystems are poorly defined and understood. To answer these questions in environmental radiochemistry and radioecology, speciation data are absolutely essential. Our approach is to combine analytical and molecular chemistry for a comprehensive description of transfer and bioaccumulation processes of metallic radionuclides in biotope and biocenosis. To achieve this, we use the tools of radionuclide chemistry, biochemistry and spectroscopy. This has been made possible by the emergence of increasingly sensitive speciation techniques at the molecular level, such as X-ray absorption spectroscopy and imaging techniques, which form the core of our spectroscopic toolbox.

 

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74078
FrenchBic annual meeting / French-Japanese Symposium on BioInorganic chemistry – registration is open http://frenchbic.cnrs.fr/2024/01/16/french-japanese-symposium-on-bioinorganic-chemistry/ Tue, 16 Jan 2024 13:40:15 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=73975 23rd to 26th of April 2024 in Marseille Dear colleagues, We are happy to announce that the French-Japanese Symposium on BioInorganic chemistry Symposium will be held from 23 to 26 April 2024 in Marseille (France). The registration is free for …

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23rd to 26th of April 2024 in Marseille

Dear colleagues,

We are happy to announce that the French-Japanese Symposium on BioInorganic chemistry Symposium will be held from 23 to 26 April 2024 in Marseille (France). The registration is free for members of the French and Japanese academic laboratories.

Sponsors
  • CNRS
  • AMU
  • Fédération de Chimie AMU
  • Institut Microbiologie, Bioénergies et Biotechnologie – IM2B
  • Société Chimique de France – Division chimie de coordination.
  • OrigaLys
  • CHEMLYS
  • Merck
  • GDR Biomim
  • Porphychem
  • Infranalytics
  • ARPE
  • RCS Dalton
  • RCS Chem. Sc.
  • Centrale Méditerranée
Symposium venue

Getting there:

  • from the Airport, there are direct shuttles every 15 minutes from the airport to Marseille Saint Charles train station.

  • from Marseille Saint Charlestrain station, there are metro lines and buses. Map of the RTM transport facilities here.

  • The conference location (Pharo palace) is easily accessible from the Vieux Port (ca. 20 minutes walk). You can also take a bus at the “vieux Port” station (N° 81, 82 or 83). You then have to enter the Pharo Public Garden.

Lectures
Plenary lectures

Marc Fontecave (Coll. de France Paris)

Takashi Hayashi (Osaka Univ.)

Ally Aukauloo (Paris-Saclay)

Koichiro Ishimori (Hokkaido Univ.)

Clotilde Policar (ENS Paris)

Mitsuhiko Shionoya (Tokyo Univ.)

Petra Hellwig (Strasbourg Univ.)

Kazuya Kikuchi (Osaka Univ.)

Stéphane Ménage (Grenoble Alpes Univ.)

Masahito Kodera (Doshisha Univ.)

Keynote lectures

Celia Bonnet (CBM Orléans)

Hiroaki Kitagishi (Doshisha Univ.)

Yasmina Mekmouche (Aix Marseille Univ.)

Hitomi Sawai (Nagasaki Univ.)

Christelle Hureau (LCC Toulouse)

Mio Kondo (Tokyo Inst. Tech.)

Yvain Nicolet (Grenoble Alpes Univ.)

Izumi Yanatori (Kyoto Univ.)

Wadih Ghattas (Paris-Saclay Univ.)

Yoshitsugu Morita (Osaka Met. Univ.)

Pierre Dorlet (Aix Marseille Univ. )

Vincent Lebrun (Strasbourg Univ.)

Detailed program

Tue 23/04

9h00-9h45 : welcoming the participants with a coffee

9h45-10h00 : Introduction, presentation of the FrenchBic

10h00-10h15 : Anna Aldino-Colbachini.

Development of an electrochemical cell to arbitrary control concentrations in a stepwise fashion in Protein Film Electrochemistry.

10h15-10h30 : Alexandre Ciaccafava

Laccase hybrids for investigating electron transfer

10h30-10h45 : Marcello Gennari

Switching ON/OFF the reactivity of thiolate-supported iron(II) complexes with dioxygen

10h45-11h00 : Rébecca Leblay

LPMO-inspired catalysts to oxidize recalcitrant biomass polysaccharides.

11h00-11h15 : Jérémie Ruel

Structural insight into the substrate recognition by the radical SAM oxygenase DarE in darobactin biosynthesis

11h15-11h30 : Leandro Tabares

Using the Noncanonical Metallo-Amino Acid [Cu(II)(2,2′-bipyridin-5-yl)]-alanine as Spin-Label to Study the Structures of Proteins

11h30-11h45 : Juneina Omeiri

Maturation of the [FeFe]-Hydrogenase :Direct Transfer of Complex B from HydG to HydE

11h45-12h00 : Catherine Berthomieux

Determinants of Plutonium(IV) affinity for the EF-hand calcium-binding site

12h00-14h00 : Lunch at the « Victor Café »

14h00-14h15 : Bruno Aliès

Nucleolipids against Alzheimer’s disease

14h15-14h30 : Sébastien Blanchard

NMR insights into the supramolecular interaction between  the polyoxoanion [SiW11O39]8- and amyloid peptides

14h30-14h45 : Axelle Comby

Molecular probes to identify protein-lanthanides interactions

14h45-15h00 : Miquel Huix-Rotlant

Coherent photolysis of carbon monoxide in myoglobin: a quantum dynamics prediction observed by time-resolved serial crystallography

15h00-15h15 : Elise Naudin

Improving the kinetic inertia of the copper-ATCUN complex for 64Cu Positron Emission Tomography applications

15h15-15h30 : Michael Papadakis

Stereochemical tailoring of nickel-based electrocatalyst for hydrogen evolution reaction

15h30-15h45 : Gaspard Toulis

In vitro chemical Fe-S reconstitution experiments in glycine/cysteine-rich proteins from Megavirinae giant viruses

15h45-16h00 : Afridi Zamader (FrenchBic thesis price)

Novel bioinspired and biohybrid electrode materials for hydrogen production

16h00-16h30 : coffee break

16h30-16h45 : Marcel Annereau

Syntheses, structures, CO release properties and biological studies of new neutral Mn(I) tricarbonyl complexes

16h45-17h00 : Alejandro Blanco-Meijas

Understanding the Anticancer Properties of Cu(II) Complexes based on Phen-Histidine ligands

17h00-17h15 : Umberto Contaldo

CueOs multi copper oxidases involved in bacterial copper homeostasis with distinct catalytic properties

17h15-17h30 : Anabella Ivancich

De novo heme catalysts: synthetic alpha-helical coiled-coils with unprecedented Heme&Trp redox cofactors for bioinspired catalysis

17h30-17h45 : Marie Poisson

Dihydrogen bioinspired photoproduction

18h00-19h30 : AG FrenchBic

Wed 24/04

09h00-09h15 : Anna Baiduk

Light-dictated Switch of Cu(I) -O2 Species Reactivity

09h15-09h30 : Gabriel Canard

Perfluoro-alkyl corroles and their metal complexes: synthesis, derivatizations and applications in electro-catalysis

09h30-09h45 : Laura Opdam

AN ARTIFICIAL METALLOENZYME THAT CAN OXIDIZE WATER PHOTOCATALYTICALLY: DESIGN, SYNTHESIS, AND CHARACTERIZATION OF CB5-COSALEN

09h45-10h00 : Ronan Kapetanovic

The Brass Dagger: How macrophages deploy Zinc and Copper as an antibacterial weapon?

10h00-10h15 : Giuliano Sciara

Beyond the coupled distortion model: structural analysis of the single domain, green mononuclear cupredoxin AcoP

10h15-10h30 : Andrea Fasano (FrenchBic thesis price)

Electrochemical investigations of the biodiversity of [FeFe] and [NiFe]-Hydrogenases

10.30-11.00: Coffee

11h00-11h15 : Thimothée Lathion

Functionalized Near-Infrared Emitting LnIII/GaIII Metallacrowns with Red-Shifted Excitation

11h15-11h30 : Catherine Belle

Bio-inspired copper complexes: from homogeneous to heterogeneous catalysis

11h30-11h45 : Clémence Cheignon

Photosensitized lanthanide nanoprobes for immunoassay detection

11h45-12h00 : Ling Peng

Self-assembling supramolecular dendrimers for biomedical imaging

12h00-12h20 : Flash comm

12h20-14h00 : Lunch

14h00-14h10 : Introduction of the French-Japanese symposium

14h10-14h50. Mitsuhiko Shionoya

Nucleic Acid Chemistry Based on Metal-Mediated Base Pairing

14h50-15h10 : Yvain Nicolet

FeFe-hydrogenase active site assembly: the case of the radical SAM maturase HydE

15h10-15h30 : Mio Kondo

Development of Artificial Catalytic Systems Inspired by Natural Photosynthesis

15h30-16h10 : Marc Fontecave.

Sulfur metabolism: more and more iron-sulfur enzymes

16h10-16h40 : coffee break

16h40-17h10 : Clotilde Policar.

Inorganic chemical biology: imaging metal-complexes in cells

17h10-17h30 : Hitomi Sawai

Iron as a nutrient: the molecular and cellular mechanisms of dietary iron absorption in humans

17h30-17h50 : Christelle Hureau.

Cu & Zn binding to full-length and truncated Aβ peptides: impact on ROS formation, peptides self-assembly and counteracting strategy.

Thu 25/04

09h00-09h40 : Stéphane Ménage.

In cristallo catalysis by artificial metalloenzymes : our recent advances for cascade reactions

09h40-10h00 : Yasmina Mekmouche.

Tuning Heterogeneous Chemoenzymatic Hybrids Conformation Toward Optimized Aerobic Oxidation

10h00-10h40 : Kazuya Kikuchi.

Elastic Polymer Coated Nanoparticles with Fast Clearance for 19F MR Imaging

10h40-11h10 : coffee break

11h10-11h50 : Masahito Kodera

Cancer-cell-selective cytotoxicity and DNA double-strand breaks by dicopper complexes

11h50-12h10 : Vincent Lebrun

A new scaffold to design artificial metalloenzymes for heterogeneous catalysis

12h10-12h30 : Yoshitsugu Morita

Copper-protein biohybrid catalysts with chemically modified pyridyl group near the active site for enantioselective reactions

12h30-14h00 : lunch

14h00-14h40 : Ally Aukauloo.

Metallo Porphyrins and Phthalocyanines as Modules for Artificial Photosynthesis

14h40-15h00 : Célia Bonnet

Titre en attente

15h00-15h20 : Izumi Yanatori.

Newly uncovered intercellular communication pathway mediated by ferritin

15h30-16h10 : Koichiro Ishimori.

Unique Heme Binding and Its Functional Significance in Iron Regulatory Proteins

16h10-19h00 : posters and snacks

Fri 26/04

09h00-09h40 : Takashi Hayashi

Artificial Metalloenzymes Using Myoglobins Containing Synthetic Metal Cofactors

09h40-10h00 : Wadih Ghattas.

An artificial metalloprotein with metal-adaptive coordination sites for O2 activation or CO2 insertion

10h00-10h40 : Petra Hellwig.

The diverse reaction mechanism of terminal oxidases, insights from electrochemical, UV-Vis, infrared and Raman studies

10h40-11h00 : coffee break

11h30-11h50 : Hiroaki Kitagishi.

A Fire Gas Antidote System Comprising Synthetic Heme Protein Model Complexes That Works In Vivo

10h00-10h20 : Pierre Dorlet

News about bacterial copper resistance

11h50-12h30 : closure of the symposium, poster and OP prizes

12h30-14h00 : lunch

Register here

Registrations are closed.

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73975
The board of the French Society for Bioinorganic Chemistry expresses its deep concern about the recent French immigration law http://frenchbic.cnrs.fr/2024/01/20/the-board-of-the-french-society-for-bioinorganic-chemistry-expresses-its-deep-concern-about-the-recent-french-immigration-law/ Sat, 20 Jan 2024 10:34:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=73970 The board of the French Society for Bioinorganic Chemistry expresses its deep concern about the recent French immigration law, which runs counter to our country's tradition of hospitality and its historic commitment to individual freedoms. Numerous university presidents have denounced …

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The board of the French Society for Bioinorganic Chemistry expresses its deep concern about the recent French immigration law, which runs counter to our country’s tradition of hospitality and its historic commitment to individual freedoms. Numerous university presidents have denounced this “attack” on “the values of universalism, openness and welcome, the free and fruitful circulation of knowledge, and the spirit of the Enlightenment”, and reiterated that access to knowledge and training “cannot be hindered by such restrictive and unfounded financial considerations”. 

The provisions specifically concerning foreign students (higher enrolment fees, “return” deposit) are in fact part of a policy of discrimination contrary to the practices of French universities, which are based on strict equality between students. These provisions will deprive French laboratories of the energy and intelligence of foreign students. Restricting social benefits for foreign workers and undermining their children’s birthright citizenship will discourage foreign researchers from settling in France. 

Foreign students and researchers make important contributions to the impact of French research worldwide, and promote its reputation.  In the long term, this law can only have a deleterious impact on French research. The creation and sharing of knowledge cannot be restricted by borders. The FrenchBIC board is asking that this law not be promulgated.

Le directoire de la Société française de chimie bioinorganique exprime sa très forte inquiétude en ce qui concerne la loi sur l’immigration, qui contrevient à la tradition hospitalière de notre pays et à son engagement historique en faveur des libertés individuelles. De nombreux dirigeants d’établissements universitaires ont dénoncé dans une tribune cette « attaque » envers « les valeurs de l’universalisme, de l’ouverture et de l’accueil, de la libre et féconde circulation des savoirs, de l’esprit des Lumières », et rappelé que l’accès aux connaissances et à la formation « ne peut être entravé par des considérations financières si restrictives et sans fondement ».

Les dispositions concernant spécifiquement les étudiants étrangers (frais d’inscription majorés, caution “retour”) relèvent en effet d’une politique de discrimination contraire aux pratiques de l’Université française fondée sur l’égalité stricte entre les étudiants. Ces dispositions priveront les laboratoires français de l’énergie et de l’intelligence des étudiants étrangers. Les restrictions de prestations sociales pour les travailleurs étrangers et la remise en cause du droit du sol pour leurs enfants dissuaderont les chercheurs et enseignants-chercheurs étrangers de s’installer en France.

Les étudiants et chercheurs étrangers participent au rayonnement de la recherche française et sont la preuve de son attractivité. A terme, de telles mesures ne peuvent qu’avoir un impact délétère sur la recherche française. La création et le partage du savoir ne peuvent pas s’embarrasser de frontières. Le directoire du FrenchBIC demande que cette loi ne soit pas promulguée.

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73970
[Job] Postdoctoral positions to study redox metalloenzymes that use or produce solar-fuels http://frenchbic.cnrs.fr/2023/06/07/multiple-postdoctoral-positions-to-study-redox-metalloenzymes-in-marseille/ Wed, 07 Jun 2023 13:41:08 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68028 The group «Reaction dynamics of multicenter redox enzymes, electrochemical kinetics» is looking for post-doctoral researchers to study different aspects of the mechanism of redox gas-processing metalloenzymes, namely the CO dehydrogenases, which catalyze the reversible reduction of CO2 to CO at …

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Multiple postdoctoral positions are available at the “Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines” (BIP, UMR 7281) with several sources of funding. The laboratory is located in Joseph Aiguier campus, next to the…
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The group «Reaction dynamics of multicenter redox enzymes, electrochemical kinetics» is looking for post-doctoral researchers to study different aspects of the mechanism of redox gas-processing metalloenzymes, namely the CO dehydrogenases, which catalyze the reversible reduction of CO2 to CO at a unique NiFe active site, and hydrogenases, which catalyze the reversible oxidation of H2 (to protons and electrons), at either a FeFe or NiFe active site (figure). These enzymes are very fast and, for most of them, extremely energy efficient, requiring hardly any additional driving force to catalyze the reaction at high rates.

The technique mostly used in the team is Protein Film Electrochemistry, a kinetic technique in which the redox enzyme is immobilized on the electrode in a configuration which allows direct electron transfer. This configuration allows arbitrary changes in the driving force, and measuring the current makes it possible to follow the activity with great accuracy and a high time resolution. The team has built a reputation on pushing the quantitative analysis of the acquired data as far as possible.

The research will focus on various aspects of the reactivity of the enzymes, such as the transport of substrate/product to/from the active site, the role of the electron transfer chain in tuning the catalysis, proton transfers, and fine details in the second coordination sphere that tune the catalytic properties of the enzymes. For all of the enzymes studied, the team can work on many different isoforms, most of which can be modified by site-directed mutagenesis possible, which makes it possible to lead an extensive study of structure-function relationship.

Candidates

The candidates should hold a PhD in chemistry or biology, have an interest in bioinorganic chemistry and kinetics, and an open mind. Any previous work on redox enzymes (in particular those studied in this project) or electrochemistry is a plus, but not a requirement.

Funding
The group has acquired funding from different sources, concerning several positions for at least 18 months.
To apply, please send a CV and motivation letter to vincent.fourmond@imm.cnrs.fr

Postdoc-Marseille-BIP
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68028
Prix de thèse http://frenchbic.cnrs.fr/2023/10/30/prix-de-these/ Mon, 30 Oct 2023 15:23:23 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=68904 Tous les doctorants ayant soutenu ou soutenant leur thèse entre le 1er janvier 2022 et le 31 décembre 2023 peuvent être candidats au prix de thèse du groupement d’intérêt scientifique. Conditions d’attribution du prix de thèse: les travaux de thèse …

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Tous les doctorants ayant soutenu ou soutenant leur thèse entre le 1er janvier 2022 et le 31 décembre 2023 peuvent être candidats au prix de thèse du groupement d’intérêt scientifique. Conditions d’attribution du prix de thèse: les travaux de thèse doivent avoir été réalisés au sein d’une équipe appartenant au GIS FrenchBIC (liste des équipes membres consultables ici).

Le dossier complet de participation – voir ci-dessous les pièces justificatives à fournir – devra être soumis en utilisant le formulaire ci-dessous, entre le 1er Janvier 2024 et le lundi mercredi 31 janvier 2024 à minuit. Il peut être en français ou en anglais.

Le prix est accompagné d’une gratification de 300€ qui sera remise au(x) lauréat-e(s) lors de la prochaine réunion du GIS FrenchBIC ou lors de la suivante (réunion 2024 ou 2025). Le(s) lauréat-e(s) seront invité-e(s) à présenter leurs travaux lors d’une communication orale et/ou lors de l’un des webinaires organisés régulièrement par le FrenchBIC. Par ailleurs, l’inscription pour la réunion FrenchBIC pendant laquelle la remise du prix aura lieu sera gratuite.

Pièces à joindre

Les candidats doivent envoyer en un seul fichier pdf les pièces suivantes :

  • Cette fiche de candidature complétée et signée
  • Une lettre de justification de la candidature (1 page)
  • Un bref résumé de la thèse (4 pages maximum, figures et références comprises)
  • Un CV (1 page) avec une liste complète de productions scientifiques (publications, communications, brevets, … ; 1 page)
  • Les deux rapports de thèse et le rapport de jury de soutenance

La règle pour nommer les documents envoyés sous forme électronique est la suivante :

NOM prénom – dans un seul fichier .pdf et en respectant l’ordre ci-dessus. 

  • Par ailleurs, les candidats doivent s’assurer de l’envoi avant la date limite de candidature d’une lettre de soutien du ou de la directeur·rice de thèse ou autre personnalité scientifique, directement (sans passer par le·la candidat-e) par mail à christelle.hureau@lcc-toulouse.fr

Les dossiers incomplets ne seront pas pris en compte.

Formulaire de candidature
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68904
[Project supported by FrenchBIC] The catalytic cycles of reversible and irreversible FeFe hydrogenases http://frenchbic.cnrs.fr/2024/01/07/project-supported-by-frenchbic-the-catalytic-cycles-of-reversible-and-irreversible-fefe-hydrogenases/ Sun, 07 Jan 2024 11:00:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68994 During my Ph.D. I studied different homologous FeFe-hydrogenases, enzymes that catalyze the oxidation and evolution of hydrogen. Despite their structural similarity and the identical active site, different hydrogenases exhibit different catalytic properties. I am interested in the understanding of the …

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Illustration : Laurent Eisler (c)

During my Ph.D. I studied different homologous FeFe-hydrogenases, enzymes that catalyze the oxidation and evolution of hydrogen. Despite their structural similarity and the identical active site, different hydrogenases exhibit different catalytic properties. I am interested in the understanding of the molecular determinants of these properties. In this project I focused on “catalytic reversibility”, which is defined in relation to the thermodynamic driving force (overpotential in electrochemistry experiments) that has to be applied for the enzyme to work at a significant rate. Prototypical, or “standard”, hydrogenases (such as HydA1 from Chlamydomonas reinhardtii, Cr HydA1) are reversible catalysts: a small difference between the electrode potential and the equilibrium potential of the H+/H2 couple leads to a significant hydrogen oxidation or proton reduction current. The recently identified sensory hydrogenase (HydS) from Thermoanaerobacter mathranii (Tam HydS) shows an irreversible catalytic response, as it catalyzes the reaction in either direction only if a large overpotential is applied.

The aim of this work is to understand what differ in the catalytic cycles of these two enzymes that determines their different catalytic responses. To do so we performed a kinetic analysis of the catalytic response of the two enzymes in Protein Film Electrochemistry (PFE), and we compared it with the information that are obtained by Fourier Transformed Infrared Spectroscopy (FITR). The latter technique, indeed, informs about the different states of the active site of the hydrogenase under different conditions (like pH and redox potential). 

I spent, therefore, one week at the Laboratory of Energy converting enzymes, in James Birrell group, which has a great expertise in FTIR spectroscopy, specifically applied to hydrogenases.

There, I have performed at equilibrium redox and pH titration on the enzyme HydA1 from Cr. This data allowed us to discriminate between different kinetic models when analyzing the PFE experiments and helped us to further understand the catalytic cycle of the FeFe hydrogenases, and which parameters determines the reversibility of the catalytic response.

I would like to acknowledge the FrenchBIC for the grant and James Birrell for the opportunity to work in his lab. It has been a great week of experiments and scientific discussions that taught a lot.

Andrea Fasano

Publication: “Kinetic modeling of the reversible or irreversible electrochemical responses of FeFe-hydrogenases”, J. Am. Chem. Soc. (2024). doi: 10.1021/jacs.3c10693

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68994
Second Metal-Binding Peptides (MBP) Conference http://frenchbic.cnrs.fr/2023/11/08/second-metal-binding-peptides-mbp-conference/ Wed, 08 Nov 2023 14:55:32 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68980 10-12 July 2024, Toulouse, https://mbp2024.lcc-toulouse.fr/ The main theme of this international conference is peptides and derived molecules and their interactions with metal ions. Several areas of research will be addressed: health, environment, catalysis, supramolecular chemistry Expires on Friday July 12th, …

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10-12 July 2024, Toulouse, https://mbp2024.lcc-toulouse.fr/

The main theme of this international conference is peptides and derived molecules and their interactions with metal ions. Several areas of research will be addressed: health, environment, catalysis, supramolecular chemistry

Expires on Friday July 12th, 2024

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68980
GECOM-CONCOORD 2024 http://frenchbic.cnrs.fr/2023/10/15/gecom-concoord-2024/ Sun, 15 Oct 2023 08:18:05 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68824 19-24 mai 2024, Ax-les-thermes, https://gecom2024.sciencesconf.org/ Expires on Friday May 24th, 2024

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19-24 mai 2024, Ax-les-thermes, https://gecom2024.sciencesconf.org/

Expires on Friday May 24th, 2024

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68824
Online seminars on “Iron-sulfur protein biogenesis” 2023 http://frenchbic.cnrs.fr/2023/09/17/online-seminars-on-iron-sulfur-protein-biogenesis-2023/ Sun, 17 Sep 2023 16:58:51 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=68773

Online.FeS.talks.Program.23
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68773
[Project supported by FrenchBIC] Études mécanistiques de complexes à cuivre bioinspirés par la LPMO http://frenchbic.cnrs.fr/2023/07/25/project-supported-by-frenchbic-etudes-mecanistiques-de-complexes-a-cuivre-bioinspires-par-la-lpmo/ Tue, 25 Jul 2023 08:07:51 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68691 Rébecca Leblay, from the group BiosCiences, iSm2, Marseille spent two weeks in the LCC in Toulouse. This project was supported by FrenchBIC. My PhD aims at studying the activity of LPMO (Lytic Polysaccharide MonoOxygenases) bioinspired synthetic complexes and their potential …

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Rébecca Leblay, from the group BiosCiences, iSm2, Marseille spent two weeks in the LCC in Toulouse. This project was supported by FrenchBIC.

My PhD aims at studying the activity of LPMO (Lytic Polysaccharide MonoOxygenases) bioinspired synthetic complexes and their potential activity to valorize recalcitrant biomass. Besides, in Toulouse, peptide ligands with a structure inspired of the first coordination sphere of the LPMO active site have been synthetized. To compare the nature and mechanism of oxidation by synthetic/peptide complexes, enzymes and free copper salt, the study of Reactive Oxygen Species (ROS) production is a key step.
Methodologies to do so have been set up at the Laboratoire de Chimie de Coordination (LCC, CNRS) in the Alzheimer, amyloids and Bio-Inorganic Chemistry Group. In this context, a collaboration with Dr. Christelle Hureau, thanks to a grant from FrenchBIC, allowed us to compare the peptide and synthetic models with respect to their ability to produce ROS.
During the two weeks spent in Toulouse, we identified some trends for the ROS production and optimized the operating conditions to be appropriate for our systems; we further extended our exchange with the settling of a LPMO-like activity test. This collaboration gave us promising results for further experiments. I am thankful to FrenchBIC for the grant and to Dr. Christelle Hureau and her team, a very welcoming team, in which I learnt a lot!
Rébecca Leblay

  • LPMO-like activity of bioinspired copper complexes: from model substrate to extended polysaccharides,  ChemCatChem (2023)  doi: 10.1002/cctc.202300933
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68691
Assemblée générale 2023 http://frenchbic.cnrs.fr/2023/06/21/assemblee-generale-2023/ Wed, 21 Jun 2023 09:06:58 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=68613

CR_AG_2023-finalisé
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68613
Décès d’Etienne Mulliez http://frenchbic.cnrs.fr/2023/06/13/deces-detienne-mulliez/ Tue, 13 Jun 2023 09:54:08 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=68038 C’est avec une grande tristesse que nous avons appris vendredi 9 juin la disparition d’Etienne Mulliez à l’âge de 73 ans. Etienne avait effectué sa thèse de Doctorat ès Sciences Physiques, option Chimie, à Paris V sur la mise au …

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C’est avec une grande tristesse que nous avons appris vendredi 9 juin la disparition d’Etienne Mulliez à l’âge de 73 ans.

Etienne Mulliez

Etienne avait effectué sa thèse de Doctorat ès Sciences Physiques, option Chimie, à Paris V sur la mise au point de réactions à sélectivité induite par proximité, sous la direction de Jean-Claude Chottard. Après un stage post-doctoral dans le laboratoire du Pr. G. A. Hamilton, Pennsylvania State University, USA, il intègre le CNRS en 1981 comme chargé de recherche au Laboratoire de Chimie de l’Ecole Normale Supérieure puis au Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques, URA 400 CNRS, rue des Saints Pères à Paris où il travailla sur des modèles de lipoxygénases à base de ligands tris et tétra imidazoles. En 1983, il effectue un second stage post-doctoral dans le laboratoire du Pr. A. K. Cho, University of California at Los Angeles, USA.

En 1991, Etienne rejoint l’équipe du LEDSS V, dirigée par M. Fontecave, à Grenoble, puis, en 1997, le polygone scientifique lors de la création du Laboratoire de Chimie et Biochimie des Centres Redox Biologiques, plus tard intégré au sein du Laboratoire de Chimie et Biologie des Métaux. En 1999 il est promu directeur de recherches CNRS.

Durant toute sa carrière, Etienne été un chercheur passionné de chimie bio-inorganique, spécialiste des réactions enzymatiques radicalaires extrêmement complexes. Il a d’abord étudié la ribonucléotide réductase anaérobe d’E. coli, dont il a été un des rares à maîtriser le test d’activité enzymatique in vitro. Il s’est ensuite intéressé aux enzymes fer-soufre de la famille des protéines Radical-SAM impliquées dans la formation de liaisons carbone-soufre. Durant toutes ces années, Etienne a été un pilier du laboratoire via ses projets alliant chimie et biochimie. Pour nous tous, Etienne fut un collègue attentif, d’une culture chimique inestimable et, pour certaines et certains d’entre nous, un mentor et un ami. Nous nous associons à la douleur de sa compagne, Dominique, et de ses filles, Camille, Sophie et Manon.

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68038
[Journal Club] Introduction à la chimie bioinorganique et discussion sur l’égalité homme/femme en sciences, dans la seconde émission de Podchem en compagnie de Clotilde Policar  http://frenchbic.cnrs.fr/2023/05/25/introduction-a-la-chimie-bioinorganique-et-discussion-sur-legalite-homme-femme-en-sciences-dans-la-seconde-emission-de-podchem-en-compagnie-de-clotilde-policar/ Thu, 25 May 2023 08:59:53 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=67332 Dans cet épisode, présenté par Marc Hennebelle, en plus des chroniques de Titouan Chetot et de Maxime Ducreux, nous découvrons le monde passionnant de la chimie bio-inorganique et discutons des questions de parité dans les sciences. Lire aussi: Pourquoi si …

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Dans cet épisode, présenté par Marc Hennebelle, en plus des chroniques de Titouan Chetot et de Maxime Ducreux, nous découvrons le monde passionnant de la chimie bio-inorganique et discutons des questions de parité dans les sciences.

Lire aussi: Pourquoi si peu de femmes dans les carrières scientifiques ? de Clotilde Policar et Charlotte Jacquemot, dans The Conversation.

Sommaire

00:00 Introduction par Marc Hennebelle

02:20 Présentation de Clotilde Policar

24:20 Question à Clotilde Policar

40:25 Métiers de la recherche par Titouan Chetot

47:00 Société & Science : l’égalité en sciences

1:12:05 SCF en Bref par Maxime Ducreux

1:18:45 Fin de vidéo

A noter : voir aussi l’épisode précédent avec Jean-Pierre Sauvage.

N’hésitez pas à vous abonner et partager vos commentaires et vos suggestions pour les prochains épisodes de #PodChem.

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67332
Oral and poster presentation prizes awarded during the 2023 FrenchBIC Meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2023/05/12/oral-and-poster-presentation-prizes-awarded-during-the-2023-frenchbic-meeting/ Fri, 12 May 2023 15:45:42 +0000 https://frenchbic.cnrs.fr/?p=66034 Read More

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66034
2023 FrenchBIC Meeting – picture gallery http://frenchbic.cnrs.fr/2023/05/03/2023-picture-gallery/ Wed, 03 May 2023 12:57:44 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=65963

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65963
La photo de groupe 2023 http://frenchbic.cnrs.fr/2023/05/03/la-photo-de-groupe-2023/ Wed, 03 May 2023 12:47:54 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=65958 Pendant la réunion annuelle à Logonna-Daoulas

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Pendant la réunion annuelle à Logonna-Daoulas

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65958
Stay tuned: follow FrenchBIC on twitter http://frenchbic.cnrs.fr/2023/04/20/stay-tuned-follow-frenchbic-on-twitter/ Thu, 20 Apr 2023 15:50:51 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=65257 You can also follow FrenchBIC on Mastodon.

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65257
L’équipe de RMN des substances biologiques du Laboratoire de Chimie et Biochimie Pharmacologiques et Toxicologiques de Paris rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2023/03/10/lequipe-de-rmn-des-substances-biologiques-du-laboratoire-de-chimie-et-biochimie-pharmacologiques-et-toxicologiques-de-paris-rejoint-le-gis-frenchbic/ Fri, 10 Mar 2023 07:18:09 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=65060 The research group on NMR of Biological Substances develops analytical methods based on Nuclear Magnetic Resonance that we apply to the study of biological systems of major interest. Our research activity covers a wide range of projects ranging from the …

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Nicolas Giraud, Gildas Bertho, Mathieu Baudin, Covadonga Lucas-Torres, Cedric Caradeuc, Karen Dos Santos, Xi Chen.

The research group on NMR of Biological Substances develops analytical methods based on Nuclear Magnetic Resonance that we apply to the study of biological systems of major interest. Our research activity covers a wide range of projects ranging from the study of the interaction of small molecules with proteins, to the metabolomic analysis of biological fluids. These projects are carried out in the frame of several collaborations with laboratories working in the fields of organic and bioinorganic chemistry, structural biology or medical research.

Over the last years, our group has brought several contributions to the field of biomolecular interactions analysis, with a focus on the understanding of dynamic association processes involving lanthanide complexes or other inorganic polyanions such as polyoxometalates (POM) with proteins and peptides, including intrinsically disordered peptides (IDPs).

Contact: Nicolas Giraud

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[Journal Club] X-ray absorption based approach to trap and accumulate a low populated and transient reaction intermediate of the Cu(II) reduction to Cu(I) in the peptide amyloid-β1-16 http://frenchbic.cnrs.fr/2023/03/07/x-ray-absorption-based-approach-to-trap-and-accumulate-a-low-populated-and-transient-reaction-intermediate-of-the-cuii-reduction-to-cui-in-the-peptide-amyloid-beta1-16/ Tue, 07 Mar 2023 08:16:28 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=64490 “Chasing the Elusive “In-Between” State of the Copper-Amyloidβ Complex by X-ray Absorption through Partial Thermal Relaxation after Photoreduction”, published by the group of Peter Faller in Angew Chem Int Ed Engl . 2023 Mar 3;e202217791. doi: 10.1002/anie.202217791 The main redox …

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“Chasing the Elusive “In-Between” State of the Copper-Amyloidβ Complex by X-ray Absorption through Partial Thermal Relaxation after Photoreduction”, published by the group of Peter Faller in Angew Chem Int Ed Engl . 2023 Mar 3;e202217791. doi: 10.1002/anie.202217791

The main redox states of Cu are Cu(I) and Cu(II). A quite particularity of these two redox states is that their coordination chemistry is very different. Cu(II) is soft prefers diagonal, trigonal or tetrahedral coordination, whereas Cu(II) is borderline and square planar with or without axial ligands. This means with flexible ligands the coordination sphere is very different between Cu(I) and Cu(II).

Although this is a feature important in different field, a lot of research activity occurred on the cases of Cu-bound to intrinsically disordered proteins or peptides. The probably best known case is the complex of Cu to the peptide called amyloid-beta. The Cu-amyloid-beta is found in plaques of Alzheimer’s disease (AD) patients. In vitro, Cu-amyloid-beta is quite competent in catalysing the production of reactive radical species (ROS) and it was suggested that this contribute to the oxidative stress observed in AD.

To produce ROS by Cu-amyloid-beta, Cu has to cycle between Cu(I) and Cu(II). Hence, a very sluggish reaction is expected due to the very different coordination sphere (diagonal for Cu(I) and square planar for Cu(II)). To solve this discrepancy, indirect experimental studies and theoretical calculations of a number of groups in the last years, suggested a low populated state (< 1%) , that has an in-between coordination sphere is responsible for the efficient ROS production.

Here, we report a new experimental approach in this context, that allowed us for the first time to directly characterize the Cu coordination sphere of a state between the diagonal Cu(I) and square planar Cu(II). Hence, this gives experimental evidence for a state so far never spectroscopically investigated and supposed to be the state responsible for ROS production.

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Journées Nationales des Carburants Solaires 2023 / GDR Solar Fuels http://frenchbic.cnrs.fr/2023/02/27/journees-nationales-des-carburants-solaires-2023-gdr-solar-fuels/ Mon, 27 Feb 2023 08:37:04 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=64476 du 19 au 21 Juin 2023 à L’Ecole Normale Supérieure de Lyon Chers collègues, C’est avec plaisir que nous vous annonçons les prochaines journées nationales des carburants solaires qui se dérouleront à Lyon du 19 au 21 Juin 2023. Les inscriptions …

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du 19 au 21 Juin 2023 à L’Ecole Normale Supérieure de Lyon

Chers collègues,

C’est avec plaisir que nous vous annonçons les prochaines journées nationales des carburants solaires qui se dérouleront à Lyon du 19 au 21 Juin 2023.

Les inscriptions et les dépôts d’abstract sont maintenant ouverts via le site web suivant.

https://solarfuels.cnrs.fr/evenement/7iemes-journees-des-carburants-solaires/

Il n’y a pas de frais d’inscription mais l’inscription est nécessaire pour assister à ces journées. Le nombre de participants est limité à 100.

La date limite pour les dépôts d’abstract est le 30 Mars. La date limite pour les inscriptions est le 15 Mai.

Nous espérons vous voir nombreux aux 7ièmes journées nationales des carburants solaires !

L’équipe Organisatrice

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2023 FrenchBIC meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2022/11/24/2023-frenchbic-meeting/ Thu, 24 Nov 2022 14:52:57 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=59524 16th – 19th April 2023 Dear colleagues, We have the pleasure of announcing that the next annual FrenchBIC meeting will be held in Logonna-Daoulas near Brest from 16th to 19th April 2023. We look forward to seeing you there, The …

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16th – 19th April 2023

Photo Moreau.henri CC BY-SA 4.0

Dear colleagues,

We have the pleasure of announcing that the next annual FrenchBIC meeting will be held in Logonna-Daoulas near Brest from 16th to 19th April 2023.

We look forward to seeing you there,

The organization committee,
Nicolas

Organization committee
  • Maryline Beyler
  • Lucile Chatelain
  • Bénédicte Douziech
  • Isabelle L’Hostis
  • Noémie Lalaoui
  • Nicolas Le Poul
  • Thibault Troadec
  • Raphaël Tripier
  • Laurianne Wojcik
Program

Plenary speakers:

  • Dr. Myriam Seemann (DR CNRS), Université de Strasbourg
  • Dr. Benoit Colasson (Prof.), Université Paris-Cité
  • Dr. Sébastien Floquet (Prof), Institut Lavoisier Versailles
  • Dr. Yasmina Mekmouche (CR CNRS), Université Aix-Marseille
FrenchBIC 2023 Program
Venue

Date

Sunday 16 April 4.00 pm – Wednesday 19 April 12.00 pm

Place

Centre nautique Moulin-Mer, Logonna-Daoulas, https://www.moulin-mer.fr/

Transport

Bus shuttles to/from the conference center

Sunday 16 April
Bus shuttle #1 will leave Brest train station at 3.00 pm and arrive at the conference center around 3.45 pm.
Bus shuttle #2 will leave Brest train station at 6.50 pm and arrive at the conference center around 7.30 pm.
Bus shuttle #3 will leave Brest airport at 6.50 pm and arrive at the conference center around 7.30 pm.

Please, note that people initially registered for “Bus shuttle #2” from the airport will now be in “Bus shuttle #3”

Wednesday 19 April
Bus shuttle #4 will leave the conference center at 12.00 pm, stop at Brest train station around 12.45 and arrive at Brest airport (arrival at 13.15 approx.).
Bus shuttle #5 will leave the conference center at 12.00 pm, and go directly to Brest train station around 12.45.

Car

Centre Moulin-Mer 29460 Logonna-Daoulas: GoogleMap
Approx. 2h40 from Rennes, 3h00 from Nantes, 6h00 from Paris.

Register

Registration is closed (feb 14th)

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Bilan de la 3ème école FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2022/11/30/bilan-de-la-3eme-ecole-frenchbic/ Wed, 30 Nov 2022 14:06:26 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=60187 Bilan pédagogique 52 participants ont été sélectionnés pour cette école thématique. Il est à noter que nous avons reçu un nombre important de préinscriptions et avons refusé 19 personnes par manque de place (notamment pour les travaux pratiques). Cet engouement …

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Bilan pédagogique

52 participants ont été sélectionnés pour cette école thématique. Il est à noter que nous avons reçu un nombre important de préinscriptions et avons refusé 19 personnes par manque de place (notamment pour les travaux pratiques). Cet engouement est vraisemblablement dû au report d’un an de notre école et à la situation sanitaire en 2020-2021 qui n’a pas permis aux étudiants de participer à d’autres écoles (internationales). 75% des participants provenaient de laboratoires français (Grenoble, Paris, Strasbourg, Toulouse, Marseille, Orsay, Versailles), les 25% restants étant originaires de laboratoires étrangers (Royaume-Uni, Allemagne, Pays-Bas, Suède, Serbie, Mexique, États-Unis). Du fait de la forte composante internationale des participants et des intervenants, tous les cours et travaux pratiques ont été donnés en anglais.

La moyenne d’âge des participants est de 30 ans. Sur les 52 participants, on dénombre : 36 doctorants, 6 postdoctorants, une ingénieur contractuelle (IE), trois ingénieurs en poste (2 IE et 1 IR), 9 chercheurs ou enseignants chercheurs en poste (dont un étranger). 13 intervenants (français et étrangers) ont dispensés les cours théoriques. Ces professeurs venaient d’organismes français (universités, CNRS) et étrangers (Allemagne, Royaume-Uni, Portugal). Les travaux pratiques ont été possibles grâce aux plateaux techniques de certains laboratoires marseillais et à l’implication de nombreux ingénieurs/enseignants-chercheurs/chercheurs de ces laboratoires.

Comme lors des éditions précédentes, l’école s’est tenue entre Carry-le-Rouet et Marseille. Elle a débuté le dimanche 2 octobre 2022 et s’est terminée le 6 octobre 2022 (départ des participants le 7 octobre au matin). L’école a débuté le dimanche après-midi avec une conférence introductive sur les métaux en biologie et un cours de rappel sur la chimie de coordination après le dîner. Les cours théoriques ont été dispensés les lundi et mardi, soit 10 séances d1h30 consacrées aux techniques suivantes : RMN, RPE, électrochimie, absorption X, chimie computationnelle, spectroscopies vibrationnelles, cristallographie des rayons X et AlphaFold, cryo-microscopie électronique, cinétiques rapides, et applications in cell de certaines techniques spectroscopiques. Des travaux pratiques en petits groupes ont complété la formation des participants sur 4 demi-journées (mercredi et jeudi) à Marseille dans certains laboratoires des campus de St Jérôme et de Joseph Aiguier. Parmi les travaux pratiques, trois étaient obligatoires (RPE, RMN et électrochimie) et un à choisir parmi les 3 suivants (Stopped-flow, DFT, cristallographie des protéines et prédiction de structure).

Les participants ont également présenté leurs travaux au cours de deux séances de présentations par affiche (lundi et mardi soir). Trois prix poster (décernés par le FrenchBIC) ont été attribués après vote des participants et des intervenants.

Synthèse de l’évaluation

Afin d’avoir un retour critique des participants et des intervenants, un sondage a été réalisé suite à l’école thématique (76% de taux de participation).

Ci-dessous sont listées les principales conclusions de cette enquête :

  • L’unanimité des personnes ayant répondu ont confirmé que le programme de cette troisième édition était en totale adéquation avec les objectifs de l’école.
  • Le niveau des cours proposés a été jugé excellent (47.5%), très bon (44%) ou bon (8.5%). Quelques commentaires montrent néanmoins que certains participants ont trouvé le niveau de certains cours trop difficile, ce qui était envisageable compte-tenu de la diversité de formation des participants (allant de la chimie à la biologie).
  • Les travaux pratiques en petits groupes (évalués à 97% intéressants et utiles) ressortent comme un point positif de l’école permettant de compléter les notions théoriques vues en cours, de se familiariser avec les équipements et d’interagir plus facilement avec les encadrants.
  • Une très grande majorité des participants (95%) ont profité de l’école pour échanger entre eux et avec les intervenants à propos des cours, mais aussi de leurs projets. Ces moments de discussion ont eu lieu de manière formelle et informelle en fin de chaque cours, pendant les travaux pratiques, les sessions posters mais aussi pendant les pauses et les repas. Certains des participants affirment même que certaines prises de contact avec des spécialistes leur permettront de continuer à échanger et pourraient également se transformer en future collaboration à l’avenir.
  • Le programme a parfois été jugé trop dense compte-tenu du nombre de cours et donc d’informations et de concepts à assimiler et du peu de soirées libres (une seule). Ces participants préconisent de rallonger d’au moins une journée l’école thématique avec une demi-journée de libre ou réservée à des activités sportives ou culturelles. Un rallongement de l’école thématique se ferait au détriment du tarif attractif de notre école thématique à la différence d’autres écoles internationales dans le domaine.
  • Certains participants auraient aimé plus de sessions pratiques ou une alternance session théorique le matin et session pratique l’après-midi. La première solution rallongerait le programme (voir point précédent) et la seconde difficilement envisageable d’un point de vue organisationnel du fait de la multiplicité des sites (Carry-le-Rouet pour la partie théorique et les campus de Saint Jérôme et Joseph Aiguier sur Marseille pour les travaux pratiques).
  • L’unanimité des participants se prononce en faveur de la continuation de cette école thématique.

Aspect scientifiques

Points positifs :

  • La qualité des interventions et la variété des techniques abordées
  • Les travaux pratiques en petits groupes en complément de la formation théorique
  • La mobilisation importante et la disponibilité des intervenants et des encadrants de TPs favorisant ainsi les échanges scientifiques avec les participants.
  • Les sessions posters

Points à améliorer :

  • Mieux définir les pré-requis de l’école. Comme lors des deux éditions précédentes, le choix a été fait de ne pas définir de pré-requis afin de ne pas limiter la participation d’étudiants provenant de plusieurs champs disciplinaires, induisant des différences de niveau.
  • Élargir le programme à d’autres techniques spectroscopiques comme la fluorescence.
  • Augmenter le nombre de sessions posters et rajouter des sessions pratiques. Ce point entraînerait une augmentation de la durée de l’école thématique dont le programme est déjà dense et pourrait poser des problèmes de budget.

Aspects organisationnels

Points positifs :

  • Le site et les infrastructures du Village Club Miléade de Carry-le-Rouet ont permis de rendre cette semaine intense conviviale et propice aux discussions et échanges entre participants et intervenants.
  • La combinaison entre théorie et pratique est un point fort de cette école, la partie pratique étant possible grâce aux infrastructures des laboratoires marseillais et à la forte implication des membres des laboratoires correspondants pour la mise en place et l’animation des TPs correspondants.
  • Le prix attractif (300€ pour quatre jours et demi en pension complète) de cette école est un point essentiel souligné par plusieurs participants et a permis d’attirer des participants venant de laboratoires français (75%) et étrangers (25%). Ceci a été possible grâce à la générosité de nos sponsors institutionnels.

Points à améliorer :

  • Alléger le programme. Ce point se fera au détriment du contenu de l’école thématique (moins de techniques présentées) ou du prix attractif de l’école (journée(s) supplémentaire(s)).
  • Mettre en place des tables rondes en petits groupes avec les intervenants pour discuter des techniques en relation avec des problématiques spécifiques des participants.

Suite envisagée

Au vu du bilan scientifique positif de cette école thématique, le directoire du GIS FrenchBIC souhaite la reconduction de cette école thématique pour une quatrième édition en 2024.

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You can now join FrenchBIC on Mastodon @FrenchBIC@piaille.fr ! http://frenchbic.cnrs.fr/2022/11/21/you-can-now-join-frenchbic-on-mastodon-frenchbicpiaille-fr/ Mon, 21 Nov 2022 09:49:31 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=59515 @FrenchBIC@piaille.fr https://piaille.fr/@FrenchBIC Should I join Mastodon? A scientists’ guide to Twitter’s rival, Nature, 2022 https://www.nature.com/articles/d41586-022-03668-7

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@FrenchBIC@piaille.fr

https://piaille.fr/@FrenchBIC

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[Journal Club] Structure du site à fer dans la protéine d’échafaudage ISCU initiant l’assemblage des clusters fer-soufre http://frenchbic.cnrs.fr/2022/11/18/structure-du-site-a-fer-dans-la-proteine-dechafaudage-iscu-initiant-lassemblage-des-clusters-fer-soufre/ Fri, 18 Nov 2022 07:51:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=59506 Des chercheurs du groupe Biologie Redox et Maladies de l’institut de Biologie Intégrative de la Cellule à Gif-Sur-Yvette, de l’Université de Kaiserslautern en Allemagne, de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles à Gif-Sur-Yvette, du Synchrotron SOLEIL et du laboratoire de …

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Des chercheurs du groupe Biologie Redox et Maladies de l’institut de Biologie Intégrative de la Cellule à Gif-Sur-Yvette, de l’Université de Kaiserslautern en Allemagne, de l’Institut de Chimie des Substances Naturelles à Gif-Sur-Yvette, du Synchrotron SOLEIL et du laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines à Marseille ont déterminé la structure du site de fixation du fer dans la protéine d’échafaudage des clusters fer-soufre en combinant des analyses par spectroscopies CD, Mössbauer, RMN, XAS et RPE. Ces résultats sont publiés dans J. Am. Chem. Soc. (2022), 144, 17496-17515.

Le fer est un cofacteur de nombreuses protéines et enzymes. Il est utilisé sous différentes formes notamment en clusters fer-soufre (Fe-S) qui sont des assemblages d’ions fers et sulfures dont les structures les plus communes sont les clusters [2Fe2S] et [4Fe4S]. Ces clusters sont biosynthétisés via un processus multi-étapes complexe dont le mécanisme est encore mal compris. Les clusters [2Fe2S] sont assemblés sur une protéine d’échafaudage appelée ISCU. Une étude précédente sur la protéine ISCU de souris avait montré par spectroscopies Mössbauer et CD que l’étape initiale de ce processus est l’insertion d’un ion Fe2+ dans le site d’assemblage, caractérisé par la présence de plusieurs résidus cystéine, mais la structure exacte du site restait à déterminer. De plus, des analyses de protéines ISCU provenant d’autres organismes (Thermotoga maritima, Saccharomyces cerevisiae, Drosophila melanogaster and Homo sapiens) avaient montré par spectroscopie d’absorption des rayons X (XAS) que le fer se fixe dans un environnement ne comportant aucun résidu cystéine, uniquement des ligands azotés et oxygénés, suggérant la présence d’un site auxiliaire dans ISCU et un mécanisme de biosynthèse différent selon les espèces.

Les équipes de Benoit D’Autréaux (I2BC, CNRS-CEA-Université Paris-Saclay), Volker Schünemann (Universität Kaiserslautern, Germany), Christina Sizun (ICSN, CNRS, Gif-Sur-Yvette), Emiliano Fonda (Synchrotron SOLEIL, Saint-Aubin) et Bénédicte Burlat (BIP, CNRS Marseille) ont montré que les études XAS précédentes ont été réalisées sur des protéines ISCU agrégées car en absence de métal la protéine ISCU existe sous une forme déstructurée tendant à s’agréger. En travaillant sur les formes monomériques de protéines ISCU de différentes espèces (Escherichia coli, Chaetomium thermophilum, Mus musculus and Homo sapiens), ces équipes ont montré que le fer se fixe dans le site d’assemblage et ils ont obtenu la première structure du site à fer d’une protéine ISCU. Les analyses combinées par spectroscopies CD, Mössbauer, RMN, XAS et RPE ont montré que le fer se fixe sous forme mononucléaire dans un état Fe(II) haut-spin (S=2) via des acides aminés strictement conservés du site d’assemblage: deux cystéines (Cys35, Cys61), un aspartate (Asp37) et une histidine (His103), avec une troisième cystéine (Cys104) à très courte distance qui est le récepteur du soufre. Ils ont de plus montré qu’en absence de l’histidine 103, dans un mutant H103A, la cystéine 104 vient la remplacer, ce qui pourrait être un élément clé du processus d’insertion de soufre dans ISCU.

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L’équipe “Nanomédicaments pour le traitement de maladies graves” de l’Institut Galien rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2022/10/25/lequipe-nanomedicaments-pour-le-traitement-de-maladies-graves-de-linstitut-galien-rejoint-le-gis/ Tue, 25 Oct 2022 11:32:37 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=58905 Anaïs Pitto-Barry est à l’Institut Galien Paris-Saclay (UMR CNRS 8612) dans l’équipe “Nanomédicaments pour le traitement de maladies graves”.  Elle développe des complexes organométalliques, principalement avec du ruthénium, et évalue les propriétés biologiques ou médicinales de ces complexes. Contact: Anaïs …

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Anaïs Pitto-Barry est à l’Institut Galien Paris-Saclay (UMR CNRS 8612) dans l’équipe “Nanomédicaments pour le traitement de maladies graves”.  Elle développe des complexes organométalliques, principalement avec du ruthénium, et évalue les propriétés biologiques ou médicinales de ces complexes.

Contact: Anaïs Pitto-Barry 

Réf :

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3rd Frenchbic summer school – image gallery http://frenchbic.cnrs.fr/2022/10/08/2022-frenchbic-summer-school-image-gallery/ Sat, 08 Oct 2022 14:40:08 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=56880 The participants of the 2022 summer school in Carry le Rouet and Marseille. The poster prizes are awarded to Princess Cabotaje, Tijn van der Velden and Soniya Ahammad.

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The participants of the 2022 summer school in Carry le Rouet and Marseille.

The poster prizes are awarded to Princess Cabotaje, Tijn van der Velden and Soniya Ahammad.

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56880
3rd FrenchBIC summer school on methods for studying metals in biology: october 2nd-7th 2022 http://frenchbic.cnrs.fr/2021/01/25/3rd-frenchbic-summer-school-on-methods-for-studying-metals-in-biology/ Mon, 25 Jan 2021 14:54:37 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=35806 in Carry le Rouet & Marseille.

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in Carry le Rouet & Marseille.




Presentation
Cette école, qui se déroulera en anglais, permettra à quarante jeunes chercheurs/chercheuses (du doctorat aux premières années après le recrutement chercheur·e/ingénieur·e) de se former grâce à des cours et des travaux pratiques aux méthodes d’études des métaux en biologie. Le petit nombre de participant·e·s permettra d’organiser des TPs en groupes de 5, et de favoriser les interactions avec les enseignant·e·s. Les inscriptions seront bon marché (300€) pour favoriser la participation des plus jeunes. Les personnes employées par le CNRS peuvent obtenir de la formation permanente la prise en charge complète de leurs frais. Pour participer à cette école, la première étape consiste à remplir le formulaire ci dessous. Le comité d’organisation sélectionnera les participant·es qui devront ensuite s’inscrire.

This summer school will provide training for young researchers, young assistant professors, engineers and technicians, PhD students and post doctoral researchers. 40 people will attend. This number is small, in order to favour the interactions between the participants and the teachers (who will be staying for the entire duration of the school), and to run practical sessions in 8 groups of 5 participants. The generosity of our sponsors has allowed us to offer low registration fees (which include accommodation, all meals and transportation between Carry le Rouet and Marseille). You are entitled free registration and travel if you are paid by CNRS (irrespective of whether you are permanent researcher, technical staff, PhD student or postdoctoral researcher). To attend, the first step consists in applying using the form below. The organization committee will then select the successful candidates and let them know. In a second step, the selected participants will have to register and pay for this, unless their fees are covered by the CNRS.

Program

Arrival: Sunday 2nd, afternoon (2pm bus from the Saint-Charles train station in Marseille to Carry le Rouet), 1st lecture at 6pm. Departure by bus from Carry to Marseille Saint-Charles on Friday 7th, after breakfast.

Programme_MetBio

Lectures (two days), in Carry le Rouet:

Four practicals (half a day each), in Marseille:

  • NMR, Hélène Launay, Mehdi Yemloul, CNRS, Marseille.
  • EPR, Emilien Etienne, Frédéric Biaso, Sylvain Bertaina, Olivier Pilone, AMU, Marseille.
  • Electrochemistry. Vincent Fourmond & Christophe Léger, CNRS, Marseille.
  • One to choose in this list (the organization committee will try to follow the applicants’ requests)
    • Phylogeny: Frauke Baymann, CNRS, Marseille. The goal is to understand the function of redox enzymes by analyzing their sequences and structures from an evolutionary perspective, recognize building blocks and structural motifs, link specificity and selectivity of catalyzed reactions to the evolutionary history of the enzyme, the parent organism and it’s geochemical environment. The practical may be adapted to the systems that the participants would like to discuss in particular.
    • DFT, Maylis Orio, CNRS/AMU, Marseille. The students will learn how to perform quantum chemical calculations on simple systems relevant to bio-inorganic chemistry (radicals and transitions metal complexes). They will be taught how to optimize a structure and determine its energy minimum. They will be shown how electrons are distributed within the systems and how to translate this information into a molecular orbital diagram. Last but not least, they will be introduced to optical spectroscopy through the theoretical prediction of IR and UV-vis spectra.
    • Stopped flow, Jalila Simaan, CNRS, Marseille. The goal of this practical is to get familiar with a stopped-flow apparatus and see possible applications in the field of bioinorganic chemistry with selected exemples (enzyme kinetics, intermediate trapping, electron transfers). The practical will include both experimental aspects (manipulation of the machine) and data treatment steps.
    • X-Ray crystallography and structure predictions (alphafold), Christophe Decroos, Elsa Garcin, CNRS/AMU, Marseille. The first part of this practical will be focused on informations that can be found in the Protein Data Bank (structure coordinates, density maps, etc…) to gain more insights into critical structure analysis. Students will then run through the initial steps of structure resolution using molecular replacement from data collected at the synchrotron. This will allow students to better understand how a structure model is built from experimental data. Finally, students will use AlphaFold to predict structures of (putative) metalloenzymes / metalloproteins. Examples of structure prediction using AlphaFold may be adapted to enzymes / proteins of personnal interest for the students.

Poster session.

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Clotilde Policar, nouvelle présidente de la SBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2022/09/03/clotilde-policar-nouvelle-presidente-de-la-sbic/ Sat, 03 Sep 2022 07:56:05 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=54911 Élue présidente de la SBIC (Society of Biological Inorganic Chemistry) depuis octobre 2021, Clotilde Policar en prendra officiellement la présidence pour deux ans à partir d’octobre 2022. La société savante bénéficiera du regard interdisciplinaire de cette scientifique très investie dans le …

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Élue présidente de la SBIC (Society of Biological Inorganic Chemistry) depuis octobre 2021, Clotilde Policar en prendra officiellement la présidence pour deux ans à partir d’octobre 2022. La société savante bénéficiera du regard interdisciplinaire de cette scientifique très investie dans le monde de la recherche.

Le communiqué de presse du CNRS

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ICBIC20: 20th International Conference on Biological Inorganic Chemistry, 2023 http://frenchbic.cnrs.fr/2022/08/22/icbic20-20th-international-conference-on-biological-inorganic-chemistry-2023/ Mon, 22 Aug 2022 07:23:25 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=54785 16-21 July 2023, Adelaide convention center, Australia. Come to Adelaide to celebrate ICBIC20 in July 2023 Now that Australia has reopened its borders, we have rescheduled the Twentieth International Conference on Biological Inorganic Chemistry as an onsite event at the …

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16-21 July 2023, Adelaide convention center, Australia.

Come to Adelaide to celebrate ICBIC20 in July 2023

Now that Australia has reopened its borders, we have rescheduled the Twentieth International Conference on Biological Inorganic Chemistry as an onsite event at the Adelaide Convention Centre in Adelaide, Australia in July 2023. We plan to support in person activities with comprehensive virtual options.

The conference will cover all aspects of the molecular roles of metal ions in human health and disease and in the pharmaceutical and imaging sciences, as well as connections to related fields such as environmental and nutrition sciences.

We have assembled both local and national organising committees from the Australian bioinorganic community who will aim to ensure stimulating scientific and social programs.

The conference will be held in parallel with the Royal Australian Chemical Institute’s Inorganic Division National conference in the same location, with all delegates having full alccess to sessions across both conferences.

Beautiful Adelaide is the right place to celebrate our science:-

  • The new Convention Centre sits in the middle of the city, within the parkland associated with the iconic Torrens River.
  • It is part of the Riverbank Biomedical Precinct that includes the universities, research institutes and hospitals.
  • Hotels, restaurants, museums and galleries are within a ten minute walk of the Centre. Budget student accommodation is close by.
  • Adelaide sits in a beautiful hinterland of world famous vineyards, mountains and coastlines. All of Australia’s famous tourist destinations, including the Red Heart and Kakadu are easily accessible.

We look forward to seeing you in 2023!

https://icbic2023.org/

 

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Hydrogenase Lecture Series – Replay http://frenchbic.cnrs.fr/2022/02/09/hydrogenase-lecture-series-online-format/ Wed, 09 Feb 2022 08:10:08 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=46991 March 3rd, March 24th, April 21st, May 26th, Oct 22nd Dear hydrogenase community and metalloenzyme lovers,  We are sorry we won’t be able to meet in person this year for the Hydrogenase Conference in Walla-Walla. However, ‘the show must go …

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March 3rd, March 24th, April 21st, May 26th, Oct 22nd

Dear hydrogenase community and metalloenzyme lovers, 

We are sorry we won’t be able to meet in person this year for the Hydrogenase Conference in Walla-Walla. However, ‘the show must go on’ and it is important to continue sharing science and stimulating discussion among the community. 

Therefore, James Birrell (MPI-CEC, Germany), Sven Stripp (Freie Universität Berlin, Germany), Gustav Berggren (Uppsala University, Sweden) and myself (University of Oxford, UK) came together to organise a Hydrogenase Lecture Series in an online format

We will have one Lecture per month, and it will take place the last Thursday of the month via Zoom at the dates/times indicated below. The format will consist of two back-to-back talks of around 20 min plus 10 min discussion each. Later this month, we will have an exciting talk from a real legend in the field: Prof. Michael W. Adams from University of Georgia. In subsequent months, we will have back to back speakers from a mixture of established PIs, early career researchers and young investigators.

We are delighted to share the terrific programme we have put together for the first three months (February, March and April).

Opening Lecture: Thursday March 3rd – 10:00 (PST)/13:00 (EST)/19:00 (CET) 

Prof. Michael W. Adams (University of Georgia, USA). Title: Structure and function of an electron bifurcating NiFe-hydrogenase.

Second Lecture: Thursday March 31th

Prof. Carole Duboc (Université Grenoble Alpes, France). Title: Bio-inspired NiFe and FeFe catalysts for H2 production: from homogeneous to heterogeneous catalysis

Dr. Sam Cobb (University of Cambridge, UK) . Title: Using enzymes to understand and control the local environment of catalysis

Third Lecture: Thursday April 21st

Prof. R. David Britt (University of California, Davis, USA). Title: ‘Enzymatic synthesis of the organometallic H-cluster of [FeFe] hydrogenase – HydG radical chemistry and the first steps’ 

Prof. Thomas B. Rauchfuss (University of Illinois Urbana-Champaign, USA). Title:  ‘Synthetic complexes in the study of the biosynthesis of [FeFe] hydrogenase’  

Fourth Lecture: Thursday May 26thth. 

Prof. Iftach Yacoby (Tel Aviv University, Israel). “Using hydrogenase to hijack photosynthesis”

Associate Prof. Chris Greening (Monash University, Australia). “An oxygen-insensitive, quinone-transporting hydrogenase enables bacteria to extract energy from air”

June Session: Thursday, 30th June – 10:00 (PST) / 13:00 (EST) / 19:00 (CET) / 18:00 (UK)

Dr. Bonnie Murphy (Max Plank Institute of Biophysics, Frankfurt -Germany-) “Structures of the formate hydrogen lyase (FHL) complex from E. coli”

Prof. Dr. Ingrid Span (Friedrich Alexander University Erlangen-Nürnberg, Erlangen -Germany-). “Structural insights into catalysis of the [FeFe] hydrogenase from Desulfovibrio desulfuricans ”

October 27th.  2022

Speaker 1: Dr. Marius Horch (Freie Universität Berlin, Berlin, Germany).
Title: “Exploring Another Dimension: Experimental and Computational 2D-IR Spectroscopy of Hydrogenases”

Speaker 2: Mr. Andrea Fasano – PhD Candidate (Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines, CNRS, Marseille, France).
Title: “An electrochemical investigation of catalytic (ir)reversibility in
FeFe-Hydrogenases.”

Nov 24th.  2022

Speaker 1: Dr. Alison Parkin (University of York, York, UK).
Title: “Fourier transform voltammetry for ‘seeing’ enzyme electron transfer”

Speaker 2: Ms. Marion Jespersen – PhD Candidate (MPI for Marine Microbiology, Microbial Metabolism group, Bremen, Germany).
Title: “Hydrogenases that fuel carbon-processing in energy limited microorganisms”

To join the Lecture Series, use the Zoom link and details provided below.

Topic: Hydrogenase Seminar Series

Zoom linkhttps://essex-university.zoom.us/j/94537732170?pwd=dFJEd1FMaFBZYmIzVzNQZmFTRnlmZz09

Meeting ID:945 3773 2170

Passcode: H2ase123

Please note that the opening Lecture on Thursday Feb 24th will have a slightly different format. The Hydrogenase Lecture Series and the Hydrogenase Conference organisers will give a short introduction to the event followed by Prof. Michael W. Adams’ opening Lecture! 

Please do feel free to share the link with your lab members and peers! We have tried to include as many people from the hydrogenase community and beyond as possible but in case we have missed someone please spread the word!

Looking forward see many of your at the Opening Lecture!

Best wishes and kind regards,

Patricia, James, Sven and Gustav.

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L’équipe MagenTa, du laboratoire SPCMIB de Toulouse, rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2022/05/24/lequipe-magenta-du-laboratoire-spcmib-de-toulouse-rejoint-le-gis/ Tue, 24 May 2022 11:00:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=53316 Les travaux de recherche du groupe MagenTa (Molecules- or metal-based imaging agents N’ Therapeutics) sont essentiellement axées sur la conception de marqueurs originaux et d’outils d’analyse efficaces pour des applications biomédicales à visée diagnostique et/ou thérapeutique : luminophores à longues …

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Les travaux de recherche du groupe MagenTa (Molecules- or metal-based imaging agents N’ Therapeutics) sont essentiellement axées sur la conception de marqueurs originaux et d’outils d’analyse efficaces pour des applications biomédicales à visée diagnostique et/ou thérapeutique : luminophores à longues durées de vie (europium, terbium, rhénium), radiopharmaceutiques à base de technétium-99m, d’indium-111 ou de rhénium-188, PhotoCORMs (Photochemically CO-Releasing Molecules) à base de rhénium(I).

Contact : Eric Benoist

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11th Barrande-Vltava French-Czech Chemistry Meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2022/05/16/11th-barrande-vltava-french-czech-chemistry-meeting/ Mon, 16 May 2022 10:05:38 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=52110 Dijon, France – 28-30 August 2022 La Section Régionale Bourgogne Franche-Comté de la Société Chimique de France (SCF) et l’Institut de Chimie Moléculaire de l’Université de Bourgogne (UMR 6302) ont le plaisir de vous annoncer l’organisation du 11th Colloque Franco-Tchèque …

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Dijon, France – 28-30 August 2022

La Section Régionale Bourgogne Franche-Comté de la Société Chimique de France (SCF) et l’Institut de Chimie Moléculaire de l’Université de Bourgogne (UMR 6302) ont le plaisir de vous annoncer l’organisation du

11th Colloque Franco-Tchèque Barrande-Vltava en Chimie

11th Barrande-Vltava French-Czech Chemistry Meeting

https://barrande-vltava.sciencesconf.org/

Il se tiendra à Dijon du 28 au 30 août 2022 dans les locaux de l’ESIREM de l’Université de Bourgogne sous les auspices de l’Ambassade de France en République Tchèque.

Le programme inclut 10 conférences plénières (40 min), 10 conférences invitées (25 min) et 18 communications orales (10 min). Tous les participants, y compris les orateurs, auront la possibilité de présenter leurs travaux sous la forme d’une affiche.

Tous les aspects des sciences chimiques seront abordés sans restriction : chimie organique, (bio)inorganique, chimie de coordination, organométallique et catalyse, électrochimie, photochimie, chimie physique et théorique, méthodologie de synthèse notamment de substances naturelles, reconnaissance moléculaire et détection, chimie supramoléculaire, matériaux moléculaires et nanomatériaux, électronique moléculaire et photonique, biochimie et chimie médicinale.

Les inscriptions sont OUVERTES jusqu’au 10 juillet et vous pouvez dès à présent soumettre vos demandes de communications orales/affiches et vos résumés via le site du Congrès.

Au plaisir de vous accueillir à Dijon fin août,

Bien cordialement,

Dr Michel Meyer, Responsable du comité d’organisation

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L’équipe E-POM de l’IPCM rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2022/03/21/lequipe-e-pom-de-lipcm-rejoint-le-gis-frenchbic/ Mon, 21 Mar 2022 14:24:36 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=48827 L’équipe Edifices Polymétalliques (E-POM) de l’institut parisien de chimie moléculaire, dirigée par le Pr. Anna Proust, s’intéresse à des composés moléculaires polymétalliques, et notamment aux polyoxométallates (POMs), et à leurs applications dans divers domaines, de l’énergie au stockage de l’information, …

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L’équipe Edifices Polymétalliques (E-POM) de l’institut parisien de chimie moléculaire, dirigée par le Pr. Anna Proust, s’intéresse à des composés moléculaires polymétalliques, et notamment aux polyoxométallates (POMs), et à leurs applications dans divers domaines, de l’énergie au stockage de l’information, et notamment à l’interface avec le monde du vivant.

Sébastien Blanchard, Anna Proust et Guillaume Izzet

Guillaume Izzet, Sébastien Blanchard et Anna Proust développent un axe “Photosynthèse Artificielle” dans lequel les propriétés redox remarquables des POMs sont mises à profit pour réaliser une photoaccumulation de charge ou servir de médiateurs redox dans des processus de réduction des protons ou du CO2. (collaborations Solhycat , CEA Grenoble & Laboratoire de chimie des processus biologiques, Collège de France)

Sébastien Blanchard étudie, en partenariat avec le Dr. Christelle Hureau (équipe Alambic, LCC Toulouse), l’influence de différents polyanions sur l’agrégation des peptides amyloïdes et l’inhibition de la génération de ROS par les adduits Cu(amyloid).

 Quelques références significatives

  • Keggin-type Polyoxometalates as Cu(II) chelators in the context of Alzheimer’s disease; E. Atrián-Blasco, L. de Cremoux,X. Lin, R. Mitchell-Heggs, L. Sabater, S. Blanchard,* ,C. Hureau*, Chem. Commun. 2022, DOI: 10.1039/d1cc05792h.
  • Tuning Photoinduced Electron Transfer in POM-bodipy Hybrids by Controlling the Environment; Experiment and Theory, G. Toupalas, J. Karlsson, F. A. Black, A. Masip-Sánchez, X. López, Y. Ben M’Barek, S. Blanchard, A. Proust, S. Alves, P. Chabera, I. P. Clark, T. Pullerits, J. M. Poblet,* E. A. Gibson,* G. Izzet* Angew. Chem. Int. Ed. 2021, 60, 6518-6525. DOI: 10.1002/anie.202014677
  • Dye-Sensitized Photocathodes: Boosting Photoelectrochemical Performances with Polyoxometalate Electron Transfer Mediators; Y. Ben M’Barek; T. Rosser, J. Sum, S. Blanchard, F. Volatron, G. Izzet, R. Salles, J. Fize, M. Koepf, M. Chavarot-Kerlidou, V. Artero, A. Proust, ACS Appl. Energy Mater., 2020, 3, 1, 163-169. DOI:10.1021/acsaem.9b02083
  • Electro-assisted Reduction of CO2 to CO and Formaldehyde by the (TOA)6[α-SiW11O39Co(_)] Polyoxometalate; M. Girardi, S. Blanchard, S. Griveau, P. Simon, M. Fontecave, F. Bedioui, A. Proust, Eur. J. Inorg. Chem., 2015, 22, 3642-3648. DOI: 10.1002/ejic.201500389
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Recrues 2021: Alice Balfourier à Paris et Émilie Mathieu à Toulouse http://frenchbic.cnrs.fr/2022/02/08/recrues-2021-alice-balfourier-a-paris-et-emilie-mathieu-a-toulouse/ Tue, 08 Feb 2022 10:34:31 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=46954 Read More

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Assemblée Générale 2021 http://frenchbic.cnrs.fr/2021/10/26/assemblee-generale-2021/ Tue, 26 Oct 2021 08:14:07 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43301 Pendant la réunion annuelle à Obernai. Rappels N’oubliez pas d’inscrire les nouvelles et nouveaux membres de vos labos à notre mailing list, de mettre un lien vers le site du GIS sur le site de votre labo (cela fait partie …

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Pendant la réunion annuelle à Obernai.

Rappels

N’oubliez pas d’inscrire les nouvelles et nouveaux membres de vos labos à notre mailing list, de mettre un lien vers le site du GIS sur le site de votre labo (cela fait partie des conditions de participation au GIS), et de remplir le formulaire contact pour annoncer sur le site vos séminaires, webinaires, offres de jobs, CVs, résultats marquants etc.

Contours du GIS

5 nouvelles équipes ont rejoint le GIS depuis la dernière AG, après validation par le directoire (selon nos modalité d’adhésion): l’équipe ChemBioPharm de l’unité ARNA à Bordeaux  (Bruno Aliès), l’équipe Chirosciences de l’ISM2 / Marseille (Alexandre Martinez), l’équipe Métaux et Organes (Met&Or) du LCBM / Grenoble (Aurélien Deniaud), l’équipe “Bioénergie et environnement” du LCBM / Grenoble (Christine Cavazza), le groupe « Métabolisme de l’hydrogène » du BIP / Marseille (Carole Baffert). La liste à jour compte 60 équipes.

Gouvernance du GIS

L’AG 2020 a décidé des modalité de l’élection d’un·e vice-président·e fin 2020. Christelle Hureau a été élue VP, et deviendra présidente en janvier 2023. Les prochaines élections d’un·e VP auront lieu fin 2024. Le directoire du GIS et le bureau du groupe thématique BIC de la SCF comptent 21 personnes.

Co-financements de missions par le FrenchBIC

Les conditions de co-financement de missions scientifiques sont décrites sur le site. Aucun financement n’a été demandé depuis la pandémie. N’hésitez pas!

Co-financement de congrès

Les modalités de co-financement des congrès sont indiquées sur le site. Les derniers co-financements ont été attribués aux congrès GECOM CONCOORD 2021 et MoTEC 2021.

Réunions annuelles FrenchBIC

La réunion annuelle 2020 (qui devait se tenir à Obernai), qui avait été voulue “franco-allemande”, attendait 113 personnes mais a été annulée quelques semaines avant à cause du 1er confinement. En octobre 2020 a eu lieu sa version en ligne, avec environ 150 personnes, dont certaines de la communauté germanique. 4 prix de communication orales et 3 prix posters ont été remis (3F,4H).

La réunion annuelle 2021 à Obernai a attiré 100 personnes. 4 prix de communication orales et 4 prix posters ont été remis (1F,7H). Cette répartition peu représentative de la répartition H/F lors de cette réunion a interpellé la communauté. Suite à une série d’échanges à ce sujet, le directoire a émis le souhait que, lors des prochaines réunion annuelles, soient mis en place des dispositifs (e.g. sensibilisation des jurés aux biais de genre, établissement de critères communs et pondérés) permettant de minimiser l’impact de ces biais.

Webinaires FrenchBIC

Vincent Fourmond et Benoît Bertrand organisent depuis juin 2021 des webinaires FrenchBIC. Deux exposés de 30 minutes + 10 minutes de questions sur zoom, tous les deux mois environ. La priorité est de donner la parole aux chercheuses et chercheurs en début/milieu de carrière. Les prochains auront lieu le 25/11/2021 et en janvier 2022.

Ecoles METBIO

La troisième édition de l’école thématique METBIO (Méthodes physico-chimiques pour l’étude des métaux en biologie) était initialement prévue du 12 au 16 septembre 2021, mais a été repoussée à cause du manque de visibilité compte-tenu des conditions sanitaires. Elle se tiendra du 2 au 6 octobre 2022 à Carry-le-Rouet. Les contours thématiques et pédagogiques seront dans la continuité des deux précédentes éditions (2017 et 2019): une dizaine de cours (sur 2 jours) seront proposés ainsi que 4 séances de travaux pratiques (sur 2 jours). Cette école co-financée par le CNRS est ouverte aux personnels CNRS, aux doctorants et postdoctorants, ainsi qu’aux autres personnels permanents.

À venir

Plusieurs équipes se sont portées volontaires pour organiser les prochains évènements du FrenchBIC: Nicolas Lepoul pour une réunion annuelle en Bretagne à l’automne 2022; Orsay en 2023, et Orléans en 2024. Strasbourg est volontaire pour l’école METBIO IV en 2024.

SCF

Le GIS est désormais aussi un groupe thématique de la SCF, associé à la division de chimie de coordination (DCC). Gilles Lemercier rappelle que les actions du GIS peuvent être soutenues par la DCC en proportion du nombre de membres de la SCF qui sélectionnent l’entité “groupe thématique FrenchBIC”. Le budget de la DCC dépend lui du nombre de membres qui ont sélectionné la DCC comme division principale.

Ces sélections peuvent être faites au moment de l’adhésion ou a posteriori:
new.societechimiquedefrance.fr/login/
new.societechimiquedefrance.fr/mes-informations/?etape=4

40 membres de la SCF/Division principale Chimie de Coordination sont actuellement associés au Groupe thématique Chimie Bio-Inorganique, ce qui représente 15% des effectifs de la DCC.

Le bureau de la DCC sera renouvelé prochainement. Les prochaines JCC auront lieu du 3 au 4 février 2022 à Lille.

Nous invitons donc les membres du GIS à adhérer à la SCF.

Ne pas hésiter à faire remonter des informations pour la newsletter de la DCC.

Benoît Bertrand envisage de proposer une série de courts articles sur les thématiques BIC qui pourraient être groupées dans un numéro de l’actualité chimique.

SBIC

Clotilde Policar sera présidente de la SBIC de 2022 à 2024, puis “Past-president” de 2024 à 2026.

Prix

  • Eva Jakab Toth a été récompensée par le prix Achille Le Bel de la SCF en 2020
  • Peter Faller a reçu le prix du chercheur confirmé de la SCF/DCC en 2021
  • Wadih Ghattas a reçu la médaille de bronze du CNRS en 2021
  • Gilles Gasser a reçu le prix Pierre Fabre de la French Medicinal Chemistry Society en 2021

ANR

Il est utile de recenser  les projets ANR (financés ou refusés) sur les thématiques BIC, dans tous les CES. Nous refaisons cette démarche en 2021, comme en 2019 et 2020.

EuroBIC 2022

Le congrès aura lieu à Grenoble (17-21 Juillet) et sera un des premiers rendez-vous en présentiel pour les chercheurs du domaine de la Chimie Bio-Inorganique. Clotilde Policar présentera une conférence plénière et d’autres français seront invités à présenter leur travaux lors de keynotes sur la base des propositions du FrenchBIC. A noter que le 22 juillet 2022, un workshop sera organisé à Grenoble autour de la carrière scientifique de Juan Fontecilla.

Autres congrès à venir

N’hésitez pas à compléter la liste des meetings BIC en utilisant le formulaire contact.

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La photo de groupe 2021 http://frenchbic.cnrs.fr/2021/10/18/la-photo-de-groupe-2021/ Mon, 18 Oct 2021 08:32:47 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43274 Pendant la réunion annuelle à Obernai

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Pendant la réunion annuelle à Obernai

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Oral and poster presentation prizes awarded during the 2021 FrenchBIC Meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2021/10/25/oral-and-poster-presentation-prizes-awarded-during-the-20201-frenchbic-meeting/ Mon, 25 Oct 2021 12:57:41 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43294 Read More

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Clotilde Policar new President Elect (2021-2022) of SBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2021/10/10/clotilde-policar-new-president-elect-2021-2022-of-sbic/ Sun, 10 Oct 2021 12:49:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43265 The SBIC has successfully completed the election cycle for 2021. Clotilde Policar (Ecole Normale Supérieure, PSL University, Paris, France) will be the president of the society for the period 2022-2024 and then act as Past-president from 2024 to 2026.

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The SBIC has successfully completed the election cycle for 2021. Clotilde Policar (Ecole Normale Supérieure, PSL University, Paris, France) will be the president of the society for the period 2022-2024 and then act as Past-president from 2024 to 2026.

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Eva Jakab Toth récompensée par le prix Achille Le Bel de la SCF en 2020 http://frenchbic.cnrs.fr/2021/10/04/eva-jakab-toth-recompensee-par-le-prix-achille-le-bel-de-la-scf-en-2020/ Mon, 04 Oct 2021 07:11:07 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43257 Exposé de remise des prix (online) le 5/10, 16h. Remise de Prix

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Exposé de remise des prix (online) le 5/10, 16h.

Remise de Prix

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2021 FrenchBIC meeting http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/22/2021-frenchbic-meeting/ Thu, 22 Oct 2020 07:01:16 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29163 10 – 13 October 2021, Obernai, France From October 10th to 13th 2021 in the VVF Obernai, near Strasbourg. Plenary speakers: Gilles Gasser, Jean-Marc Latour, Sandrine Ollagnier de Choudens and Jalila Simaan. Photos: Manon Pujol.

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10 – 13 October 2021, Obernai, France

From October 10th to 13th 2021 in the VVF Obernai, near Strasbourg.

Plenary speakers:

  • Gilles Gasser,
  • Jean-Marc Latour,
  • Sandrine Ollagnier de Choudens and
  • Jalila Simaan.

Photos: Manon Pujol.

Venue

FrenchBIC 2021 Obernai

dimanche 10 octobre 16h – mercredi 13 octobre à 12h

lieu : VVF La Plaine d’Alsace à Obernai https://www.vvf-villages.fr/villages-vacances/vacances-obernai-vvf-villages.html

Comment venir ?

De l’aéroport d’Entzheim (direct)

Prendre un train « aéroport Entzheim-Obernai gare » (25 min)

aller Dimanche 10 départ Entzheim: 9h.10h59.13h.15h.17h.19h

retour Mercredi 13/10: départ Obernai : 11h40.12h08.12h43.13h16.13h47.14h08.14h45.16h10.16h38.17h30

Des navettes bus seront mises en place entre la gare d’Obernai et le VVF.

De l’aéroport d’Entzheim (via Strasbourg)

– Prendre un train « aéroport Entzheim – Strasbourg gare »

accès train « aéroport Entzheim – Strasbourg gare »:

https://www.strasbourg.aeroport.fr/FR/Passagers/Acces/Navette-train.html

horaires complets de la navette aéroport Entzheim/gare de Strasbourg:

Click to access A18%20Strasbourg%20Molsheim%20%28du%205%20juillet%20au%2011%20d%C3%A9cembre%202021%29_tcm75-287464_tcm75-287505.pdf

– A Strasbourg, changer pour un TER Strasbourg – Obernai

Horaires TER Strasbourg -Obernai : direct environ 30 minutes

Dimanche 10/10 : départ Strasbourg :

12h50.14h51.16h50.18h50 (attention dernier horaire de la journée)

Mercredi 13/10: départ Obernai :

11h40.12h08.12h43.13h16.13h47.14h08.14h45.16h10.16h38.17h12

– Des navettes bus seront mises en place entre la gare d’Obernai et le VVF.

De la gare de Strasbourg

A Strasbourg, prendre TER Strasbourg – Obernai

Horaires TER Strasbourg -Obernai : direct environ 30 minutes

Dimanche 10/10 : départ Strasbourg :

12h50.14h51.16h50.18h50 (attention dernier horaire de la journée)

Mercredi 13/10: départ Obernai :

11h40.12h08.12h43.13h16.13h47.14h08.14h45.16h10.16h38.17h12

Des navettes bus seront mises en place entre la gare d’Obernai et le VVF.

Informations pratiques

Navettes Obernai gare – VVF : les horaires vous seront communiqués ultérieurement.

Sinon et si vous voyagez TRES léger : 25 min à pied, 1,9km (globalement plat selon Google Maps)

En voiture

GPS

VVF La Plaine d’Alsace à Obernai

2, rue de Berlin

67210 Obernai

https://g.page/vvfobernai?share

Register

Please pre-register through the plateform Azur-Colloque, ideally before may 31st at the event “FRENCHBIC 2021” https://www.azur-colloque.fr/DR10/inscription/preinscription/58/fr

Once pre-registered, you will be contacted to know if you wish to apply for a communication (oral or poster).

Registration fees are 252 € (210 HT) and 300 € (250 HT) for non-permanent (PhD, Postdoc) and permanent staff (Assistant professor, Professor, Researcher), respectively.

For any question/problem with the registration, please contact Vincent Lebrun (vlebrun@unistra.fr).

NB : FrenchBIC meetings are the occasion to promote young researchers work, therefore, many time slots will be dedicated to PhD students and Postdocs.

Abstract submission

(PDF ONLY). Use this template, make a pdf decrease its size by using e.g. https://smallpdf.com/compress-pdf

[contact-form-7]
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29163
Online seminars on “Iron-sulfur protein biogenesis” 2021/2022 http://frenchbic.cnrs.fr/2021/09/23/online-seminars-on-iron-sulfur-protein-biogenesis-2021-2022/ Thu, 23 Sep 2021 07:49:40 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=43156 Organizers: Roland Lill, Philipps-Universität Marburg; Frederic Barras, Institute Pasteur, Caryn Outten, USC Caroline Philpott, NIH Time: Paris Thursdays at 5 pm (CET; Paris), 11 am (EST; Boston), 8 am (PST; Los Angeles). Format:  Two speakers per date; each with a …

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Organizers: Roland Lill, Philipps-Universität Marburg; Frederic Barras, Institute Pasteur, Caryn Outten, USC Caroline Philpott, NIH
Time: Paris Thursdays at 5 pm (CET; Paris), 11 am (EST; Boston), 8 am (PST; Los Angeles).
Format:  Two speakers per date; each with a 30 min talk + 10 min discussion.

Online.FeS.talks.Program.21-2f
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43156
[Journal Club] Structure d’une nouvelle famille de réductases impliquées dans l’assimilation du fer par les sidérophores chez les bactéries. http://frenchbic.cnrs.fr/2021/09/01/structure-dune-nouvelle-famille-de-reductases-impliquees-dans-lassimilation-du-fer-par-les-siderophores-chez-les-bacteries/ Wed, 01 Sep 2021 14:55:35 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=40221 Des chercheurs du groupe Métaux et Microorganismes : Biologie, Chimie et applications Métalloprotéines de L’Université de Strasbourg, et de l’University of Hamburg ont déterminé la structure cristalline d’une nouvelle famille de réductases membranaires. Ces résultats sont publiés dans Proc Natl …

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Des chercheurs du groupe Métaux et Microorganismes : Biologie, Chimie et applications Métalloprotéines de L’Université de Strasbourg, et de l’University of Hamburg ont déterminé la structure cristalline d’une nouvelle famille de réductases membranaires. Ces résultats sont publiés dans Proc Natl Acad Sci U S A, 2021,  doi: 10.1073/pnas.2101952118.

Le fer est un cofacteur de nombreuses enzymes et donc un nutriment essentiel pour la croissance bactérienne. Pour accéder au fer, la plupart des bactéries produisent des siderophores, qui sont des composés de faible masse moléculaire caractérisés par une très grande affinité pour les ions ferriques. P. aeruginosa, un pathogène opportuniste, peut exprimer au moins 15 voies d’absorption du fer différentes : (i) une voie d’absorption du fer ferreux, (ii) trois voies d’acquisition d’hème, (iii) des voies d’absorption du fer ferrique par les deux siderophores produit par le pathogène (pyoverdine et pyochéline) et (iv) au moins 10 stratégies différentes pour l’absorption de fer ferrique par des sidérophores produits par d’autres microorganismes. P. aeruginosa utilise la norcardamine (ferrioxamine E) produit par Streptomyces comme sidérophore. L’import de ferri-nocardiamine dans les cellules de P. aeruginosa implique au niveau de la membrane externe un transporteur spécifique FoxA, et une dissociation de fer du sidérophore dans le périplasme bactérien via un mécanisme de réduction du fer par FoxB, une enzyme appartenant à une nouvelle famille d’oxydo-réductases membranaires. Les équipes d’Isabelle Schalk (UMR7242, Université de Strasbourg) et de Henning Tidow (University of Hamburg), ont résolu la structure de FoxB, première structure d’une enzyme de cette famille de réductases. Cette structure présente un nouveau fold et implique deux molécules d’héme et deux tryptophanes pour le transport d’électrons vers le sidérophore. La réduction du Fe(III) en Fe(II) abaisse la stabilité thermodynamique du complexe sidérophore-fer, ce qui faciliterait sa dissociation par un échange de protons ou une chélation compétitive du fer. Des enzymes similaires semblent être impliqués également dans l’acquisition du fer via les siderophores pyoverdine et pyochelin.

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40221
Peter Faller reçoit le prix du chercheur confirmé de la division de chimie de coordination de la SCF http://frenchbic.cnrs.fr/2021/06/21/peter-faller-recoit-le-prix-du-chercheur-confirme-de-la-division-de-chimie-de-coordination-de-la-scf/ Mon, 21 Jun 2021 07:00:11 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=39486

Bio_Faller
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39486
L’équipe ChemBioPharm de l’unité ARNA à Bordeaux rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2021/06/17/lequipe-chembiopharm-de-lunite-arna-a-bordeaux-rejoint-le-gis/ Thu, 17 Jun 2021 13:36:02 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=39472 L’équipe ChemBioPharm de l’unité ARNA s’intéresse aux nucléolipides (hybride entre acides nucléiques et phophoslipides). Du fait de leurs nature amphiphile, ces molécules s’auto-assemblent en structures variés et trouvent de nombreuses applications, notamment dans le domaine de la santé. Un des …

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L’équipe ChemBioPharm de l’unité ARNA s’intéresse aux nucléolipides (hybride entre acides nucléiques et phophoslipides). Du fait de leurs nature amphiphile, ces molécules s’auto-assemblent en structures variés et trouvent de nombreuses applications, notamment dans le domaine de la santé. Un des axes développés dans cette équipe par Bruno Aliès et Philippe Barthélémy s’intéresse aux interactions entre nucleolipides et ions en vue de diverses applications (détection, décontamination, thérapeutique…).

Références

  • Alies et al., Anal. Chem., 2019, 91, 3, 1692–1695
  • Alies et al., Org. Biomol. Chem., 2018, 16, 4888-4894
  • Barthélémy et al., New J. Chem., 2014, 38, 5240-5246
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39472
[Journal Club] Un intermédiaire de maturation de l’hydrogénase à Fer observé par cristallographie. http://frenchbic.cnrs.fr/2021/06/03/un-intermediaire-de-maturation-de-lhydrogenase-a-fer-observe-par-cristallographie/ Thu, 03 Jun 2021 15:32:22 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=38831 Des chercheurs du groupe Métalloprotéines de l’institut de biologie structurale à Grenoble, de l’université UCDavis et de l’Illinois, aux États Unis, ont déterminé la structure cristalline d’un intermédiaire de maturation de l’hydrogénase à Fer. Les hydrogénases à [FeFe] sont des …

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Des chercheurs du groupe Métalloprotéines de l’institut de biologie structurale à Grenoble, de l’université UCDavis et de l’Illinois, aux États Unis, ont déterminé la structure cristalline d’un intermédiaire de maturation de l’hydrogénase à Fer.

Les hydrogénases à [FeFe] sont des métalloenzymes qui utilisent un cofacteur organométallique appelé H-cluster pour catalyser la réaction réversible d’oxydation de l’hydrogène moléculaire. Ce H-cluster est constitué d’un centre [4Fe-4S] lié à un centre binucléaire de fer [2Fe]H via un résidu de cystéine. Ce centre binucléaire [2Fe]H comporte donc deux atomes de fer, chacun lié à une molécule de monoxyde de carbone et un ion cyanure. Les deux métaux sont, par ailleurs, liés entre eux par une molécule d’azadithiométhyl pontante ainsi qu’une molécule de monoxyde de carbone additionnelle. Ce H-cluster est enfoui au cœur de la matrice protéique et différents canaux (centres [FeS], relais de liaisons hydrogènes et canal hydrophobe), permettent de le connecter à la surface pour le transit des électron, protons et molécules d’hydrogène. L’association de ce complexe à la matrice protéique permet donc le fonctionnement d’un catalyseur extrêmement efficace. Cependant, la production et l’insertion de ce H-cluster au sein de l’hydrogénase ne se fait pas spontanément et nécessite l’intervention d’une machinerie multiprotéique dont le rôle reste encore peu compris.

Le centre [4Fe-4S] est produit par la machinerie générique d’assemblage des centres [FeS]. Le centre [2Fe]H, lui nécessite l’intervention de la machinerie Hyd qui est composée d’au moins trois métalloprotéines indispensables, HydE, HyF et HydG. HydF possède une activité GTPase et correspond vraisemblablement à la protéine échafaudage sur laquelle le centre [2Fe]H est construit. Les protéines HydG et HydE appartiennent à la vaste famille des protéines radicalaires SAM dépendantes. HydG utilise la L-tyrosine pour produire les ligands cyanure et monoxyde de carbone via la production d’un composé organométallique intermédiaire L-cysteine-Fe(CO)2(CN) appelé complexe-B. Ce dernier est alors utilisé comme substrat par HydE. L’atome de fer, les ligands cyanure et monoxyde de carbone ainsi que l’atome de soufre de la L-cystéine constituent le centre [2Fe]H.

Lors de cette étude regroupant des chercheurs du groupe Métalloprotéines de l’institut de biologie structurale à Grenoble, de l’université UCDavis et de l’Illinois, aux États Unis, la structure cristalline de la protéine HydE liant le complexe-B a été résolue, révélant une coordination unique (k3-cysteinate)Fe(CN)(CO)2. Les études de cinétique dans les cristaux ont permis de mettre en évidence l’apparition d’une espèce de fer pentacoordiné probablement liée au produit de la réaction de HydE. Les changements conformationnels observés dans les différentes structures suggèrent un mouvement directionnel d’accès du substrat au site actif et d’évacuation du produit, permettant de les protéger d’une éventuelle hydrolyse lors d’un contact avec le solvant.

Crystal Structure of the [FeFe]-Hydrogenase Maturase HydE Bound to Complex-B
Roman Rohac, Lydie Martin, Liang Liu, Debashis Basu, Lizhi Tao, R. David Britt*, Thomas B. Rauchfuss*, and Yvain Nicolet*J. Am. Chem. Soc., May 28, 2021
https://doi.org/10.1021/jacs.1c03367

 

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38831
L’équipe Chirosciences de l’ISM2 rejoint le GIS FrenchBIC http://frenchbic.cnrs.fr/2021/05/12/lequipe-chirosciences-de-lism2-rejoint-le-gis-frenchbic/ Wed, 12 May 2021 15:58:18 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=37738   Au sein de l’équipe Chirosciences à Marseille, la thématique “catalyse en milieu confiné” – qui étudie des catalyseurs confinés au sein de structures cages – est développée par 4 permanents (Cédric Colomban, Bastien Chatelet, Yoann Cotelle et Alexandre Martinez). …

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De gauche à droite Cédric Colomban, Alexandre Martinez et Bastien Chatelet

Au sein de l’équipe Chirosciences à Marseille, la thématique “catalyse en milieu confiné” – qui étudie des catalyseurs confinés au sein de structures cages – est développée par 4 permanents (Cédric Colomban, Bastien Chatelet, Yoann Cotelle et Alexandre Martinez). En particulier l’étude de catalyseurs bio-inspirés encagés vise à obtenir des transformations plus efficaces et sélectives dans des conditions douces. Ces systèmes, inspirés des métalloenzymes, possèdent une structure cage (cavité hydrophobe) agissant comme un filtre permettant de sélectionner le substrat d’intérêt et de protéger le site actif métallique.

Quelques références significatives

Responsable d’équipe: Alexandre Martinez

Contact: Cédric Colomban (cedric.colomban@univ-amu.fr)

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37738
Wadih Ghattas reçoit la médaille de bronze du CNRS http://frenchbic.cnrs.fr/2021/04/27/wadih-ghattas-recoit-la-medaille-de-bronze-du-cnrs/ Tue, 27 Apr 2021 20:35:30 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=37200 Recruté en 2016 à l’Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d’Orsay (UMR 8182), Wadih Ghattas travaille à la conception, la construction, la caractérisation et l’étude de l’activité catalytique de la première métalloenzyme artificielle in vivo, un domaine de recherche …

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(c) CNRS

Recruté en 2016 à l’Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d’Orsay (UMR 8182), Wadih Ghattas travaille à la conception, la construction, la caractérisation et l’étude de l’activité catalytique de la première métalloenzyme artificielle in vivo, un domaine de recherche où des protéines sont détournées de leur fonction primaire pour en faire des catalyseurs de réaction abiologiques. Ce concept de métalloenzymes artificielles avec la dimension supplémentaire de l’« in vivo » est nouveau dans le domaine de la chimie bioinorganique et très peu de laboratoires dans le monde s’y intéressent.

Wadih Ghattas s’attache plus particulièrement à des Diels-aldérases artificielles et développe en parallèle des projets à application théranostique via la préparation de nouveaux conjugués entre ligands de récepteurs membranaires et unité catalytique, afin d’activer des sondes d’imagerie ou encore induire la formation d’un principe actif à partir d’une prodrogue. 

Ses travaux ont fait l’objet de deux articles dans le journal du CNRS et 27 articles ont déjà été publiés dans d’excellents journaux (JACS, Angew Chem, ACS Omega, ChemBioChem…). Porteur d’une ANR, il a développé un réseau solide de collaborations et est en émergence au niveau international, ses projets innovants étant particulièrement prometteurs.

Très jeune, j’étais attiré par toutes les sciences exactes et je n’arrivais pas à choisir une seule discipline de spécialisation. Mes choix d’orientation vers la chimie physique, puis la chimie bio-inorganique, ont certainement été guidés par la multidisciplinarité de ces domaines. Depuis mon recrutement, je travaille sur une approche biomimétique des métalloenzymes naturelles, des enzymes dont la structure protéique est associée à des ions métalliques. Je prépare des complexes métalliques ayant des propriétés catalytiques qui n’existent pas dans la nature et je les insère dans des protéines pour créer des métalloenzymes artificielles. Plus récemment, j’ai travaillé à introduire ces enzymes dans une cellule vivante pour la doter de propriétés catalytiques artificielles. Ces dernières sont un outil d’avenir de thérapie et de diagnostic.

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37200
Gilles Gasser receives the Pierre Fabre Award from the French Medicinal Chemistry Society http://frenchbic.cnrs.fr/2021/04/13/gilles-gasser-receives-the-pierre-fabre-award-from-the-french-medicinal-chemistry-society/ Tue, 13 Apr 2021 08:20:25 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=37142 The prize will be awarded for his original scientific contributions in the field during the 56th International Conference on Medicinal Chemistry

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The prize will be awarded for his original scientific contributions in the field during the 56th International Conference on Medicinal Chemistry

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Visit the new website of the institute of Metals in Biology of Grenoble (IMBG) http://frenchbic.cnrs.fr/2021/04/09/visit-the-new-website-of-the-institute-of-metals-in-biology-of-grenoble-imbg/ Fri, 09 Apr 2021 13:02:24 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=37106 An institute without a wall, the Institut des Métaux en Biologie (IMBG) is defined as a thematic research network, bringing together a large community of Grenoble researchers and teacher-researchers whose common point is a scientific project: Chemistry and Biology metals …

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An institute without a wall, the Institut des Métaux en Biologie (IMBG) is defined as a thematic research network, bringing together a large community of Grenoble researchers and teacher-researchers whose common point is a scientific project: Chemistry and Biology metals in living systems. This rapidly developing theme represents a vast field of investigation since more than a third of the proteins in a cell require the fixation of a metal ion for essential functions such as respiration, photosynthesis, the biosynthesis of metallo enzymes or the DNA repair. These systems are for the researchers of the IMBG a source of studies but also of bioinspiration which is in full swing.

More precisely, the IMBG is part of three main areas of research:

  • metalloenzymes and model chemical systems (catalysis),
  • toxic metals and metal pollutants, toxicology and bioremediation (environment),
  • metals, metabolism and nutrition (health).

​The IMBG now has more than 200 members, including around forty doctoral students from 11 laboratories in 23 teams located on the three Grenoble sites of the University of Grenoble Alpes (DCM, LBFA, ISTerre, LTHE, GIN), the CHU of Grenoble (IBP, IAB) and the Scientific Polygon (ESRF, IBS, LCBM, LPCV, SyMMES).

The IMBG brings together forces of the highest scientific quality and hosts collaborative projects at the chemistry / biology, physics / biology or chemistry / physics interfaces. The strength of the IMBG lies in the voluntary adherence of its members to a common scientific theme instead of being the association of research units. Its primary ambition for nearly 20 years has been to strengthen the visibility of this scientific community at national and international level.
The activities of the Institute are divided into three components:

  • scientific activities in the Grenoble area to bring together and unite the scientific community working around metals.
  • training young scientists, using two tools: the “Annual IMBG Days” and the establishment of thematic schools alongside the biannual IMBG International Congresses. The program of these thematic schools includes theoretical courses and practical lessons given by international, national or Grenoble guests in a Gordon conference format.
  • the contribution to the visibility “outside the hexagon” of the University by the organization of international congresses. To date more than 12 congresses have been organized.
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37106
[Journal Club] Contrôle à longue distance de la réactivité du site actif d’une métalloenzyme http://frenchbic.cnrs.fr/2021/02/04/controle-a-longue-distance-de-la-reactivite-du-site-actif-dune-metalloenzyme/ Thu, 04 Feb 2021 13:21:50 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=36427 L’étude de métalloenzymes a révélé que leur réactivité n’est pas seulement déterminée par les ligands directs leurs ions métalliques, mais aussi par les acides aminés voisins du site actif inorganique, ceux de la seconde sphère de coordination. Cette information a …

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L’étude de métalloenzymes a révélé que leur réactivité n’est pas seulement déterminée par les ligands directs leurs ions métalliques, mais aussi par les acides aminés voisins du site actif inorganique, ceux de la seconde sphère de coordination. Cette information a guidé la conception de complexes de métaux de transition biomimétiques très actifs. Des chercheurs du laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (CNRS, Aix-Marseille Université) et des Universités de Bochum (Allemagne) et de Turin (Italie) viennent de démontrer dans la revue Nature Communications que la réactivité du site actif peut aussi être déterminée par des acides aminés très distants du site actif: leur nature influence la flexibilité de la protéine et permet en conséquence de moduler la première sphère de coordination.

Les hydrogénases sont des métalloenzymes qui utilisent des sites actifs inorganiques, à base de métaux de transition (fer ou nickel), pour catalyser l’oxydation et la production du dihydrogène. L’étude des hydrogénases “à Fer” est un cas d’école en chimie inorganique biomimétique: la structure de l’enzyme élucidée à la fin des années 1990 a permis de comprendre que l’atome d’azote d’une amine dans la seconde sphère de coordination du métal joue un rôle crucial dans la catalyse, en acceptant le proton résultant du clivage hétérolytique du dihydrogène [1].

On considère habituellement que les acides aminés situés à longue distance du site actif, dans la sphère de coordination “externe”, n’interviennent que pour connecter le site actif et l’extérieur de l’enzyme, en aidant les transferts à longue distance des substrats et produits de l’enzyme (les électrons, protons, et le dihydrogène). L’étude par cristallographie, spectroscopie IR, électrochimie et mutagenèse dirigée de l’hydrogénase de la bactérie Clostridium beijerinckii a permis d’illustrer un nouveau mécanisme par lequel la partie protéique d’une enzyme peut déterminer ses propriétés [2].

Contrairement aux hydrogénases à Fer qui étaient connues jusqu’alors, le site actif de cette hydrogénase n’est pas détruit par l’oxygène parce que dans des conditions oxydantes, une cystéine de la seconde sphère de coordination se lie directement à l’ion fer du site actif et le protège. Cette cystéine est présente dans presque toutes les hydrogénases à Fer, mais la flexibilité de la boucle qui la porte est fortement influencée par trois acides aminés non conservés situés à 13Å du site actif. Leur encombrement stérique détermine la vitesse du changement de conformation qui permet à la cystéine de se fixer sur l’ion fer du site actif. Cette liaison complète la sphère de coordination de l’ion fer et empêche la fixation du dioxygène, ce qui protège le site actif.

L’étude permet de détailler le rôle de chacun de ces acides aminés distants du site actif dans le changement de conformation qui se produit dans une hydrogénase particulière, et démontre qu’à l’intérieur de la grande famille des hydrogénases à Fer, les propriétés de l’enzyme ne sont pas imposées uniquement par l’environnement immédiat et très conservé du site actif, mais aussi par un contrôle à longue distance de la réactivité du site actif par des acides aminés qui sont très variables d’une enzyme à l’autre.

[1] Colloque « Biomimétisme et chimie durable », 10 novembre 2015, “Quelles voies de recherches pour la catalyse de l’hydrogène et la valorisation du dioxyde de carbone ?”  C. Léger, “Oxydation et production de dihydrogène : leçons de la Nature”.

[2] Martin Winkler, Jifu Duan, Andreas Rutz, Christina Felbek, Lisa Scholtysek, Oliver Lampret, Jan Jaenecke, Ulf Peter Apfel, Gianfranco Gilardi, Francesca Valetti, Vincent Fourmond, Eckhard Hofmann, Christophe Léger, Thomas Happe “A safety cap protects hydrogenase from oxygen attack” Nature Communications, doi: 10.1038/s41467-020-20861-2, (2021)

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36427
L’équipe Métaux et Organes (Met&Or) du LCBM à Grenoble rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2021/01/14/lequipe-metaux-et-organes-metor-du-lcbm-a-grenoble-rejoint-le-gis/ Thu, 14 Jan 2021 12:00:35 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=34753 L’équipe Métaux et Organes (Met&Or) s’intéresse à l’étude de l’homéostasie des métaux chez les mammifères dans des contextes tant physiologiques que pathologiques ainsi que dans le cas d’expositions environnementales aux métaux telles que les nanoparticules métalliques. Ces études nécessitent le …

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L’équipe Métaux et Organes (Met&Or) s’intéresse à l’étude de l’homéostasie des métaux chez les mammifères dans des contextes tant physiologiques que pathologiques ainsi que dans le cas d’expositions environnementales aux métaux telles que les nanoparticules métalliques. Ces études nécessitent le développement de méthodologies innovantes notamment en imagerie mais également sur le plan des modèles de culture cellulaires.
Nos thématiques principales concernent,

  • le devenir des nanoparticules d’argent dans le foie,
  • l’homéostasie du cuivre en conditions physiologiques et pathologiques,
  • le développement de modèles de cultures d’hépatocytes en 3D et,
  • les développements en imagerie corrélative élémentaire – ultrastructurale.

L’équipe Met&Or est composée de trois personnels permanents : un maître de conférences, une chercheuse et une technicienne.

Responsable: Aurélien DENIAUD

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L’équipe “Bioénergie et environnement” du LCBM à Grenoble rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2021/01/12/lequipe-bioenergie-et-environnement-du-lcbm-a-grenoble-rejoint-le-gis/ Tue, 12 Jan 2021 13:14:35 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=34754 L’équipe “Bioénergie et environnement” s’intéresse à la bio-activation de petites molécules par des métalloenzymes et des micro-organismes anaérobies. Les thématiques sont centrées autour de l’étude du métabolisme énergétique de microorganismes capables de métaboliser des gaz (CO, CO2, CH4, H2). Les …

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L’équipe “Bioénergie et environnement” s’intéresse à la bio-activation de petites molécules par des métalloenzymes et des micro-organismes anaérobies. Les thématiques sont centrées autour de l’étude du métabolisme énergétique de microorganismes capables de métaboliser des gaz (CO, CO2, CH4, H2). Les microorganismes modèles seront les deux bactéries photosynthétiques Rhobobacter capsultatus et Rhodospirillum rubrum et l’archée méthanogène Methanococcus maripaludis. La compréhension des mécanismes enzymatiques mis en jeu dans ces processus ainsi que l’optimisation de procédés catalytiques (à base d’enzymes naturelles ou artificielles) pour des applications en chimie durable sont au cœur des préoccupations de l’équipe.

L’équipe Bioénergie & Environnement est constituée de 7 membres permanents et 3 non-permanents.

Responsable: Christine.CAVAZZA@cea.fr

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Doris Lexa, Directrice de Recherche CNRS, nous a quittés le 8 août 2020 http://frenchbic.cnrs.fr/2020/12/17/doris-lexa-directrice-de-recherche-cnrs-nous-a-quittes-le-8-aout-2020/ Thu, 17 Dec 2020 20:04:03 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=33099 Doris a fait ses études scientifiques à la Faculté des Sciences de Paris – Sorbonne. Elle a commencé sa carrière de recherche, en 1963, au Muséum National d’Histoire Naturelle, dans l’équipe de Jean-Marc Lhoste et a travaillé avec Joël Mispelter …

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Doris a fait ses études scientifiques à la Faculté des Sciences de Paris – Sorbonne. Elle a commencé sa carrière de recherche, en 1963, au Muséum National d’Histoire Naturelle, dans l’équipe de Jean-Marc Lhoste et a travaillé avec Joël Mispelter sur la caractérisation spectroscopique de complexes de métaux de transition. Dès ce début de carrière, aux prémices de la bioinspiration, elle s’est intéressée à des complexes évoquant le centre actif de systèmes biologiques, par le métal et la sphère de coordination. Elle a ainsi entamé une collaboration avec Michel Momenteau (Institut Curie à Orsay) sur les propriétés physico-chimiques de métalloporphyrines, modèles d’hémoprotéines. Son thème s’est élargi très rapidement vers divers types de systèmes : complexes histidine, cobalamines, vitamines B12, cyctochromes… D’emblée, elle a concentré son attention sur leurs propriétés, alors dites de chimie redox, convaincue que la cinétique et thermodynamique des transferts d’électrons se trouvaient au cœur des mécanismes réactionnels des sites actifs de protéines. Dès lors elle s’est intéressée aux travaux de l’équipe du Pr. Jean-Michel Savéant sur le développement de l’électrochimie moléculaire. Ces travaux ouvraient une voie d’étude inédite dans le domaine de la chimie des transferts d’électrons et de protons, de la réactivité chimique, de la chimie des complexes de métaux de transition et de la réactivité catalytique. En particulier, le développement de la voltammétrie cyclique, tant d’un point de vue théorique qu’expérimental apportait un nouvel outil approprié aux études mécanistiques. Très rapidement elle a engagé une importante collaboration avec ce groupe qu’elle a rejoint en tant que chercheuse CNRS au Laboratoire d’Electrochimie Moléculaire (Paris VII) en 1980. Au sein de ce nouvel environnement, Doris a été pionnière dans la mise en œuvre de ces méthodes électrochimiques pour l’étude des modèles de systèmes biologiques, et en particulier des métalloprotéines. Avec son enthousiasme légendaire, elle a entamé une série d’études ambitieuses et très approfondies sur des molécules choisies comme modèles de sites actifs de métalloprotéines au cœur de réactions biologiques d’intérêt comme la réduction de O2 par la cytochrome c oxydase ou le transport de O2 par l’hémoglobine, le transfert du groupe méthyle par la vitamine B12, la réduction du CO2, des sulfates, des nitrates, l’activation du dioxygène… Ces études l’ont conduite à adapter les techniques électrochimiques aux conditions expérimentales spécifiques imposées par l’étude de complexes métalliques modèles, tels que les dérivés de cobalamine, des porphyrines de fer simples ou superstructurées (en collaboration avec Michel Momenteau, Institut Curie à Orsay) générant des effets supramoléculaires. Expérimentatrice hors pair, elle a fait preuve d’originalité et d’inventivité (et parfois d’une certaine pugnacité) pour la mise en œuvre et l’utilisation d’électrodes diverses, incluant des ultramicroélectrodes, l’utilisation de promoteurs ou de médiateurs redox et également pour le couplage avec diverses techniques spectroscopiques. Elle a réalisé des travaux pionniers dans la construction de cellules de spectroélectrochimie UV-visible basse température, IR ou résonance Raman ainsi que RPE. Doris a également initié l’étude électrochimique de clusters de manganèse, modèles du Centre de Dégagement du diOxygène du Photosystème II, site actif de l’oxydation de l’eau en oxygène (en collaboration avec l’équipe de Jean-Jacques Girerd, Université d’Orsay).

En 1994, Doris a effectué une mobilité géographique et thématique vers le Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (BIP UPR 9036) dirigé par Mireille Bruschi à Marseille. Elle a recentré son activité sur des systèmes naturels. Avec Elizabeth Lojou, elle a constitué une nouvelle équipe de chimistes au sein d’un environnement de biologistes. L’objectif était d’apporter des compétences électrochimiques et spectroscopiques pour étudier la relation structure-fonction de différentes protéines d’oxydo-réduction, en parallèle aux études sur les modèles synthétiques. Les bactéries intervenant dans la respiration du soufre ont alors attiré son attention et ses travaux ont alors porté sur les cytochromes monohémiques nouvellement extraits de ces bactéries, ainsi que la désulfoviridine, une enzyme contenant un sirohème et impliquée dans la réduction du sulfate en H2S.

Au cours de sa carrière, Doris Lexa a développé un très large éventail de travaux pionniers dans le domaine des transferts d’électron, des processus d’activation de petites molécules et de l’électro-catalyse par les systèmes bioinspirés. En particulier, les études poussées sur l’électrochimie des porphyrines de fer développées au LEM en collaboration avec Jean-Michel Savéant sont à l’origine de thématiques très en pointe de nos jours. Ses travaux peuvent être considérés parmi les travaux fondateurs du domaine de l’électrochimie des systèmes biomimétiques, biologiques et supramoléculaires. Elle était un membre actif de SAMBAS, groupe de recherche initiateur du “Club Métalloprotéines et modèles” et du FrenchBIC.

Ses collaborateurs et collaboratrices et les doctorant-e-s qu’elle a formé-e-s peuvent témoigner de la passion, de l’enthousiasme et de la grande rigueur avec lesquels Doris abordait son activité scientifique. C’était également une personne extrêmement attentionnée, bienveillante et chaleureuse, toujours prête à apporter conseil et soutien, en particulier aux jeunes chercheuses et chercheurs, à qui elle avait le désir de transmettre sa passion pour l’étude des métalloprotéines et de leurs modèles. Christophe Léger se souvient avec quelle gentillesse elle l’a accueilli à son arrivée au BIP, et son équipe utilise encore quotidiennement l’équipement qu’elle avait acquis.

Originaire du Sud de la France, Doris s’était installée à Marseille à la fin de sa carrière. Elle était également une navigatrice hors pair, et elle abordait cette activité extra-professionnelle avec la même passion, enthousiasme et rigueur que pour ses travaux scientifiques. Elle a longtemps été skippeuse sur les bateaux du CAES CNRS, heureuse de partager sa passion de la mer avec ses collègues.

Portée par sa générosité et son désir d’accompagnement, au cours de ses années de retraite, Doris était engagée auprès d’associations locales d’aide à l’insertion et d’alphabétisation.

Ses collaborateurs et collaboratrices gardent en mémoire le souvenir d’une collègue chaleureuse, amicale et toujours curieuse de nouvelles découvertes.

15 décembre 2020
Yves Le MestElodie Anxolabéhère

Repères sur la carrière de Doris Lexa (1938-2020) :

  • 1958 – 1961 : Licence ès Sciences Paris, Faculté des Sciences Paris
  • 1962 – 1963 : Enseignante au lycée de Bonneville
  • 1963 – 1967 : Laboratoire de Biophysique du Museum National d’Histoire Naturel (MNHM), Ingénieur DRME détachée à l’ENS St Cloud
  • 1967-1969 : Collaboratrice Technique CNRS, MNHM
  • 1968 : DEA Electrochimie
  • 1969 – 1974 : Assistante Titulaire au MNHM
  • 1972 : Doctorat ès Sciences Physiques “Contribution à l’étude des propriétés d’oxydo-réduction des cycles tétrapyrroliques et de leurs complexes métalliques” Dir. J.-M. Lhoste
  • 1974 – 1979 : Maître-Assistante titulaire MNHM
  • 01 01 1980 : Nomination Chargée de Recherche CNRS détachée du MNHM au Laboratoire d’Electrochimie Moléculaire UMR 7591, Université Paris VII
  • 1981 – 1989 : Maître de Recherche, Laboratoire d’Electrochimie Moléculaire
  • 1990 : Directeur de Recherche 2 CNRS titulaire
  • 1994 : Directeur de Recherche 2 à l’UPR 9036, Bioénergétique et Ingénierie des Protéines (BIP) Marseille

Quelques articles jalons de l’éventail des thématiques initiées et développées par Doris Lexa :

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Election 2020 http://frenchbic.cnrs.fr/2020/11/02/election-2020/ Mon, 02 Nov 2020 07:51:58 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29338 Christelle Hureau has been elected vice-president and will become president in January 2023.

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Procédure
  • L’AG 2020 a décidé de l’élection d’un·e vice-président·e fin 2020.
  • L’inscription individuelle sur la liste électorale, en utilisant le formulaire ci-dessous jusqu’au 30/11/2020, est obligatoire. Seules les personnes ayant un statut de permanent, membres d’une équipe du GIS et travaillant sur une thématique du GIS (métaux en biologie, chimie bioinorganique, biomimétique) peuvent s’inscrire. La liste, vérifiée par le directoire du GIS, sera publiée sur cette page.
  • Déclaration de candidature (par mail à frenchbic@imm.cnrs.fr), accompagnée d’une profession de foi, jusqu’au 30/11/2020. Seules les personnes pouvant voter sont éligibles.
  • Les votes sont ouverts du 7 au 11 décembre, par mail, en utilisant un lien individuel reçu de www.balotilo.org. L’inscription sur la liste électorale (formulaire ci-dessous) est indispensable. L’inscription sur balotilo est inutile.
Inscription sur la liste électorale 2020 avant le 30/11/2020
[contact-form-7]
Liste électorale

Validée par le directoire

Candidature
Résultat
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Le groupe « Métabolisme de l’hydrogène » du BIP rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/28/le-groupe-metabolisme-de-lhydrogene-du-bip-rejoint-le-gis/ Wed, 28 Oct 2020 14:32:23 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29235 Au laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines à Marseille, cette équipe de 3 permanents (Myriam Brugna, Carole Baffert et Arlette Kpebe) travaille sur le métabolisme de l’hydrogène, avec des études moléculaires d’hydrogénases et de leur rôle physiologique. Contact: Carole …

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Au laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines à Marseille, cette équipe de 3 permanents (Myriam Brugna, Carole Baffert et Arlette Kpebe) travaille sur le métabolisme de l’hydrogène, avec des études moléculaires d’hydrogénases et de leur rôle physiologique.

Contact: Carole Baffert

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Oral and poster presentation prizes awarded during the 2020 FrenchBIC Webinar http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/21/oral-and-poster-presentation-prizes-delivered-during-the-2020-frenchbic-webinar/ Wed, 21 Oct 2020 14:17:56 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29130 Prizes have been awarded to Christine Schulz, Phoulinh Chanthavong, Enrico Falcone, Daniela Mendoza-Franzese, Christian Schneider, Gabrielle Schanne and Mickael Mauger

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Oral presentation prizes

The four laureates received 200 € each, thanks to the support of the Journal of Inorganic Biochemistry, for their oral presentation.

Christine Schulz

Enrico Falcone

Christine Schulz works on simulations of metalloenzymes in the group of Prof. Neese at the MPI KoFo. In her talk she presented the a computational study on the Q intermediate of sMMO

Enrico Falcone is PhD student in the laboratory of Biometals and Biological Chemistry at the University of Strasbourg, under the supervision of Prof. Peter Faller. He presented an oral communication entitled “Towards reversible and specific luminescent sensing of Cu(II) in biological media

Phoulinh Chanthavong

Daniela Mendoza-Franzese

Phoulinh Chanthavong works at the DCM (Grenoble) in the CiRE team under the supervisation of Dr. Catherine Belle and Dr. Angéline Van Der Heyden. He’s currently at the end of his 3rd year PhD and is working on the synthesis of bi-nuclear complexes for the recognition of phospholipids. He presented an oral communication entitled Bi-nuclear Zn complexes for the recognition of phosphatidylserine on microvesicles.

Daniela Mendoza is a current 3rd year PhD student from the Laboratoire d’Electrochimie Moleculaire (LEM) and the Synchrotron SOLEIL. Her project is focused on the coupling of X-Ray absorption spectroscopy with electrochemistry techniques for the understanding of the mechanism of CO2 reducing electrocatalysts. This project is supervised by Dr. Elodie Anxolabéhère-Mallart, Prof. Marc Robert and Dr. Benedikt Lassalle-Kaiser. She presented an oral communication entitled “Operando X-Ray absorption spectroelectrochemistry: new insights in the catalysis of CO2 by iron porphyrins” during the FrenchBIC 2020.

Oral presentation prizes

The three laureates received 100 € each for their poster presentation, plus 100£ as a Royal Society of Chemistry voucher.

Christian Schneider

Gabrielle Schanne

Christian studied chemistry at Philipps University Marburg and is currently pursuing his PhD in chemistry in the Werncke group. His research focusses on the activation of 5./6. main group elements by quasilinear, low-coordinated transition metal (I) complexes. In his flash talk he presented the synthesis and reactivity of a low coordinate [FeII-S-FeII] complex showcasing spectroscopic and magnetometric signatures alongside its particular reactivity in redox reactions and towards CS2.

Gabrielle Schanne is a PhD student in collaboration between the laboratory of Biomolecules (LBM) and Saint-Antoine research center (CRSA). She works under the supervision of Nicolas Delsuc (LBM), Clotilde Policar (LBM) and Philippe Seksik (CRSA). She presented a poster communication entitled “Design and delivery of anti-oxidant inorganic complexes mimicking the superoxide dismutase (SOD) enzyme ». The activity of newly designed Mn-complexes with SOD activity were investigated in a cellular model of oxidative stress and inflammation and were correlated to their physico-chemical properties.

Mickael Mauger

Mickaël Mauger works in the “Chimie Biologique et Applications Thérapeutiques” lab under the supervision of Dr. Myriam Seemann, on the cistrans isomerase of unsaturated fatty acids. He presented a posterentitled “The cistrans isomerase of unsaturated fatty acids as a potential new therapeutic target”.

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La photo de groupe 2020 http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/20/la-photo-de-groupe-2020/ Tue, 20 Oct 2020 07:22:13 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29095 Pendant le webinar 2020

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Pendant le webinar 2020

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[Project supported by FrenchBIC] Nikolaos Kostopoulos: Cryo-spectroelectrochemical UV-Vis study of the electrochemical activation of O2 with Fe porphyrins http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/08/project-supported-by-frenchbic-nikolaos-kostopoulos-cryo-spectroelectrochemical-uv-vis-study-of-the-electrochemical-activation-of-o2-with-fe-porphyrins/ Thu, 08 Oct 2020 16:13:23 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=29049 Nikolaos Kostopoulos, from the Laboratoire d’Electrochimie Moléculaire in Paris, spent one week in the lab Dr. Nicolas Le Poul at Laboratoire de Chimie et Electrochimie Moléculaires et Chimie Analytique. This project was supported by a grant from FrenchBIC. The main …

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Nikolaos Kostopoulos, from the Laboratoire d’Electrochimie Moléculaire in Paris, spent one week in the lab Dr. Nicolas Le Poul at Laboratoire de Chimie et Electrochimie Moléculaires et Chimie Analytique. This project was supported by a grant from FrenchBIC.

The main goal of my PhD is the electrochemical generation of intermediate species that are formed during the reduction of O2 by Fe porphyrins, as a greener alternative for achieving catalytic oxidation of substrates. Encouraged by results that we obtained in our laboratory. I wanted to study my system, that is simple Fe porphyrins such as Fe tetraphenyl porphyrin in DMF and acetonitrile in presence of O2, with an efficient cryo-spectroelectrochemistry set-up in Brest, in collaboration with Dr. Nicolas Le Poul at Laboratoire de Chimie et Electrochimie Moléculaires et Chimie Analytique. Thanks to a grant from FrenchBIC, I spent one week in this laboratory performing low temperature UV-Vis spectroelectrochemistry experiments. Firstly, I studied the intermediates that are produced during electrochemical O2 reduction by FeF20TPPCl in presence of a strong acid in DMF solutions. Secondly, I studied the intermediates that are produced when FeTPPCl reduces O2 electrochemically in absence of acid. The results were promising. We will keep our collaboration to further analyze their activity. I am thankful to FrenchBIC for the grant and to Dr. Nicolas Le Poul and his team for hosting me, it has been a great experience.

Nikos Kostopoulos

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New open webinar series http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/07/new-open-webinar-series/ Wed, 07 Oct 2020 11:13:25 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=28045 During the covid epidemic, some of our seminars are organized as videoconferences. This is an opportunity to make science more open. To this end, we now offer the possibility to announce the webinars that are open to the public outside your lab on the FrenchBIC website.

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During the covid epidemic, some of our seminars are organized as videoconferences. This is an opportunity to make science more open. To this end, we now offer the possibility to announce the webinars that are open to the public outside your lab on the FrenchBIC website. Please fill this form to annouce an open webinar, and check the list here.

[UPDATED] This series begins October 15th at 11.30am (UTC+02), with a webinar given by Magali Roger on “Rewiring Escherichia coli for bio-based production of C1 compound from H2 and CO2“.

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28045
Assemblée Générale 2020 http://frenchbic.cnrs.fr/2020/10/02/assemblee-generale-2020/ Fri, 02 Oct 2020 09:18:57 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=27464 Mercredi 14/10/20 à 12h, en visioconférence, à l’occasion du webinaire 2020. Rappels Penser à Inscrire les nouvelles et nouveaux membres de vos labos à notre mailing list,  Mettre un lien vers le site du GIS sur le site de votre …

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Mercredi 14/10/20 à 12h, en visioconférence, à l’occasion du webinaire 2020.

Rappels

Penser à Inscrire les nouvelles et nouveaux membres de vos labos à notre mailing list, 

Mettre un lien vers le site du GIS sur le site de votre labo (cela fait partie des conditions d’adhésion des équipes). 

Annoncer sur le site en utilisant la rubrique contact vos conférences, webinaires, offres de jobs, CVs, résultats marquants (rubrique Journal Club) etc. Plus de 250 annonces de postes et autant d’annonces de conférences ont été publiées sur le site depuis 2015.

Les contours du GIS

Suite à décision en AG 2018, toutes les équipes ont été recontactées pour leur demander de confirmer leur volonté de faire partie du GIS. Six ont décliné. 

Par ailleurs, 3 nouvelles équipes ont rejoint le GIS depuis la dernière AG, après validation par le directoire (selon les modalité d’adhésion décrites sur le site): équipe Lojou à Marseille, Lobinski à Pau, Ortega à Bordeaux. 

La liste à jour compte 56 équipes.

Création d’un groupe thématique “BIC” de la SCF

Le GIS envisageait un rapprochement avec la SCF depuis 2016. La création du Groupe thématique de chimie bioinorganique de la SCF a été approuvée à l’unanimité par le CA de la SCF, avec le soutien de la DCC, pour trois ans (renouvelables). Le GT doit fournir un rapport d’activité annuel au bureau, précisant notamment ses interactions avec la SCF.

L’élection des membres du bureau du GT le 12/12/2019 a permis de nommer: Président : C LEGER; VP et secrétaires: Frédéric BANSE et Isabelle MICHAUD-SORET; Trésorière: Catherine BELLE, Représentant à L’Actualité Chimique: Benoît BERTRAND; Correspondante communication auprès du siège: Marine DESAGE-EL MURR, Représentant·e·s du GT au bureau de la DCC: Isabelle M-S.

Les membres du GIS sont vivement encouragés à adhérer à la SCF, division Chimie de coordination.

Le GT est la représentation du GIS au sein de la SCF. Il ne s’agit pas d’un groupe indépendant.

Pour assurer la cohésion, le bureau du GT est fusionné avec le directoire du GIS pour le partage d’informations et les prises de décision “quotidiennes” (vote sur les demandes de subvention etc.). 

Bilan des appels d’offre FrenchBIC

L’AG 2018 a précisé les conditions dans lesquelles le GIS peut attribuer un financement pour une mission: un jeune membre du GIS est subventionné à hauteur de 500€ max pour partir en mission dans une autre équipe du GIS. Un court rapport est publié sur le site du GIS après la mission, et le GIS est remercié sur l’article éventuel qui résulte de la mission. Le terme “jeune” n’est pas défini par une limite d’âge. Ces demandes peuvent se faire au fil de l’eau. 

Les financements accordés récemment:

Les critères d’éligibilité sont assouplis: les missions doivent concerner au moins une équipe du GIS (au lieu de deux) et sont ouvertes aux collaborations internationales (entrantes/sortantes), pourvu que la somme demandée corresponde à un réel besoin. La possibilité de demander de tels financements sera rappelée par mail plusieurs fois.

Congrès financés par le GIS

Depuis 2018, des financements (modestes) ont été attribués pour quatre conférences. CuBICs (2018), QBICV (2019),  BIOMETALS (2020) et GECOM CONCOORD (2021)

Le financement est conditionné à la décision du directoire élargi. Les conditions nécessaires sont que :

  • Le congrès indique le logo du GIS et un court texte de présentation du GIS sur le programme WEB et en version papier
  • Une session doit être clairement identifiée “FrenchBIC”; elle peut être introduite par un·e chair(wo)man membre du GIS. 
  • Le directoire du GIS est à la disposition des organisateurs·rices pour proposer des noms d’intervenant·e·s.

Ces conditions sont affichées sur le site du FrenchBIC.

Bilan des dernières réunions

Les évènements du GIS sont organisés localement, mais le GIS prend le risque financier et le bénéfice s’il y en a. Depuis 2018, nous avons obtenu de nombreux financements par sponsors publics et privés, qui s’ajoutent à la dotation annuelle du CNRS pour nous permettre de donner des subventions, des prix (posters, confs orales), et de proposer des inscriptions très peu chères aux événements du GIS, en particulier pour les non-permanents.

Réunion annuelle à Carry en 2018. 

La réunion 2018  s’est déroulée du 14 au 17 octobre 2018 à Carry, avec 62 participants, 3 conférences invitées, 28 communications orales et une séance poster. Voir le programme, les photos, et le CR de l’AG.

2eme école METBIO à Carry et Marseille en 2019. 

La participation du GIS à l’organisation d’écoles thématiques était un objectif depuis notre rencontre avec nos tutelles en 2014.

La deuxième école “techniques d’études des métaux en biologie”, organisée à Carry le Rouet et Marseille, s’est déroulée du dimanche 06/10/19 au soir au vendredi 11/10/2019 au matin. 44 étudiant·e·s, provenant pour moitié de laboratoires étrangers, 27 ans en moyenne, ont été sélectionné·e·s parmi 60 candidatures. Le programme comportait des cours et deux jours de travaux pratiques. Les enseignant·e·s provenaient d’organismes français (universités, CNRS, Institut Curie, CEA) et étrangers (Allemagne, Angleterre). Trois présentations flash ont été récompensées. Voir le bilan pour plus de détails. 

Réunion annuelle 2020

La réunion 2020 initialement prévue au printemps 2020 a été repoussée à l’automne, puis remplacée par un webinaire gratuit, ouvert à la communauté germanique. 130 personnes ont participé.

Prochains évènements

3eme école METBIO.

Christophe Decroos de l’ISM2 porte le projet au CNRS d’une école thématique organisée du 12 au 17/09/2021 à Carry le Rouet. Toutes les demandes de financement CNRS d’écoles en 2020 ont été reportées sur 2021, nous devrions savoir d’ici la fin de l’année quel sera le financement CNRS de cette école. 

Réunion annuelle à Strasbourg octobre 21

Le VVF d’Obernai a conservé l’avance faite par l’IC à Strasbourg, et nous les restituera sous la forme d’un avoir valable pour la réunion annuelle 2021, dorénavant prévue du 10 au 13 Octobre 2021 en présentiel

Réunion annuelle automne 2022

Sous réserve: organisation de la réunion annuelle 2022 à Roscoff par les Brestois. 

Bilan des ANR 2019 et 2020

Des membres du GIS se sont inquiété·e·s du fait qu’aucun projet “chimie bioinorganique” n’a été sélectionné par les CE07 (Chimie moléculaire et procédés associés pour une chimie durable) et CE11 (Structures et relations structure-fonction des macromolécules bio) de l’ANR en 2019 (sur au moins 16 projets déposés par les membres du GIS).  Cela pose la question de l’évaluation des projets interdisciplinaires par les CES disciplinaires de l’ANR. Alerté à ce sujet en 2019, le représentant de la direction des opérations scientifiques de l’ANR nous a assuré que notre contribution prendra forme dans un comité (notamment le CE07) qui prendra en compte l’axe Chimie/Biologie. Sans qu’on puisse établir de causalité, 5 projets “BIC” ont été sélectionnés en CE07 et CE11 en 2020 (sur 25 déposés).

Evolution de la gouvernance

Après discussion et vote au sein du directoire et pendant l’assemblée générale, il a été décidé que la gouvernance (P/VP) évoluera de la façon suivante, qui garantit un roulement sur la prise de responsabilités et un passage de relais au fil des élections.

  • Election tous les 4 ans, suite à un appel à la communauté,  d’une personne qui restera “en fonction” 8 ans: 2 ans VP entrant, 4 ans P, 2 ans VP sortant. 
  • Votent tous les personnels permanents (C/EC/I/T) d’une équipe du GIS qui font la démarche de s’inscrire et déclarent être impliqué·e·s dans une activités liée à la thématique du GIS (chimie bioinorga).
  • La prochaine élection aura lieu fin 2020

Autres projets

  • Groupe de travail pour la rédaction d’un article sur le travail d’Yves Le Mest à l’occasion de son départ à la retraite. 
  • Proposer du contenu pour l’Actualité Chimique. Relancer le projet ancien de dossier thématique « BIC ».  
  • Amélioration collective de fr.wikipedia.org/wiki/Chimie_bioinorganique 
  • Proposition de publier des articles de revue en français. https://iste-editions.fr/ 
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[webinar] 2020 FrenchBIC Meeting: October 12th to 14th http://frenchbic.cnrs.fr/2019/07/10/2020-frenchbic-meeting/ Wed, 10 Jul 2019 10:29:51 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=17556 Voir la photo de groupe, les récompenses, et le CR d’assemblée générale.

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Voir la photo de groupe, les récompenses, et le CR d’assemblée générale.

Plenary speakers
  • Oliver Einsle (Freiburg), “Nitrogenase: Unraveling an Impossible Enzyme Mechanism”
  • Sonja Herres-Pawlis (Aachen), “Charge, electrons, oxygen – copper can transfer them all!”
  • Clotilde Policar (Paris), “Metal complexes in biological environments: a new frontier in inorganic chemistry”

Program (UPDATED)

3 half-days (12-14 october) afternoons only, including two parallel sessions for oral, communications, and interactive poster presentations.

See the program at premc.org/frenchbic2020/program/.

Registration is closed (UPDATED)

This event is free, therefore, the initial participation fees will be reimbursed. If you paid by card, please send us your full bank coordinates (IBAN number etc…) and your personal address.

For any question/problem with the registration, please contact Vincent Lebrun.

Abstract submission

Deadline to apply for an oral communication : January the 19th, 2020.

Deadline to submit a poster abstract : February the 1st, 2020.

NB : FenchBIC meetings are the occasion to let room for young researchers, therefore, many time slots are dedicated to PhD students and Postdocs.

[contact-form-7]
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[Journal Club] “Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy: Fundamentals and Applications” by Patrick Bertrand, available in French and English http://frenchbic.cnrs.fr/2020/06/10/electron-paramagnetic-resonance-spectroscopy-fundamentals-and-applications-by-patrick-bertrand-available-in-french-and-english/ Wed, 10 Jun 2020 08:58:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=27229 (fr) Les deux volumes du livre de Patrick Bertrand, “La spectroscopie de Résonance Paramagnétique Electronique”, sont disponibles dans la collection Grenoble Sciences. (en) The two volumes of the book “Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy” by Patrick Bertrand are now available in …

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(fr) Les deux volumes du livre de Patrick Bertrand, “La spectroscopie de Résonance Paramagnétique Electronique”, sont disponibles dans la collection Grenoble Sciences.
(en) The two volumes of the book “Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy” by Patrick Bertrand are now available in english from Springer

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Décès de Serge Crouzy http://frenchbic.cnrs.fr/2020/06/05/deces-de-serge-crouzy/ Fri, 05 Jun 2020 14:41:37 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=27215 Notre collègue Serge Crouzy, chercheur CEA au Laboratoire Chimie et Biologie des Métaux de Grenoble (LCBM, UMR-5249) nous a quittés le 6 avril 2020, à l’âge de 57 ans. Serge avait obtenu en 1989 un doctorat en systèmes électroniques à …

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Notre collègue Serge Crouzy, chercheur CEA au Laboratoire Chimie et Biologie des Métaux de Grenoble (LCBM, UMR-5249) nous a quittés le 6 avril 2020, à l’âge de 57 ans.

Serge avait obtenu en 1989 un doctorat en systèmes électroniques à l’Institut National Polytechnique de Grenoble. Recruté au CEA Grenoble en 1990, il débute sa carrière au sein du service de Biophysique Moléculaire et Cellulaire.

En 2007, Serge prend la direction de l’équipe « Modélisation Interaction et Repliement » au sein du Laboratoire de Chimie et Biologie des Métaux, puis en 2011 du groupe « Modélisation et Chimie Théorique ».

Les activités principales de l’équipe utilisent des approches théoriques et spectroscopiques pour comprendre les mécanismes en jeu dans les domaines de la chimie et de la biologie des métaux. Serge comptait des nombreuses collaborations avec les expérimentateurs du laboratoire, avec qui il était toujours prêt à discuter. Sa disponibilité et sa capacité à communiquer ont rendu ces collaborations profitables pour tous, mais aussi fructueuses en terme de résultats scientifiques.

Auteur d’une cinquantaine de publications scientifiques au cours de sa carrière, Serge s’est consacré à la modélisation de nombreux systèmes biologiques. Il a notamment contribué à l’étude structurale et fonctionnelle de protéines membranaires majeures, en réalisant des modèles intégrant l’environnement lipidique de ces protéines.

Il s’intéressait également depuis de nombreuses années à la structure et la réactivité de différentes familles de métalloprotéines et était impliqué dans des travaux de développement de méthodes et d’outils informatiques. Il croyait dans les approches couplées de dynamique et d’amarrage moléculaires et d’études d’interactions expérimentales biochimiques ou biophysiques.

Nous avons perdu un collaborateur et un ami, un homme d’une profonde intelligence qui a su rester humble et qui nous a permis de percer les secrets de la modélisation grâce à ses explications mêlant humour et science.

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Le groupe « Bioelectrochemistry, Biointerfaces, Biotechnology » du BIP rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2020/05/30/le-groupe-bioelectrochemistry-biointerfaces-biotechnology-du-bip-rejoint-le-gis/ Sat, 30 May 2020 12:18:23 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=27188 Les objectifs du groupe 3Bio au sein du BIP à Marseille visent à déterminer les bases moléculaires de l’immobilisation fonctionnelle de protéines et enzymes redox (cytochromes, cuprédoxines, hydrogénases, multicopper oxidases…) sur des interfaces électrochimiques fonctionnalisées (SAMs, nanomatériaux…), via des techniques …

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Les objectifs du groupe 3Bio au sein du BIP à Marseille visent à déterminer les bases moléculaires de l’immobilisation fonctionnelle de protéines et enzymes redox (cytochromes, cuprédoxines, hydrogénases, multicopper oxidases…) sur des interfaces électrochimiques fonctionnalisées (SAMs, nanomatériaux…), via des techniques d’électrochimie couplées à des techniques de caractérisation de surface (e-SPR, e-QCM, e-microscopie) et à de la modélisation. Le développement de piles à combustible enzymatiques est l’un des objectifs appliqués de cette recherche.

Fondé en janvier 2020, ce groupe comprend actuellement 3 chercheurs permanents (Anne de Poulpiquet, MCF, Ievgen Mazurenko, CRCN, Elisabeth Lojou, DR).

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Recrues 2020: Sarah Hostachy et Eugenio de la Mora à Grenoble http://frenchbic.cnrs.fr/2022/02/08/recrues-2020-sarah-hostachy-et-eugenio-de-la-mora-a-grenoble/ Tue, 08 Feb 2022 10:49:33 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=46955 Read More

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Recrue 2020: Charlène Esmieu à Toulouse http://frenchbic.cnrs.fr/2020/05/08/recrue-2020-charlene-esmieu-a-toulouse/ Fri, 08 May 2020 13:19:12 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=25090 Charlène Esmieu: J’ai soutenu ma thèse en Chimie Inorganique et Bio-Inorganique à l’Université Grenoble Alpes en Novembre 2014. Mes recherches, effectuées sous la direction de Stéphane Ménage et Stéphane Torelli au Laboratoire de Chimie et Biologie des Métaux (LCBM – …

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Charlène Esmieu: J’ai soutenu ma thèse en Chimie Inorganique et Bio-Inorganique à l’Université Grenoble Alpes en Novembre 2014. Mes recherches, effectuées sous la direction de Stéphane Ménage et Stéphane Torelli au Laboratoire de Chimie et Biologie des Métaux (LCBM – UMR 5249 CEA/CNRS/UGA) à Grenoble, ont porté sur la synthèse et la caractérisation de complexes bi-nucléaires de cuivre bio-inspirés de la réductase de l’oxyde nitreux, pour la réduction de N2O. J’ai ensuite rejoint le groupe de Gustav Berggren à l’Université d’Uppsala pour un premier post-doctorat de 3 ans. J’y ai étudié des mimes fonctionnels du site actif des hydrogénases, et l’activation d’hydrogénase « in vivo » chez des bactéries et cyanobactéries grâce à des cofacteurs synthétiques. Depuis mai 2018, je travaille au sein du groupe de Christelle Hureau au Laboratoire de Chimie de Coordination (LCC – UPR 8241) à Toulouse sur la capacité des peptides Aβ tronqués à générer des espèces réactives de l’oxygène en présence d’ion cuivre.

J’ai été recrutée en tant que chargée de recherche au sein de l’équipe « Alzheimer et Amyloïde » lors de la campagne de recrutement 2019 pour y développer de nouveaux ligands traçables des ions cuivre dans le contexte de la thérapie par chélation pour la maladie d’Alzheimer.

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[Project supported by FrenchBIC] Fangfang YANG: Targeted Supported Laccase-based Hybrid Systems for Continuous Flow Catalysis http://frenchbic.cnrs.fr/2020/04/13/project-supported-by-frenchbic-fangfang-yang-targeted-supported-laccase-based-hybrid-systems-for-continuous-flow-catalysis/ Mon, 13 Apr 2020 09:43:39 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=26528 Fangfang YANG, from the Bioscience, iSm2 (Institute Of Science Molecular De Marseille), spent six weeks in the lab of Prof. Rénal Backov, from the MaFIC (Matériaux Fonctionnels par Ingénierie Colloïdale) at CRPP UMR 5031 (Centre de recherche Paul Pascal). This …

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Fangfang YANG, from the Bioscience, iSm2 (Institute Of Science Molecular De Marseille), spent six weeks in the lab of Prof. Rénal Backov, from the MaFIC (Matériaux Fonctionnels par Ingénierie Colloïdale) at CRPP UMR 5031 (Centre de recherche Paul Pascal). This project was supported by a grant from FrenchBIC.

My PhD project aims at developing new supported hybrid catalyst for cooperative oxidative transformation of alcohols. We aim at vectorizing an oxidant module represented by a transition-metal-based-catalyst at the surface and close vicinity of the active copper center of a robust laccase to perform safe dioxygen reduction into water in a cooperative mode. This hybrid catalyst will then be confined in tailor-made silica-based nanomaterials to provide new properties to the hybrid catalyst dealing with stability, selectivity, efficiency and recyclability. Our preliminary results show that laccase and transition metal complex have to be covalently bound to the foam. We have undertaken at first a random functionalization of laccase which gives good catalytic results. Based on these results we want to control this immobilization in order to better control the reactivity. Thus, it is necessary to prepare more silica foam with different shapes and surface modification. The research group of Prof. Rénal Backov have done many valuable researches in the field of design, synthesize, and study the properties and functionalities of advanced functional materials. During this period in his lab, I synthesized an amount of silica foams with controlled size as monoliths and beads and did a series of characterizations (SEM; FT-IR; Hg intrusion or gas adsorption methods). Also, I managed the functionalization of these silica foams and detected the activity of immobilized enzyme. Through this collaboration, I learned more about synthesis, functionalization and activities of silica material. I would like to thank Prof. Rénal Backov, who provided me much valuable information about my project, and also thank the FrenchBIC for the grant.

 

Fangfang YANG

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Lettre ouverte à Madame la Ministre de l’Enseignement Supérieur, de la Recherche et de l’Innovation concernant les conséquences de la crise Covid19 sur les personnels et laboratoires de la recherche publique. http://frenchbic.cnrs.fr/2020/03/30/lettre-ouverte-a-madame-la-ministre-de-lenseignement-superieur-de-la-recherche-et-de-linnovation-concernant-les-consequences-de-la-crise-covid19-sur-les-personnels-et-laboratoires-d/ Mon, 30 Mar 2020 12:46:29 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=26475 Madame la Ministre, Au moment où l’urgence sanitaire justifie les strictes mesures de confinement prises par le gouvernement, et alors que la communauté scientifique s’est organisée pour lutter de la manière la plus efficace contre l’épidémie de COVID, les sociétés …

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Madame la Ministre,

Au moment où l’urgence sanitaire justifie les strictes mesures de confinement prises par le gouvernement, et alors que la communauté scientifique s’est organisée pour lutter de la manière la plus efficace contre l’épidémie de COVID, les sociétés savantes signataires approuvent vos ​annonces récentes concernant le soutien aux étudiants, ainsi que la prolongation automatique ​des titres de séjour pour une durée de 3 mois​. Les signataires recommandent une mise en oeuvre rapide de ces décisions.

Ces mesures doivent être encore étendues afin de soutenir au mieux les personnels et stagiaires de l’Enseignement Supérieur et la Recherche les plus fragiles économiquement et socialement et de permettre un redémarrage des laboratoires de recherche dans les meilleures conditions. Il est en particulier important :

  • que les contrats des personnels non fonctionnaires de l’enseignement supérieur employés comme agents vacataires dans leur établissement soient systématiquement maintenus pendant la période de fermeture des universités et que les vacations prévues soient intégralement payées. Ces mesures doivent concerner les doctorants, les autres étudiants ainsi que les personnels non étudiants de la recherche publique (Post-docs, etc.). Elles doivent aussi s’appliquer aux chargés de cours, même si le service présentiel n’a pu être assuré, ​et alors que tous les personnels s’investissent dans l’accompagnement des étudiants​.
  • que la date de dépôt des candidatures aux recrutements (PR, MCF, ATER notamment) soit repoussée significativement pour tenir compte des situations d’empêchement auxquelles sont confrontés les candidats pendant la période de confinement. Aucune date limite de dépôt ne doit être antérieure à la fin de cette période.
  • que les contrats doctoraux et les contrats de travail des personnels post-doctoraux et de soutien à la recherche soient prolongés d’une durée correspondant aux mois perdus. Ces prolongations doivent s’appliquer à l’ensemble des contrats gérés par les organismes de recherche et les établissements d’enseignement supérieur, que l’origine des fonds soit publique ou privée.
  • que les contrats de recherche des laboratoires gérés par les organismes de recherche et les établissements d’enseignement supérieur soient prolongés automatiquement d’une durée ​a minima égale à la période d’inaccessibilité des lieux où ces activités de recherche sont ordinairement exercées. Dans certaines disciplines, cette prolongation doit prendre en compte que l’arrêt des laboratoires pendant le confinement impactera l’activité de recherche sur des périodes beaucoup plus longues.
  • que des instructions soient données aux établissements d’enseignement supérieur et aux organismes de recherche pour clarifier par une décision uniforme au plan national la situation (maintien des gratifications, critères de validation) des stagiaires en laboratoires publics dont le stage a été interrompu, afin que leur année puisse être validée.

Nous vous remercions pour l’attention que vous porterez à ce courrier et vous assurons de nos sentiments respectueux.

Sociétés signataires : Association des Enseignants-Chercheurs en Psychologie des Universités, Association Française d’Ethnologie et d’Anthropologie, Association Française de Science Politique, Association Française pour l’Intelligence Artificielle, Association Française de Sociologie, Association des Germanistes de l’Enseignement Supérieur, Association des Historiens Contemporanéistes de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche, Association des Professeurs d’Archéologie et d’Histoire de l’Art des Universités, Association des Professeurs d’Histoire et Géographie, Comité National Français de Géographie, Société d’Etudes Anglo-américaines des XVIIe et XVIIIe siècles, Société Française d’Alcoologie, Société Française d’Astronomie et d’Astrophysique, Société Française de Bioinformatique, Société Française de Biologie du Développement, Société Française de Botanique, Société Française d’Ecologie et d’Evolution, Société Française de Génétique, ​Société française de Numismatique, ​Société Française de Psychologie, Société Française de Virologie, Société des Historiens Médiévistes de l’Enseignement Supérieur Public, Société Informatique de France, Société de Mathématiques Appliquées et Industrielles, Société des Professeurs d’Histoire Ancienne de l’Université, Société de Sociologie du Sport de Langue Française.

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Le groupe de chimie analytique bioinorganique (GCABI) de l’IPREM (Université de Pau et des Pays de l’Adour) rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2020/01/27/le-groupe-de-chimie-analytique-bioinorganique-gcabi-de-liprem-universite-de-pau-et-des-pays-de-ladour-rejoint-le-gis/ Mon, 27 Jan 2020 16:27:25 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=24604 Les travaux de recherche du groupe CABIE de l’IPREM portent principalement sur le développement des méthodes analytiques pour la spéciation des métaux à l’état de traces et d’ultratraces en milieu biologique. L’accent est mis sur les techniques de couplage entre …

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Les travaux de recherche du groupe CABIE de l’IPREM portent principalement sur le développement des méthodes analytiques pour la spéciation des métaux à l’état de traces et d’ultratraces en milieu biologique. L’accent est mis sur les techniques de couplage entre la chromatographie ou l’électrophorèse et la spectrométrie de masse plasma à couplage inductif (ICP) et électrospray en vue de la caractérisation du métallome (l’ensemble des métaux et de ses formes chimiques) à l’échelle de la cellule, du tissu ou de l’organisme.  Les teneurs en métaux et leur spéciation sont corrélées avec les données génomiques, protéomiques et métabolomiques pour expliquer les mécanismes par lesquels les différentes biomolécules permettent à des métaux d’accomplir ses fonctions biologiques.

Contact : Ryszard LOBINSKI

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[Project supported by FrenchBIC] Lisa ZUILY : Regulation of Zn-binding molecular chaperones by Cu, molecular insights? http://frenchbic.cnrs.fr/2020/01/21/project-supported-by-frenchbic-lisa-zuily-regulation-of-zn-binding-molecular-chaperones-by-cu-molecular-insights/ Tue, 21 Jan 2020 16:11:03 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=24449 Lisa ZUILY, from the Institut de Microbiologie de la Méditerranée (laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines), spent two weeks in the lab of Dr. Olivier Sénèque, from the Laboratoire Chimie et Biologie des Métaux (CEA-Grenoble). This project was supported by …

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Lisa ZUILY, from the Institut de Microbiologie de la Méditerranée (laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des Protéines), spent two weeks in the lab of Dr. Olivier Sénèque, from the Laboratoire Chimie et Biologie des Métaux (CEA-Grenoble). This project was supported by a grant from FrenchBIC.

During my Ph.D. I have been exploring the impact of copper, a very powerful antimicrobial reagent, on proteostasis and the role played by molecular chaperone during copper stress. I specially focused on a redox-regulated holdase chaperone : Hsp33. Hsp33 activation is regulated by a zinc center, in which the Zn2+ ion is coordinated by four highly conserved cysteines. Upon oxidative and unfolding stress (e.g., H2O2 and heat), these conserved cysteines form 2 disulfide bonds and zinc is released. This event and the unfolding of the C-terminal region of Hsp33’s allow the exposure of substrate binding site. In presence of copper, Hsp33 can also be activated without the requirement of a thermal stress. To decipher how copper triggers the chaperone activity of Hsp33 at a molecular level, I spent two weeks in O. Sénèque laboratory in Grenoble who has strong expertise on metalloproteins zinc sites reactivity and has access to various spectroscopy approaches : UV absorption, fluorescence and CD. These technics were used to monitor Hsp33 Zn release, Cu binding and changes in the folding of the protein. I would like to acknowledge the FrenchBIC for the grant and Dr. Sénèque, for this great opportunity. Being in his lab was a great experience that taught me a lot.

Lisa ZUILY 

Publication : “Copper Induces Protein Aggregation, a Toxic Process Compensated by Molecular Chaperones”, mBio, 2022 10.1128/mbio.03251-21

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L’équipe “Imagerie Chimique et Spéciation” du Centre Etudes Nucléaires de Bordeaux Gradignan rejoint le GIS http://frenchbic.cnrs.fr/2020/01/17/lequipe-imagerie-chimique-et-speciation-du-centre-etudes-nucleaires-de-bordeaux-gradignan-rejoint-le-gis/ Fri, 17 Jan 2020 18:58:24 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=24308 Les objectifs de l’équipe ICS Imagerie Chimique et Spéciation du CENBG (UMR5797, CNRS, Université de Bordeaux) sont de comprendre les effets neurobiologiques et neurotoxiques des éléments chimiques, stables ou radioactifs, au moyen de techniques d’imagerie et de spéciation par faisceaux …

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Les objectifs de l’équipe ICS Imagerie Chimique et Spéciation du CENBG (UMR5797, CNRS, Université de Bordeaux) sont de comprendre les effets neurobiologiques et neurotoxiques des éléments chimiques, stables ou radioactifs, au moyen de techniques d’imagerie et de spéciation par faisceaux d’ions ou de rayonnement synchrotron. L’imagerie à très haute résolution spatiale est réalisée par nano-SXRF (Synchrotron X-Ray Fluorescence), la spéciation chimique par micro-spectroscopie d’absorption de rayons X (XAS). Nous avons développé des protocoles d’imagerie corrélative pour comparer la distribution des éléments avec celle de protéines ou d’organites cellulaires. Les résultats obtenus ont permis de révéler par exemple un rôle nouveau des vésicules dopaminergiques dans le stockage du fer, de l’appareil de Golgi dans la détoxification du manganèse, deux éléments chimiques impliqués dans l’étiologie de la maladie de Parkinson, ou encore de déterminer les états d’oxydation des métaux à l’échelle des organites cellulaires pour mieux comprendre leurs mécanismes de toxicité. Nous avons également montré l’interaction physiologique du zinc et du cuivre avec les protéines du cytosquelette dendritique de neurones d’hippocampe et son implication possible dans les processus de mémorisation.

Personnel permanent impliqué : Richard Ortega, DR, CNRS ; Asuncion Carmona, CR, CNRS ; Stéphane Roudeau, IR, CNRS.

Contact : Richard Ortega

Quelques références récentes :

  • Carmona A., Roudeau S., Perrin L., Carcenac C., Vantelon D., Savasta M., Ortega R. (2019) Mapping chemical elements and iron oxidation states in the substantia nigra of 6-hydroxydopamine lesioned rats using correlative immunohistochemistry with proton and synchrotron micro-analysis. Frontiers in Neuroscience, 13:1014.
  • Carmona A., Zogzas C.E., Roudeau S., Porcaro F., Garrevoet J., Spiers K., Salome M., Cloetens P., Mukhopadhyay S., Ortega R. (2019) SLC30A10 mutation involved in parkinsonism results in manganese accumulation within nano-vesicles of the Golgi apparatus. ACS Chemical Neuroscience, 10, 599-609.
  • Carmona A., Malard V., Avazeri E., Roudeau S., Porcaro F., Paredes E., Vidaud C., Bresson C., Ortega R. (2018) Uranium exposure of human dopaminergic cells results in low cytotoxicity, accumulation within sub-cytoplasmic regions, and down regulation of MAO-B. NeuroToxicology, 68, 177-188.
  • Porcaro F., Roudeau S., Carmona A., Ortega R. (2018) Advances in element speciation analysis of biomedical samples using synchrotron-based techniques. Trends in Analytical Chemistry, 104, 22-41.
  • Perrin L., Roudeau S., Carmona A., Domart F., Petersen J.D., Bohic S., Yang Y., Cloetens P., Ortega R. (2017) Zinc and copper effects on stability of tubulin and actin networks in dendrites and spines of hippocampal neurons. ACS Chemical Neuroscience, 8, 1490-1499.
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Bilan de l’école thématique METBIO 2019 http://frenchbic.cnrs.fr/2019/12/11/bilan-de-lecole-thematique-metbio-2019/ Wed, 11 Dec 2019 16:21:14 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=22858 Ecole thématique organisée par le GIS FrenhBIC et soutenue par la formation permanente du CNRS Lieu: Carry le Rouet et Marseille (13) Dates: 6/10/19-11/10/19 Programme, photos et remises des prix. Cette école était organisée sous l’égide du GIS “Groupe Français …

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Ecole thématique organisée par le GIS FrenhBIC et soutenue par la formation permanente du CNRS

Lieu: Carry le Rouet et Marseille (13)

Dates: 6/10/19-11/10/19

Programme, photos et remises des prix.

Cette école était organisée sous l’égide du GIS “Groupe Français de Chimie Bioinorganique” (FrenchBic) qui regroupe environ 50 équipes de 25 laboratoires répartis sur l’ensemble du territoire français. Les objectifs étaient de former les jeunes chercheurs ou chercheurs confirmés à des techniques de pointe interdisciplinaires pour l’étude des métaux en biologie. Cette école avait donc pour but d’amener les participants à nouer des liens créer des interactions avec les enseignants et entre eux. Cette école avait également pour objectif d’amener les participants à un niveau de compétence leur permettant de profiter pleinement des plateformes techniques françaises, ainsi que des grandes infrastructures européennes. Elle est également une étape pour redynamiser l’enseignement de la chimie bioinorganique au niveau national et aboutir à terme à l’organisation d’écoles européennes.

Nous avons reçu près de 60 candidatures et sélectionné 44 personnes pour participer à l’école. Les personnes provenaient pour moitié environ de laboratoires français (Grenoble, Paris, Marseille, Orléans, Nancy), l’autre moitié appartenaient à des laboratoires étrangers (Royaume Uni, Allemagne, Italie, Suède, Norvège, Russie, Pologne, Sénégal). Tous les cours et travaux pratiques (TPs) ont été assurés en anglais et d’après les évaluations, cela n’a posé aucun problème.

La moyenne d’âge des participant·e·s est de 27 ans. La plupart des participant·e·s sont des étudiant·e·s en thèse mais 4 post-doctorant.e.s et 10 chercheur·e·s /enseignant·e·s en poste (dont 2 étrangers) ont également participé. 10 professeur·e·s (français et étrangers) sont intervenus pour donner les cours. Ces professeurs provenaient des organismes français (universités, CNRS, Institut Curie, CEA) et étrangers (Allemagne, Angleterre).

L’école, organisée à Carry le Rouet et Marseille, a débuté le dimanche 06/10/19 au soir et les participants sont partis le vendredi 11/10/2019 au matin. L’école a commencé par une conférence d’introduction le dimanche soir après dîner. Les lundi et mardi ont été consacrés aux cours théoriques de 1h30-2h et les techniques suivantes ont été abordées : RPE, RMN, Mössbauer, évolutions récentes in cell, cryo electron microscopy, cristallographie des protéines, imagerie des métaux en milieux complexes, chimie théorique, spectroscopie vibrationnelle. Ces cours ont été complétés par 4 demi-journées de TPs les mercredi et jeudi (par groupes de 5-6 élèves) dont 3 TPs obligatoires (RPE, RME, électrochimie) et un à choisir dans la liste proposée (Imaging, DFT, Stopped flow, cristallographie).

Les participant·e·s ont présenté leurs travaux au cours d’une séance de présentations flash (3 minutes par personne) et d’une séance de présentations par affiches. Ces présentations ont été récompensées par trois prix(décernés par le FrenchBic) attribués par les enseignant·e·s.

Synthèse de l’évaluation à chaud :

Aspect scientifiques
  • L’unanimité des participants a trouvé que le programme proposé était en adéquation avec les objectifs de l’ école
  • La majorité des élèves a apprécié le niveau des cours et les ont trouvé excellents (36,8%), très bon (50%) et bon (10,5%). Une personne a trouvé les cours non adaptés. Cela est difficilement évitable compte tenu de la diversité du niveau des participants.
  • Les étudiant·e·s plébiscitent les TPs en petits groupes qui permettent de clarifier les cours, de se familiariser avec le matériel et de poser des questions aux profs.
  • 92% des participants.e.s disent avoir eu des discussions professionnelles avec les enseignant.e.s ou les autres participant.e.s et 25% pensent que ces discussions vont aboutir à des collaborations.
  • Quelques élèves ont trouvé le programme trop dense
  • Certains participants auraient souhaité plus de sessions pratiques
  • La majorité des participants sont en faveur d’une continuation de cette école
Points positifs :
  • Les objectifs en termes de “mise à niveau” ou d’introduction aux techniques sont atteints pour la majorité des élèves
  • La combinaison cours/TPs, la réalisation des TPs en très petits groupes
  • Les sessions posters et communications flashs
  • La mobilisation importante des enseignant·e·s qui sont restés qui sont pour la plupart (sauf 2) pendant toute la durée de la session théorique.
Points à améliorer :
  • Rajouter des sessions pratiques (ce qui peut poser des problèmes de budget)
  • Elargir les illustrations des champs d’application des techniques (chromatographie etc.)
  • Mieux définir les pré-requis pour l’école (demandé par env. 18% des participant.e.s et enseignant.e.s). Nous n’avions pas défini de pré-requis pour ne pas limiter la participation à l’école d’étudiants provenant de plusieurs champs disciplinaires. Cela a inévitablement induit des différences de niveau entre participant.e.s.
  • Rajouter un TP de Mössbauer (un peu difficile à organiser mais à réfléchir pour une prochaine édition)
  • Rallonger les sessions posters

Aspects organisationnels

Points positifs :
  • Les échanges entre participant.e.s et professeur.e.s qui ont été regroupés sur un même lieu pendant plusieurs jours
  • La combinaison théorie et pratique
  • Les infrastructures du centre vacanciel
Points à améliorer :
  • les transferts entre le centre vacanciel et les laboratoires de Marseille pour les TPs (nous avons eu des problèmes de traffic). Ce point sera difficile à améliorer. Nous envisageons de décaler les horaires pour éviter les bouchons.
Suite envisagée

Le directoire du FrenchBic souhaite reconduire une école thématique pour compléter les techniques abordées.

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Poster prizes to Heike Meyer, Amanda Lyn Robinson and Martha Zoumpoulaki, during the FrenchBIC 2019 summer school http://frenchbic.cnrs.fr/2019/10/22/poster-prizes-heike-meyer-amanda-lyn-robinson-martha-zoumpoulaki-during-the-frenchbic-2019-summer-school/ Tue, 22 Oct 2019 08:00:13 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=20265 Heike Meyer finished her Master studies in 2018 at the Institute of Biology of the Albert-Ludwigs-University in Freiburg (Germany) with the main focus on microbiology and biochemistry. This February she started her PhD in the group of Prof. Dr. Gunhild …

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  • Heike Meyer finished her Master studies in 2018 at the Institute of Biology of the Albert-Ludwigs-University in Freiburg (Germany) with the main focus on microbiology and biochemistry. This February she started her PhD in the group of Prof. Dr. Gunhild Layer at the Institute of Pharmaceutical Sciences of the University of Freiburg. She presented her work on the functional characterization of the Radical SAM enzyme NirJ, which is involved in heme d 1 biosynthesis. Heme d 1 , a tetrapyrrole with a central iron ion, contains two unusual keto groups at rings A and B. It occurs as one of the cofactors of the dissimilatory cytochrome cd 1 nitrite reductase NirS. Its biosynthesis was elucidated in recent years, except the chemically challenging introduction of both keto groups. The Radical SAM enzyme NirJ might be a possible candidate for this particular reaction. NirJ catalyzes the removal of the two propionate side chains at rings A and B. However, it is unknown whether NirJ is also responsible for the subsequent introduction of the two carbonyl groups. The presented work provided insight in the functional characterization of NirJ, as well as the challenges which needed to be overcome under anaerobic conditions. Reference: The Radical SAM enzyme NirJ catalyzes the removal of two propionate side chains during heme d 1 biosynthesis, L. Boss, R. Oehme, S. Billig, C. Birkemeyer, G. Layer, The FEBS Journal 2017, 284, 4314–4327.
  • Amanda Lyn Robinson obtained her MS degree in chemistry with a focus on biomolecular chemsitry as part of the Frontiers in Chemistry (FrInCh) program, shared between Paris Descartes and Paris Diderot Universities. She is now a PhD student at Paris Sud University, working under the supervision of Dr. Jean-Noël Rebilly and Pr. Frédéric Banse in the Laboratoire de Chimie Inorganique (LCI) at the Institut de Chimie Moléculaire et des Matériaux d’Orsay (ICMMO). Her main research interests include biomimetic chemistry and small molecule activation. At the French BIC Met Bio summer school, she presented her initial results in a work entitled “A New Iron Complex with a Smart Second Coordination Sphere for Bioinspired Oxidation Catalysis.” These results were the first part of an ongoing investigation of a novel iron complex that mimics key aspects of the cytochrome P450 enzyme.
  • Martha Zoumpoulaki got her MS degree in Molecular Chemistry and Chemical Biology at Sorbonne Université in 2017 (M2 Chimie Moléculaire Program), in parallel with the diploma of the Ecole Normale Supérieure of Paris with a major in chemistry and a minor in theatre studies. She is now a PhD student in Laboratoire des Biomolecules (LBM) and her fellowship is funded by the ANR. She works with Clotilde Policar and Nicolas Delsuc at Laboratoire des Biomolecules (LBM) in collaboration with Joelle Vinh at the Biological Mass Spectrometry and Proteomics lab (SMBP) at the ESPCI. She presented her work entitled: Quantifying the cellular redoxome: Effect of a MnSOD mimic, a potential metallodrug against Inflammatory Bowel Diseases. A Mn-complex with a superoxide dismutase activity (Mn1) was studied in a cellular model of oxidative stress and inflammation. It was previously shown to have an intracellular anti-superoxide and anti-inflammatory activity 1 . This work describes the use of a metabolic labeling strategy to quantify the effect of Mn1 on the expression levels of proteins and the redox state of cysteines using LC-MS/MS.  Mathieu E. et al., Inorg. Chem 2017, 56, 5, 2555
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2019 FrenchBIC summer school — Image Gallery http://frenchbic.cnrs.fr/2019/10/07/2019-frenchbic-summer-school-image-gallery/ Mon, 07 Oct 2019 11:39:16 +0000 http://frenchbic.cnrs.fr/?p=19728 All participants of the 2019 summer school in Carry le Rouet and Marseille.

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All participants of the 2019 summer school in Carry le Rouet and Marseille.